Minimal reference phylogeny for the human Y chromosome: subtree R-M207
Citation: van Oven M, Van Geystelen A, Kayser M, Decorte R, Larmuseau MH. 2014. Seeing the wood for the trees: a minimal reference phylogeny for the human Y chromosome. Hum Mutat 35(2):187-191.
Full Y-SNP list with marker details
up to main tree                                   Haplogroup designation  
R  M207                                   R-M207*(xM173,M479)  
  R1  M173  M306                               R-M173*(xM420,M343)  
    R1a  M420                               R-M420*(xM448)  
         M448                             R-M448*(xM17)  
           M17  M198                           R-M17*(xM417)  
             M417                         R-M417*(xCTS4385,Z645)  
               CTS4385                       R-CTS4385*(xS3485,S11345,S2894)  
                 S3485                     R-S3485  
                 S11345  S2863                   R-S11345  
                 S2894                     R-S2894  
               Z645  Z647                       R-Z645*(xZ283,Z93)  
                 Z283                     R-Z283*(xM458,Z91,Z284)  
                   M458                   R-M458*(xL260,CTS11962)  
                     L260                 R-L260  
                     CTS11962                 R-CTS11962  
                   Z91                     R-Z91*(xZ92,M558)  
                     Z92                   R-Z92  
                     M558  CTS1211               R-M558*(xCTS3402)  
                       CTS3402               R-CTS3402*(xL365)  
                         L365             R-L365  
                   Z284                   R-Z284*(xL448,Z287)  
                     L448                 R-L448  
                     Z287  Z288                 R-Z287  
                 Z93                       R-Z93*(xZ94)  
                   Z94  Z95                   R-Z94*(xY40,L657,Z2124)  
                     Y40                   R-Y40  
                     L657  M780               R-L657*(xY4,Y9)  
                       Y4                 R-Y4  
                       Y9                 R-Y9  
                     Z2124                 R-Z2124*(xZ2122,Z2125)  
                       Z2122               R-Z2122*(xM582)  
                         M582  CTS6           R-M582  
                       Z2125               R-Z2125  
    R1b  M343  M415                             R-M343*(xPH1165,L754)  
         PH1165                             R-PH1165  
         L754                             R-L754*(xV88,L389)  
           V88                             R-V88*(xPF7545)  
             PF7545                         R-PF7545*(xY7771)  
               Y7771                       R-Y7771  
           L389                           R-L389*(xP279)  
             P297                         R-P297*(xM73,M269)  
               M73  M478                       R-M73  
               M269  M520                     R-M269*(xL23)  
                 L23  L757                     R-L23*(xZ2103,M412)  
                   Z2103  Z2105                 R-Z2103  
                   M412                   R-M412*(xL11)  
                     L11  L52  P310  P311             R-L11*(xU106,P312)  
                       U106               R-U106*(xZ8057,Z18,Z381,FGC396)  
                         Z8057             R-Z8057  
                         Z18               R-Z18  
                         Z381             R-Z381*(xZ156,Z301)  
                           Z156           R-Z156  
                           Z301           R-Z301*(xU198,L48)  
                             U198         R-U198  
                             L48           R-L48*(xL47,Z9)  
                               L47         R-L47  
                               Z9         R-Z9*(xZ30,Z331)  
                                 Z30       R-Z30  
                                 Z331     R-Z331  
                         FGC396             R-FGC396  
                       P312               R-P312*(xL238,DF19,DF99,DF27,U152,M529)  
                         L238             R-L238  
                         DF19             R-DF19  
                         DF99             R-DF99  
                         DF27             R-DF27*(xZ225,Z2552,Z2557,Z2560,Z31644,Z34609,Z195)  
                           Z225  Z229           R-Z225  
                           Z2552           R-Z2552  
                           Z2557           R-Z2557  
                           Z2560           R-Z2560  
                           Z31644           R-Z31644  
                           Z34609           R-Z34609  
                           Z195  Z196           R-Z195*(xZ274,Z198)  
                             Z274  Z272         R-Z274*(xZ209,DF17)  
                               Z209  Z220       R-Z209*(xZ216,CTS4065)  
                                 Z216     R-Z216*(xZ214)  
                                   Z214   R-Z214  
                                 CTS4065     R-CTS4065  
                               DF17       R-DF17  
                             Z198         R-Z198*(xZ262)  
                               Z262       R-Z262  
                         U152             R-U152*(xL2,Z36,Z56,Z192)  
                           L2             R-L2*(xZ367,Z49)  
                             Z367         R-Z367*(xL20,Z34)  
                               L20         R-L20  
                               Z34         R-Z34  
                             Z49           R-Z49*(xZ142)  
                               Z142       R-Z142  
                           Z36             R-Z36  
                           Z56             R-Z56*(xS47,Z144)  
                             S47           R-S47  
                             Z144  Z145  Z146       R-Z144  
                           Z192           R-Z192  
                         M529             R-M529*(xDF63,DF13)  
                           DF63           R-DF63  
                           DF13  Z2542         R-DF13*(xDF21,DF41,DF49,L513,L1335,Z251,Z253,Z255,Y3550)  
                             DF21         R-DF21*(xP314,Z246,S3058)  
                               P314       R-P314  
                               Z246       R-Z246  
                               S3058       R-S3058  
                             DF41         R-DF41  
                             DF49         R-DF49*(xDF23)  
                               DF23       R-DF23*(xZ2961)  
                                 Z2961     R-Z2961*(xM222)  
                                   M222   R-M222  
                             L513  Z249         R-L513  
                             L1335         R-L1335  
                             Z251           R-Z251  
                             Z253           R-Z253*(xZ2534)  
                               Z2534       R-Z2534  
                             Z255         R-Z255  
                             Y3550         R-Y3550  
  R2  M479                                 R-M479*(xM124)  
       M124                               R-M124*(xL295)  
         L295                             R-L295*(xY1280,Y1332)  
           Y1280  Y1285                         R-Y1280  
           Y1332  Y1336                         R-Y1332