- mtDNA tree Build 17 (18 Feb 2016): subtree L0
Citation: van Oven M, Kayser M. 2009. Updated comprehensive phylogenetic tree of global human mitochondrial DNA variation. Hum Mutat 30(2):E386-E394.
Nucleotide position numbers are consistent with both the rCRS and the RSRS reference sequences.
Mutations are given in forward evolutionary time direction in the format [ancestral base][position number][derived base], e.g. "G15043A".
In case of a transversion, the derived allele is shown in lowercase instead of uppercase, e.g. "C5178a".
Insertions are indicated by the position number preceding the insertion followed by a dot (.), the relative insert position, and the inserted base(s), e.g. "2156.1A".
Deletions are indicated by the letter "d" following the (range of) position number(s) involved, e.g. "A249d" or "8281-8289d".
Mutations that are reversions to an ancestral state (back mutations) are indicated with an exclamation mark (!), two exclamation marks for a double back mutation (!!), etc., e.g. "A15301G!".
Coding-region mutations (np 577-16023) are shown in black; control-region mutations (np 16024-576) in blue.
Mutations between brackets () are recurrent/unstable within the respective clade, or are yet uncertain based on current data.
Mutation motifs in italic are preliminary and are likely to be further refined as additional sequences become available.
The mutations 309.1C(C), 315.1C, AC indels at 515-522, A16182c, A16183c, 16193.1C(C) and C16519T/T16519C were not considered for phylogenetic reconstruction and are therefore excluded from the tree.
Accession numbers provided at the tips of branches are representative examples of mtDNA sequences available at GenBank or from individuals included in HapMap/1000Genomes.
It may be convenient to use the Find function (Ctrl+F) of your browser to search for a particular mutation or haplogroup.
                                                  Example accessions
 mt-MRCA (RSRS)                                              
L1'2'3'4'5'6  C146T  C182T  T4312C  T10664C  C10915T  A11914G  G13276A  G16230A                                   
  L2'3'4'5'6  C152T  A2758G  C2885T  G7146A  T8468C                                       
    L2'3'4'6  C195T  A247G  A825t  T8655C  A10688G  C10810T  G13105A  T13506C  G15301A  A16129G  T16187C  C16189T                           
      L3'4'6  G4104A  A7521G                                       
        L3'4  T182C!  T3594C  T7256C  T13650C  T16278C                                 
          L3  A769G  A1018G  C16311T                                 
            N  G8701A  C9540T  G10398A  C10873T  A15301G!                             
              R  T12705C  T16223C                               
                R0  G73A  A11719G                             
                  HV  T14766C                             
                    H  G2706A  T7028C                         
                      H2  G1438A                         
                        H2a  G4769A                       
                          H2a2  G750A                     
                            H2a2a  G8860A  G15326A                 
                              H2a2a1  G263A                  rCRS
L0  G263A  C1048T  C3516a  T5442C  T6185C  C9042T  A9347G  G10589A  G12007A  A12720G                                 
  L0a'b'f'g'k  A189G  T4586C  C9818T  T16172C                                         
    L0a'b'f'g  G73A  G185A  C195T  A263G!  A2245G  C5603T  A11641G  C15136T  G15431A                               
      L0a'b'g  A93G  (A95c)  T236C  C8428T  A8566G  G9755A  C16148T                                 
        L0a'g  G11176A  C16188g                                     
          L0a  C146T  G5231A  G5460A  T14308C  T16278C  C16320T                             
            L0a1'4  C16168T                                   
              L0a1  T5096C                                 
                L0a1a  (C64T)  T3866C                              EU092665 EU092764
                     A200G                              NA19311 EU092763
                    L0a1a1  T2759C                            EU092714 JQ044893
                    L0a1a2  C152T  G2245c                          JX303911 DQ304901
                    L0a1a3  A9181G                            JQ044943
                  L0a1b  C5911T  A14007G  C16278T!                         
                    L0a1b1  C152T  A8191G                          KJ669116 AF381988
                      L0a1b1a  G12127A                          EU935434 NA19703
                        L0a1b1a1  T961C                        EU092688 KC533498
                          L0a1b1a1a  T11017C  C15381T                    NA19449 KJ669120
                    L0a1b2  G5563A  T14106C  T16093C                        DQ304897
                      L0a1b2a  T15099C                          EU092746 EF657743
                  L0a1c  G14569A                              NA19440
                    L0a1c1  A8188G  A16129G  C16287T                        EU092945 NA19467
                  L0a1d  C553T  C12557T  T16320C!                          EU092801 EU092809
                L0a1e  C152T  G5147A  C5608T  T7568C  T16168C!                          JX303766
              L0a4  C152T  T2887C  G3010A  C5060T  G7830A  G8545A  T8870C  A11380G  T11809C  A12780G  A14001G  C14142T  C16192T  C16234T  C16259a  G16319A          EU092906
            L0a2  C64T  A185G!  G5147A  A5711G  G6257A  8281-8289d  A8460G  A11172G  A16129G                       
              L0a2a  C11143T  A14755G                               
                L0a2a1  T14182C                                HM771161
                  L0a2a1a  T4598C                             
                    L0a2a1a1  C8264T  G9178A                          DQ112686 DQ112688
                    L0a2a1a2  A7424G  G15617A                          EU092911 EU092868
                  L0a2a1b  G3834A  A5558G                            JX303784 EU092861
                L0a2a2  T204C  G207A  A9545G  G9554A                            FJ157838
                  L0a2a2a  C13116T                              EU092787 JX303763
                    L0a2a2a1  G8701A  G14905A                          JX303835 KJ669122
                    L0a2a2a2  A9734t                            JX303786 KJ669113
              L0a2b  C152T  G189A!  T3372C  G5237A  C11269T  A12172G  T13281C  G16188A  C16242T  G16390A                    EU597537 HM771190
                L0a2b1  G1598A                                HM771200 HM771188
              L0a2c  C194T  G3693A  C3738T  A4012G  A8389G  T11009C  G11887A  C13984T  G14560A  G16188A  C16214T  C16234T  T16320C!              EF556174
              L0a2d  A5581G  G15317A                                EU092913 D38112
            L0a3  T14581C                                    EU092900 NA19039
          L0g  T195C!  C198T  T204C  G207A  G499A  G1415A  A4466G  C4814T  A4943G  C5141T  T5603C!  A5656G  T5782C  T8047C  A8224G  A10039G  G10427A  G12528A  T12705C  C13431T  C13767a  A14002G  T14110C  G15803A  C16169T  KJ669112
        L0b  T6719C  G15106A  T15622C  A16051G  A16164G  T16187C                                EU092936 NA19031
      L0f  (G207A)  C4964T  T7148C  T9581C  C9620T  A13470G  C14109T  C14620T  T15852C  C16169T  C16327T  T16368C                         
        L0f1  C146T  C151T  A7364G  T16187C  C16354T                                  EU092870 NA19454
        L0f2  C4194T  T11287C  C13680T  G13928c                                 
          L0f2a  G1719A  A4562G  T10790C                                  EU092964
            L0f2a1  G143A  A978G  C2772T  C2789T  C3852T  C5321T  G10143A  T11299C  G12720A!  G13708A  C16173T  C16239T                    AY963585 EU092668
          L0f2b  C152T  A183G  G184A  A783G  T3027C  G3531A  G3592A  T6152C  T6176C  G7419A  G8020A  C8748T  T9725C  A11974G  A12855G  G13145A  G13317A  A14683G  G15884A  G15927A  A16129G  C16218T  C16291T  C16354T    EU092786
    L0k  T199C  T850C  T1243C  G4541A  T4907C  A5811G  A7257G  T8911C  C8922T  G8994A  A9136G  A10499G  A10876G  C10920T  C11296T  T11299C  A11653G  G13590A  T13819C  G13928c  T14020C  T14182C  T14371C  T14374C  A16129G  A16166c  C16214T  C16291g   
      L0k1  C2836a  C6938T  T16209C                                     
        L0k1a  C198T  C199T!  C10939T  G12070A  G12720A!  T13020C                               
          L0k1a1  G207A  T8922C!                                    KC345899 EU092837
            L0k1a1a  T204C  G8251A                                  EU092966 KJ669107
            L0k1a1b  G14569A                                    KC346024 KJ669111
            L0k1a1c  A2060G                                    KC346108 AF347009
            L0k1a1d  A5582G                                    KC345966 KC346048
          L0k1a2  T8222C                                      EU092855 KC346083
            L0k1a2a  A10978G                                    KC346199 KJ669103
          L0k1a3  G16129A!  C16242T  A16269G  G16274A                                KC346073 KC345982
        L0k1b  T593C  T3777C  T10321C  G14364A  T15721C  G15884A                                JX303865 KC346241
      L0k2  T204C  G9347A!  C9884T  G15221A  T16223C  G16291A                                 
        L0k2a  A4012G  G9136A!  T15299C  C16527T                                  KC346233
          L0k2a1  A16171G                                      KC345922
            L0k2a1a  G8838A  A11893G  C16360T                                JX303895 JX303765
        L0k2b  C16287T                                        EU092792 KC346242
  L0d  G1438A  T4232C  T6815C  C8113a  G8152A  G8251A  T12121C  G15466A  G15930A  T15941C  T16243C                             
    L0d1'2  C498d  A3756G  G9755A  T16278C                                       
      L0d1  G719A  G2706A  G3438A  A6266G  G13759A                                   
        L0d1a'c'd  C16234T                                       
          L0d1a'd  C152T  T16223C                                   
            L0d1a  T1243C  T9950C  A12142G  C16266g                                KC345791
              L0d1a1  T199C  C12798T  (G16266A)                             
                L0d1a1a  T7389C  T12696C                              KJ669142 KC346226
                  L0d1a1a1  C199T!                              EU597514 KC345831
                  L0d1a1a2  T318C                              KC346102 KJ669143
                  L0d1a1a3  A14750G                              EU092863 KC346227
                L0d1a1b  C13855T  C13967T                              EU092833
                  L0d1a1b1  A153G  T16209C                           
                    L0d1a1b1a  A10319G                            KC345969 KC345775
                    L0d1a1b1b  C14953T                            KJ669141 KC533478
                L0d1a1c  T152C!  C195T  G1719A  T7283C  T10237C  A15924G                        KC346092 KC533497
                L0d1a1d  G3849A  T8793C                              KJ669138 KC533487
            L0d1d  2491.1C  T4688C  C5104T  C8270T  G11447A  G11611A  T13506C  G14560A  C15459T  A16129G  T16172C  T16187C  C16218T                KJ669137
          L0d1c  C456T  C4197T  A9150G  T11437C  T12235C  C13129T  A15951G  A16129G                            KC345764
            L0d1c1  C15550T  C16242T                                  KC345920
              L0d1c1a  A7828G  G9438A                                KC346144 KC533490
                L0d1c1a1  C198T  C16167T                              KC345933
                  L0d1c1a1a  G3666A                              KC345934 EU092856
                    L0d1c1a1a1  T294C  G5460A  G15731A                        KC345835 KC345860
                    L0d1c1a1a2  C9105T                            KC346231 KC346026
                  L0d1c1a1b  C7967T                              EU092832 KC346101
                L0d1c1a2  C114a  G5460A  A13203G                              KC345824 KC345854
            L0d1c2  C16294g                                    KC346238 KC346183
              L0d1c2a  A200G  A6929G  C16256T  G16294A                              KC345852
                L0d1c2a1  A9180G  T12609a  T15470C  G16274A                            KC346081 KC346015
            L0d1c3  T265C  G3591A  T15519C  T16093C                                KC345944 EU092831
        L0d1b  T3618C                                       
          L0d1b1  A188G  2484.1C  A4562c  G10398A  C16179T                               
            L0d1b1a  G3531A  G8027A  T10707g  G15217A  T15479C                              KC346074
              L0d1b1a1  G15314A                                  KC345788 KC345918
            L0d1b1b  A11341G                                    KJ669135
              L0d1b1b1  T204C  G207A  T16140C  A16293G                              KC346235 KC345768
               C152T                                    KC345780
              L0d1b1c  A731G  T2285C  A2758G  T2882C  G11016A  G16390t                          KC346236 KC346234
          L0d1b2  T7283C  C14315T  C14659T  C16294T                               
            L0d1b2a  A6692G  G8790A  A14280G  G14560A  T15449C  G16153A  (G16474t)                         
              L0d1b2a1  T9887C                                  KC346152 KJ669149
              L0d1b2a2  A2951G  T8388C  A13062G                              JX303818 KC345902
            L0d1b2b  C16239T                                   
              L0d1b2b1  T9111C  C10920T                               
                L0d1b2b1a  C957T  G5460A  T8715C  C8970T  T11087C  C12303T  C14211T  G15106A                      KC345900 KC345949
                L0d1b2b1b  G6383A  C12436T  C15337T                            KC345923 KC346138
                  L0d1b2b1b1  T10084C                              KJ669153 KJ669150
              L0d1b2b2  573.XC  T8383C  A15692G  G16230A                              KC345781
                L0d1b2b2a  T2887C                                KC345809 KJ669145
                L0d1b2b2b  T15697C                                KC345977
                  L0d1b2b2b1  G12501A  C16218T                            KC346163 EU597502
                L0d1b2b2c  T5029C                               
                  L0d1b2b2c1  T8937C                              KC345901 KC346139
                  L0d1b2b2c2  G3666A  C12816T  T16157C                          KC345873 KC346093
      L0d2  A3981G  C4025T  A4044G  A7154G  T11854C  A15766G                                 
        L0d2a'b'd  A16212G                                       
          L0d2a  A5153G  A12172G  T14221C  G16390A                               
            L0d2a1  C198T  C597T  A4225G  G8392A  A12234G  A12810G                            EU092700 KC533481
              L0d2a1a  G8545A                                  KC346211 KC533486
                L0d2a1a1  A2072G                                KC346061 KC345989
                  L0d2a1a1a  C16292T                              KC345865 KC345993
                L0d2a1a2  T4896C                                KJ669171 KJ669175
                L0d2a1a3  T16172C                                KC346221 KJ669169
              L0d2a1b  C463T  T7861C  T16187C                                KC345990 KC533477
              L0d2a1c  T2609C  A2623G  T9656C  G11150A                              KC346197 KC346044
            L0d2a2  A93G  A95c  A3105G  T3290C  A4574G  C7412T  C16256T  A16289G                          KC345910 KC346240
          L0d2b  C152T  T1386C  G9932A  T10084C  C16069T  C16169T                             
            L0d2b1  T265C  G4769A  A5515G  G8865A  G8994A  T13386C  C14770T  T16126C  T16187C  A16258c  C16291T                   
              L0d2b1a  G709A  G3756A!                                KC346207
                L0d2b1a1  A8563G  C9776T                              JX303903
                  L0d2b1a1a  G15596A                              KC345848 KC345912
              L0d2b1b  G13466c  T14302C  A14693G  T15944d                              KC346147 KC346167
            L0d2b2  T794C  G5054A  T13768C  T14326C                                EU092840 JX303788
          L0d2d  T125C  T127C  C150T  A188G  G5147A  G5231A  T6776C  C8434T  A9254G  A9476G  C10745T  T14094C  G15884A  G16390t                    KJ669167 KC345891
        L0d2c  T294a  A4038G  T4204C  T4937C  C6644T  C8284T  A8420G  T9230C  G9305A  A11974G  A13827G  A14007G  G15346A                     
          L0d2c1  G6249A                                      EU092708 KC346104
            L0d2c1a  C4052T  A4395G  5899.XC                                KC346086 KJ669159
              L0d2c1a1  G930A  T2483C  C6134T  G9554A                              KC346206 EU092845
            L0d2c1b  C12562T  A16482G                                  KC346131 KC345892
          L0d2c2  G94A  C152T  A8725G  G8860A  A9531G  G10373A                              KC346146 KJ669161
            L0d2c2a  T4646C                                    KC346217
              L0d2c2a1  A12234G                                  KJ669164
                L0d2c2a1a  A14693G  T15541C                              KC346053 KC346052
            L0d2c2b  A9072G  T9090a                                  KC346218 KJ669162
    L0d3  C150T  G316A  T721C  T1243C  A2755G  G5460A  G5773A  C6377T  A8459G  T8598C  C9027T  C9488T  C11061T  G13359A  A15236G  T15312C  C16290T  A16300G                 
      L0d3a  A11653G  T15461C  T15586C  A16399G                                    EU092921 EF184587
      L0d3b  C152T  C6170T  G7119A  G8290A  T10114C  C10128a  A16129G  G16274A                                KC533475
        L0d3b1  A12978G                                        EU092842 KC346229
        L0d3b2  T6152C                                        KC345931 KC346224