- mtDNA tree Build 17 (18 Feb 2016): subtree L4
Citation: van Oven M, Kayser M. 2009. Updated comprehensive phylogenetic tree of global human mitochondrial DNA variation. Hum Mutat 30(2):E386-E394.
Nucleotide position numbers are consistent with both the rCRS and the RSRS reference sequences.
Mutations are given in forward evolutionary time direction in the format [ancestral base][position number][derived base], e.g. "G15043A".
In case of a transversion, the derived allele is shown in lowercase instead of uppercase, e.g. "C5178a".
Insertions are indicated by the position number preceding the insertion followed by a dot (.), the relative insert position, and the inserted base(s), e.g. "2156.1A".
Deletions are indicated by the letter "d" following the (range of) position number(s) involved, e.g. "A249d" or "8281-8289d".
Mutations that are reversions to an ancestral state (back mutations) are indicated with an exclamation mark (!), two exclamation marks for a double back mutation (!!), etc., e.g. "A15301G!".
Coding-region mutations (np 577-16023) are shown in black; control-region mutations (np 16024-576) in blue.
Mutations between brackets () are recurrent/unstable within the respective clade, or are yet uncertain based on current data.
Mutation motifs in italic are preliminary and are likely to be further refined as additional sequences become available.
The mutations 309.1C(C), 315.1C, AC indels at 515-522, A16182c, A16183c, 16193.1C(C) and C16519T/T16519C were not considered for phylogenetic reconstruction and are therefore excluded from the tree.
Accession numbers provided at the tips of branches are representative examples of mtDNA sequences available at GenBank or from individuals included in HapMap/1000Genomes.
It may be convenient to use the Find function (Ctrl+F) of your browser to search for a particular mutation or haplogroup.
                                                  Example accessions
 mt-MRCA (RSRS)                                              
L1'2'3'4'5'6  C146T  C182T  T4312C  T10664C  C10915T  A11914G  G13276A  G16230A                                   
  L2'3'4'5'6  C152T  A2758G  C2885T  G7146A  T8468C                                       
    L2'3'4'6  C195T  A247G  A825t  T8655C  A10688G  C10810T  G13105A  T13506C  G15301A  A16129G  T16187C  C16189T                         
      L3'4'6  G4104A  A7521G                                       
        L3'4  T182C!  T3594C  T7256C  T13650C  T16278C                                 
          L3  A769G  A1018G  C16311T                                 
            N  G8701A  C9540T  G10398A  C10873T  A15301G!                           
              R  T12705C  T16223C                               
                R0  G73A  A11719G                             
                  HV  T14766C                             
                    H  G2706A  T7028C                         
                      H2  G1438A                         
                        H2a  G4769A                       
                          H2a2  G750A                     
                            H2a2a  G8860A  G15326A                 
                              H2a2a1  G263A                  rCRS
          L4  T195C!  G5460A  T16362C                                 
            L4a  C198T  G3357A  G10373A  T11253C  A11344G  T11485C  T12414C  T13174C  T14302C  C16260T                     
              L4a1  C325T  T6167C  C7376T  G7775A  A11653G  T14000a  A16207t                        FJ460531
                L4a1a  (C150T)  G7762A  T8473C  A8631G                          DQ341064 EU092748
              L4a2  A12361G  C16264T                                EU092935 EU092799
            L4b  G709A  G3918A                                 
              L4b1  C150T  C195T!!  T204C  T4977C  C10813T                            NA19383
                L4b1a  T199C  G513A  A1804G  G3010A  A3505G  C4017T  C4029a  T4216C  T4232C  T7624C  T8614C  C8974g  C9248T  G9986A  A12661t  A13497G  G14016A  G14905A  C16179T  T16189C!  C16239T  C16320T  JQ044811 EU092808
              L4b2  T146C!  A244G  A5460G!  G6260A  T8104C  A9855G  T12609C  A13470G  A16293t  C16355T  A16399G                 
                L4b2a  A709G!  T1413C                             
                  L4b2a1  T152C!  T471C  A547G  G5471A  T5580C  G5746A  A6260G!  G16274A                    EU092942 DQ341065
                  L4b2a2  C195T!!  T1694C  A4949G  A10783c  T16172C                        EF184627 EU092750
                    L4b2a2a  T2483C  T6620C  T11137C                        EU092938 EU092743
                    L4b2a2b  T6956C  G8485A  T15970C  C16287T                      EU092951 EU092780
                    L4b2a2c  T391C  C8478T  T15454C                        NA19445 NA19435
                L4b2b  A5128G  G7805A  T10265C  T12438C                          NA19259
                  L4b2b1  C340T  A2220t  A4206G  A16316G                          JQ702504 NA19187