PhyloTree.org - mtDNA tree Build 17 (18 Feb 2016): subtree M
Citation: van Oven M, Kayser M. 2009. Updated comprehensive phylogenetic tree of global human mitochondrial DNA variation. Hum Mutat 30(2):E386-E394.
Nucleotide position numbers are consistent with both the rCRS and the RSRS reference sequences.
Mutations are given in forward evolutionary time direction in the format [ancestral base][position number][derived base], e.g. "G15043A".
In case of a transversion, the derived allele is shown in lowercase instead of uppercase, e.g. "C5178a".
Insertions are indicated by the position number preceding the insertion followed by a dot (.), the relative insert position, and the inserted base(s), e.g. "2156.1A".
Deletions are indicated by the letter "d" following the (range of) position number(s) involved, e.g. "A249d" or "8281-8289d".
Mutations that are reversions to an ancestral state (back mutations) are indicated with an exclamation mark (!), two exclamation marks for a double back mutation (!!), etc., e.g. "A15301G!".
Coding-region mutations (np 577-16023) are shown in black; control-region mutations (np 16024-576) in blue.
Mutations between brackets () are recurrent/unstable within the respective clade, or are yet uncertain based on current data.
Mutation motifs in italic are preliminary and are likely to be further refined as additional sequences become available.
The mutations 309.1C(C), 315.1C, AC indels at 515-522, A16182c, A16183c, 16193.1C(C) and C16519T/T16519C were not considered for phylogenetic reconstruction and are therefore excluded from the tree.
Accession numbers provided at the tips of branches are representative examples of mtDNA sequences available at GenBank or from individuals included in HapMap/1000Genomes.
It may be convenient to use the Find function (Ctrl+F) of your browser to search for a particular mutation or haplogroup.
                                                  Example accessions
 mt-MRCA (RSRS)                                              
                                                 
L1'2'3'4'5'6  C146T  C182T  T4312C  T10664C  C10915T  A11914G  G13276A  G16230A                                   
                                               
  L2'3'4'5'6  C152T  A2758G  C2885T  G7146A  T8468C                                       
                                               
    L2'3'4'6  C195T  A247G  A825t  T8655C  A10688G  C10810T  G13105A  T13506C  G15301A  A16129G  T16187C  C16189T                         
                                               
      L3'4'6  G4104A  A7521G                                       
                                               
        L3'4  T182C!  T3594C  T7256C  T13650C  T16278C                                 
                                               
          L3  A769G  A1018G  C16311T                                 
                                               
            N  G8701A  C9540T  G10398A  C10873T  A15301G!                           
                                               
              R  T12705C  T16223C                               
                                               
                R0  G73A  A11719G                             
                                               
                  HV  T14766C                             
                                               
                    H  G2706A  T7028C                         
                                               
                      H2  G1438A                         
                                               
                        H2a  G4769A                       
                                               
                          H2a2  G750A                     
                                               
                            H2a2a  G8860A  G15326A                 
                                               
                              H2a2a1  G263A                  rCRS
                                               
            M  T489C  C10400T  T14783C  G15043A                             
                                               
              M1'20'51  T14110C                                 
                                               
                M1  T195C!  G6446A  T6680C  C12403T  A12950c  G16129A!  T16189C!  T16249C  T16311C!                 
                                               
                  M1a  A813G  T6671C                            JQ702955
                                               
                    M1a1  G3705A  C12346T  T16359C                        EF060330 EF060331
                                               
                      M1a1a  T14182C                          KC152544
                                               
                        M1a1a1  C4011T  A8521G  C11044T  C16249T!                  JQ704763 EF060315
                                               
                      M1a1b  G930A  G7853A                       
                                               
                        M1a1b1  A14769G                        KC152556 EF060317
                                               
                          M1a1b1a  A5319G                      EF060321 EF060319
                                               
                          M1a1b1b  A13152G                      KC152591 DQ779928
                                               
                            M1a1b1b1  G9053A                    KC152593 DQ779930
                                               
                          M1a1b1c  C375g  A16289G                    JQ705802 JQ249907
                                               
                        M1a1b2  A1820G                        HQ384200 KC152571
                                               
                         T16093C                         
                                                 
                        M1a1c  G1719A  G6962A  G9966A  A12373G  A13542c                  EF556180 EF060322
                                               
                        M1a1d  C150T  C8270T  8281-8289d                    EF060325 EF060327
                                               
                      M1a1e  T3906a                         
                                               
                        M1a1e1  A9629G                        EF060333 KC152582
                                               
                        M1a1e2  G11914A!                        EF060332 HM852804
                                               
                      M1a1f  T6378C                          EF060328 KC152594
                                               
                      M1a1g  T12873C  A14793G  T15287C  C16261T                    KC152575
                                               
                      M1a1h  T15514C  C16278T!                        DQ341082
                                               
                      M1a1i  T204C  G263A  T9845C  C16527T                      JQ703063 HG01272
                                               
                    M1a2  G15884A                            EF060340
                                               
                      M1a2a  T152C!  (G513A)  G15172A                      AF381984 DQ779927
                                               
                      M1a2b  T593C  C16260T  C16320T                      EF060337 KC152570
                                               
                    M1a3  A13637G  T16223C                         
                                               
                      M1a3a  C6473T                          EF177443 EF060342
                                               
                      M1a3b  T12414C                          GU122999
                                               
                        M1a3b1  G1503A  T6253C  A16129G!!                    KC152560 EU200765
                                               
                        M1a3b2  C9740T                        EF060343 JX153066
                                               
                    M1a4  C3513T  C8607T                          EF060348 EF060349
                                               
                      M1a4a  T10667C  C16465T                        EF060346 EF060347
                                               
                    M1a5  A10694G  T13215C  A13722G  G14323A  T14515C  C15770T  A15799G  A16129G!!                EF060351 EF060350
                                               
                    M1a6  C954T                            KC152573 EF060344
                                               
                    M1a7  T16357C                            KC152588
                                               
                    M1a8  G5773A                            EF060345
                                               
                      M1a8a  G5054A  G15217A                        JQ702011 JX154038
                                               
                  M1b  T13111C                             
                                               
                    M1b1  T466C  C4936T  T8868C  C15247g  C16185T                      KC152542
                                               
                      M1b1a  A200G  A11671G                        EF060353 EF060354
                                               
                      M1b1b  G6179A  T6815C                        EF060352 KC152586
                                               
                    M1b2  A10895G  A16399G                          EF060361 DQ779932
                                               
                      M1b2a  G11377A  C16291T                        EF060355 EF060357
                                               
                      M1b2b  G3705A  G12007A  T16362C                      KC152557 EF060358
                                               
                      M1b2c  G1007A                          EF060362
                                               
                M20  T152C!  A249d  G316A  T3200C  A3714G  A4385t  T4772C  C7433T  A8853G  A9127G  C9512T  T10274C  A10679G  G11914A!  T12354C  C14974T  A15691G  G16129A!  T16209C  A16272G  AP012349 JX289112
                                               
                M51  C150T  C4697T  T4973C  T9509C  C14356T  A14687G  G15317A  C16278T!                   
                                               
                  M51a  G12236A                              KC505097
                                               
                    M51a1  A732G  A12715G  C16294T                       
                                               
                      M51a1a  G185A  A2045G  A3105G  T9716C  T12468C  G16129A!                  HM596693 GQ301874
                                               
                      M51a1b  T7738C  T9233C  C12025T  C14315T  G14323A  T15862C  C16234T                EU597554 KC505102
                                               
                    M51a2  T1822C  A4136G  C5461T  A9100G  A14527G  T15383C  T16189C!                  GQ301870 GQ301882
                                               
                  M51b  A2833G                              KC505098
                                               
                    M51b1  C12012T  T12609C  T16311C!                       
                                               
                      M51b1a  T8119C  A11470G                        GQ301879 KC505099
                                               
                      M51b1b  A3565G  T3999C  T4336C  G7642A  A13105G!  T13768C  G13928c  A14417G  G16145A            KC505100 KC505101
                                               
              M2  C447g  T1780C  A11083G  T15670C  G16274A                           
                                               
                M2a'b  A8502G  G16319A                             
                                               
                  M2a  T7961C  A12810G                           
                                               
                    M2a1  T204C  G5252A  A8396G  T9758C  C16270T  T16352C                    EU443499 EU597558
                                               
                      M2a1a  T195C!  A16274G!                        EU443460 EU597516
                                               
                        M2a1a1  A7472G  A14693G                      EU443472
                                               
                          M2a1a1a  A11084G                      EU443508
                                               
                            M2a1a1a1  T16172C  C16234T                  FJ383240 EU443473
                                               
                          M2a1a1b  T11339C                      EU443507 FJ383286
                                               
                            M2a1a1b1  C16256T                    EU443509 FJ383285
                                               
                        M2a1a2  T16243C                        EU443493
                                               
                          M2a1a2a  G12501A                      EU443494
                                               
                            M2a1a2a1  T199C  A10819G  A16230G!                FJ383280 EU443477
                                               
                              M2a1a2a1a  T961C                  FJ383276 EU443480
                                               
                           G207A                        EU443506 GU480005
                                                 
                          M2a1a3  C198T  T482C                    EU443502
                                               
                               T16093C                   
                                                 
                              M2a1a3a  C16295T                  EU443470 EU443501
                                               
                                M2a1a3a1  C16147T                EU443467 FJ383273
                                               
                              M2a1a3b  T11864C                  FJ383272 EU443468
                                               
                      M2a1b  G1462A  T4216C  C15700T  A15924G  T16017C  T16075C  C16278T!                EU443454 EU443456
                                               
                      M2a1c  A335G  G526A                        EU443443 EU443445
                                               
                    M2a2  G7702A  C11041a  T12657C  G13708A  A16240c  T16311C!                    EU443487
                                               
                      M2a2a  A6035G  C8395T                        FJ383239 EU443474
                                               
                    M2a3  T146C!  T5426C  T5774C  G7762A                        EU443450 EU443505
                                               
                      M2a3a  A16265c                          EU443447 EU443513
                                               
                  M2b  T152C!  C182T!!  T195C!  A1453G  G2831t  C3630T  G5744A  A6647G  T9899C  T13254C  T14766C  16169.1C  T16189C!  C16320T          EU443512
                                               
                    M2b1  T5420C  G6260A                          EU443481
                                               
                      M2b1a  A214G  C1677T  T2392C  A2707c  G11016A  C16256T                  EU443483 EU443504
                                               
                      M2b1b  T471C  C549T  C5263T  A5480G  A5747G  G7337A  T8632C  T9233C  G15777c              EU443496 EU443498
                                               
                    M2b2  C16295T                            EU443463 EU443459
                                               
                    M2b3  G11377A                            AY922305
                                               
                      M2b3a  T146C!  T16136C                        EU443449 FJ383267
                                               
                    M2b4  C459d  T4823C  C6128T  T8556C  A16240c                      EU443484 EU443486
                                               
                M2c  G1598A  T4216C  C13212T  C14800T                          KC911426
                                               
              M3  T482C  T16126C                                DQ408676
                                               
                M3a  G4580A                               
                                               
                  M3a1  T4703C                              FJ383527 JX462712
                                               
                       T204C                            JQ704107 FJ383536
                                                 
                      M3a1a  G14476A                          FJ383514 FJ383518
                                               
                      M3a1b  C10845T                          KC911530 JX462700
                                               
                  M3a2  G5783A  C10727T                            AY922266 JQ702439
                                               
                    M3a2a  C150T  A4562G  A8988G                        FJ383531 FJ383530
                                               
                M3b  A6353G  G9010A  C12031a                            FJ383513 FJ383523
                                               
                M3c  G9064A                               
                                               
                     T152C!                              FJ383542
                                                 
                    M3c1  G10365A  T10632C  A14440G  C16126T!  T16189C!  C16294T                 
                                               
                      M3c1a  T15097C                          JX462722 FJ770965
                                               
                      M3c1b  G6366A  G7598A  A14587G  C16179T                    FJ383459
                                               
                        M3c1b1  G11016A  T16124C                     
                                               
                          M3c1b1a  G8856A  G16319A                    FJ383468 FJ383460
                                               
                          M3c1b1b  G15323A                      FJ383471 FJ383462
                                               
                  M3c2  T16154C                              GU810074 FJ383541
                                               
                M3d  T11827C  C16344T                              DQ246829 JF742212
                                               
                  M3d1  T10238C  T13820C                            FJ770946
                                               
                    M3d1a  C12813T                            JF742206 KC505095
                                               
                      M3d1a1  A13836G                          KF056282 KF056281
                                               
              M4"67  G12007A                                 
                                               
                   T16311C!                               
                                                 
                  M4  T6620C  G7859A  G16145A  C16261T                       
                                               
                    M4a  C16176T                            KC911394 FJ383293
                                               
                    M4b  T152C!  G15466A  T16086C                        DQ408679 KC911313
                                               
                  M65  C511T                             
                                               
                    M65a  A4916G  A13651G  A16289G                       
                                               
                      M65a1  G1664A  C6584T  G8251A  A11413G  A15924G                    AY922291 JX462703
                                               
                         C16311T!!                          JX289111 HM036536
                                                 
                        M65a2  G4655A  T5302C                      HM036576 HM030533
                                               
                    M65b  A241G  T3398C  G8865A                        FJ383297 AY922261
                                               
                  M67  G143A  A2833G  A4227G  G5979A  G6267A  G6366A  C9863T  G12406A  G13708A  A15769G  C15833T  T16075C  C16169T          FJ383300 FJ383294
                                               
                M18'38  T246C                               
                                               
                  M18  C12498T  G13135A  A16318t                         
                                               
                    M18a  A93G  C194T                          KC911475 FJ383336
                                               
                    M18b  T8277C  A14587G  T16325C                        JQ705662 FJ383335
                                               
                    M18c  G7853A  G8206A  T16311C!                        JX289108 FJ383337
                                               
                  M38  C4099T  G15314A  A15487G                          JX289116
                                               
                    M38a  A189G  A1808G  G6267A  G6899A  G9966A                      AY922286 AY922290
                                               
                       T195C!                           
                                                 
                      M38b  T146C!  A153G  A644G  G3591A  A3987G  A6881G  A7844G  T8047C  T11050C  T16189C!            FJ383403 FJ383404
                                               
                      M38c  T629C  G1503A  C9186T  A10748G  C12103T  G14569A  A14914G                FJ383397 FJ383395
                                               
                       T199C                           
                                                 
                      M38d  T6297C  G7356A  C14944T  T16093C  C16184T  C16260a  C16266T                FJ770947
                                               
                      M38e  A488G  A2833G  C4654T  T6815C  8289.1CCCCCTCTA  G9438A  A14706G  T16311C!            FJ770963
                                               
                M30  T195a  G15431A                              FJ383657 FJ383658
                                               
                  M30a  G513A                              FJ383662 FJ383663
                                               
                    M30a1  G6366A                            AY922254 AY289072
                                               
                    M30a2  T11935C                            FJ383660 FJ383665
                                               
                  M30b  T152C!  G5147A  C16278T!  T16311C!                        AY289071 JQ702987
                                               
                  M30c  T146C!  A12234G                            AF382013
                                               
                    M30c1  A16166d                            AY922268
                                               
                      M30c1a  C16069T                          HM036539
                                               
                        M30c1a1  G9966A                        EF556149 AY922257
                                               
                  M30d  C15259T  (A16302G)                           
                                               
                    M30d1  G1598A                            KC533457 FJ383656
                                               
                    M30d2  C10160T                            FJ383668 AY922255
                                               
                     C16234T                              EU597504 AY922258
                                                 
                    M30e  T152C!  T6620C  C13303T                        FJ383676 FJ383679
                                               
                  M30f  A5894G  T16368C                            FJ383674 DQ246818
                                               
                  M30g  T204C  C6119T                            JF742213 FJ383671
                                               
                M37  C10556T                               
                                               
                     T152C!                              FJ383686
                                                 
                       C151T                           
                                                 
                      M37a  A2074d                          FJ383685 AY922265
                                               
                        M37a1  G9055A                        HQ541751 FJ383690
                                               
                      M37d  G9287A                          FJ383687 FJ383688
                                               
                  M37e  T11050C  C16111T  T16189C!  C16295T                        AY922267
                                               
                    M37e2  T16224C                            FJ383684 FJ383694
                                               
                M43  G709A  A10316G  G11696A  C12636T                         
                                               
                     T16311C!                              JX289107
                                                 
                    M43a  G14305A                            AY922301
                                               
                      M43a1  G11963A  T13656C  A13966G  T16362C                    FJ770954 JF742207
                                               
                  M43b  G15148A  G16000t                            JF742211 FJ383428
                                               
                M45  T146C!  A4734G  T16189C!                            FJ748709
                                               
                  M45a  G143A  T152C!  G2706A  A7049G  A9180G  A16300G                      HM030535 FJ383437
                                               
                M54  A9374G  T12414C  A15848G  T16304C                          KF056272 GU810077
                                               
                M63  A214G  (G709A)  G4991A  G5046A  T11437C  A12897G  T13089C  G13194A  T16172C  C16192T  (C16248T)                FJ383738
                                               
                M64  T152C!  T5201C  T8843C  G9947A  G10685A  A13105G!  G15355A  T15968C  T16263C  C16527T                  FJ383813 EF556193
                                               
                M66  T195C!  G1888A  G4541A  T6827C  C9061T  C16184T                       
                                               
                  M66a  T6221C  G12501A                            FJ770971 GU480012
                                               
                  M66b  C198T                              JX462692 AY922283
                                               
              M5  G1888A  G16129A!                               
                                               
                M5a'd  G709A  C3921T  G14323A                           
                                               
                  M5a  T12477C                              EF556195 DQ408675
                                               
                    M5a1  A4916G  T15287C  C16291T                       
                                               
                      M5a1a  (G185A)  (T334C)  G9064A  G11016A                    AY922289 DQ112875
                                               
                      M5a1b  G1303A  A6461G                        EF583176 FJ383568
                                               
                    M5a2  T4454C                            AY922259
                                               
                      M5a2a  T15262C                          FJ383552
                                               
                        M5a2a1  G8886A                        FJ770949
                                               
                          M5a2a1a  A16265c                     
                                               
                            M5a2a1a1  G12372A                    HM030518 FJ383564
                                               
                            M5a2a1a2  C16264T                    FJ383555 AY922285
                                               
                        M5a2a2  A3399G  T16144a                      FJ383577 AY922273
                                               
                        M5a2a3  G13590A  C16114a                      FJ383547 FJ383544
                                               
                        M5a2a4  T199C  G4991A  A8158G  G10685A                    EU597563 KC911557
                                               
                    M5a3  C194T  C16295T                         
                                               
                      M5a3a  T6378C  T8547C                        FJ383581 FJ383580
                                               
                      M5a3b  A7421G  T16189C!                        FJ383559 FJ383561
                                               
                    M5a4  T146C!  C10547T  T16224C  T16311C!                      FJ383554 FJ383590
                                               
                    M5a5  G11914A!  T15672C                          FJ383569 FJ383566
                                               
                  M5d  T146C!  T3826C  T13215C  T16311C!                        FJ383557 FJ770955
                                               
                M5b'c  G13368A                               
                                               
                  M5b  A8784t                              KC577360
                                               
                    M5b1  G5147A  C14066T  T16086C  C16108T  C16278T!                    FJ383543 FJ383589
                                               
                    M5b2  A3744G  G16048A                         
                                               
                      M5b2a  T8005C  G16390A                        FJ383575 AY922292
                                               
                      M5b2b  T6293C                          FJ383596 FJ383576
                                               
                        M5b2b1  455.1T  T460C                      FJ383550
                                               
                          M5b2b1a  T10166C  A12279G  G14410c                  HM036533 JF742202
                                               
                  M5c  C575T  A5319G                           
                                               
                    M5c1  C150T  C4851T  T6413C  A13368G!  G13708A                      FJ383546 AY922281
                                               
                    M5c2  A472G  A1888G!  A15896G  A16240G  C16291T                      FJ770953 KF056270
                                               
              M6  C461T  A5301G  A5558G  T10640C  A14128G  T16362C                          JX462705
                                               
                M6a  A3537G  T5082C  T16231C                           
                                               
                  M6a1  C3486T  G9329A  A13966G                          JX462716
                                               
                    M6a1a  A12507G  T16356C                          FJ383308 FJ383302
                                               
                    M6a1b  T146C!  T152C!  A5319G  G5585A  T8110C  A11314G  C15094T  C16188T                  JQ703707 AY922307
                                               
                  M6a2  G228A  A7118G  C16291T  G16319A                        FJ383305 FJ383301
                                               
                M6b  8281-8289d  C16184T  C16256g  T16311C!                         
                                               
              M7  C6455T  T9824C                               
                                               
              M8  A4715G  C7196a  G8584A  A15487t  T16298C                           
                                               
              M9  G4491A  T16362C                               
                                               
              M10  573.XC  G709A  C4140T  T8793C  C12549T  A13152G  T14502C  C15040T  T15071C  T16311C!                    DQ272116
                                               
                M10a  3172.1C  A7250G  G8856A  G10646A                          JX289127
                                               
                  M10a1  A15218G                              JX289101
                                               
                       G16129A!                            JN857060
                                                 
                      M10a1a  G13135A                          NA18577
                                               
                        M10a1a1  T16093C  T16357C  A16497G                   
                                               
                          M10a1a1a  T3083C  C7948T  C14337T                  AP008719 AY255178
                                               
                          M10a1a1b  T146C!  C16193T                    NA18760
                                               
                            M10a1a1b1  A10529G  A16129G!!                  AP010668 JN857013
                                               
                            M10a1a1b2  A10289G                    AP013191 KF540692
                                               
                    M10a1b  A16066G                            AY255154 FJ383650
                                               
                  M10a2  A200G  A16066G                            JN857058 AP008599
                                               
              M11  A215G  T318C  A326G  T1095C  C6531T  G7642A  A8108G  T9950C  G11969A                     
                                               
                   A200G                               
                                                 
                  M11a'b  A13074G                             
                                               
                    M11a  (C198T)  C14340T                          FJ383334 AY255142
                                               
                      M11a1  T6632C                          FJ383332 FJ383331
                                               
                      M11a2  T146C!  C16173T                        FJ748759 GQ895157
                                               
                    M11b  C13890T                           
                                               
                      M11b1  A14790G                          KF540712
                                               
                        M11b1a  T146C!  G10685A                      AP008639
                                               
                          M11b1a1  G200A!  G13928t  A16497G                  AP013153 AY255156
                                               
                      M11b2  459.1C  A5192G                        AP010828 JN857010
                                               
                  M11d  T471C  A3523G  G6383A  A11350G  C16295T                        JN857062 NA17983
                                               
                M11c  G1289A  T14502C  C16169T                            AP010716 NA18608
                                               
              M12'G  G14569A                                 
                                               
                M12  C4170T  T5580C  A12030G  G12372A  T14727C  A15010G  C16234T  C16290T                   
                                               
                  M12a  T318C  A12358G                           
                                               
                    M12a1  T125C  T127C  C128T                         
                                               
                      M12a1a  A15463G  C15651T                        HQ157977
                                               
                        M12a1a1  G513A  C9490T  T16362C                    HQ157978 HG00626
                                               
                        M12a1a2  C150T  T8005C  A14693G  T16093C  T16234C!                  HQ157973 EU294322
                                               
                      M12a1b  C318T!  T5492C  T11353C  T16172C                      AY255172 HQ157983
                                               
                    M12a2  C463T  573.XC  C16261T                        HQ157974 JX289125
                                               
                  M12b  A11359G  G16129A!  T16172C                         
                                               
                    M12b1  T14788C                           
                                               
                      M12b1a  A1331G  A15236G  A15951G                     
                                               
                        M12b1a1  T7080C  G13708A                      FJ383653 FJ383652
                                               
                        M12b1a2  T11260C  G16319A                     
                                               
                          M12b1a2a  G1331A!  T8749C                    KC505071 KC505077
                                               
                          M12b1a2b  C16260T                      KC505080 KC505076
                                               
                      M12b1b  G185A  A189G  C3897T  C5336T  G14869A  C16108T                  KC505084 KC505074
                                               
                    M12b2  T152C!  G7337A  G15884t  T16234C!  A16305G                      HQ157972
                                               
                      M12b2a  C151T  A9604G  T16311C!                      KC505086 KC505088
                                               
                G  G709A  A4833G  T5108C  T16362C                           
                                               
              M13'46'61  T152C!  T6253C                               
                                               
                M13  G6023A                               
                                               
                  M13a'b  A15924G                             
                                               
                    M13a  T3644C  G5773A  T6620C  A10411G  T10790C  G16145A  C16188T  T16189C!               
                                               
                      M13a1  G13135A  T16381C                        JX462680
                                               
                        M13a1a  A7673G  A11959G  T16311C!                    AP008495 AP008370
                                               
                        M13a1b  C16148T                        GU392104 GQ895142
                                               
                          M13a1b1  A5045G                      JN857028 KF148509
                                               
                      M13a2  G513A  A8405G  G10373A  C16168T  C16257T  T16311C!                  FJ968773 FJ748749
                                               
                    M13b  C152T!!  G9182A  C11665a  C15468T  G15930A  G16129A!                   
                                               
                      M13b1  G709A  G10172A  T16263C                      AY963577 FJ770957
                                               
                      M13b2  G1211A  T4742C  T9012g  T11506C  G15924A!  T16172C  T16195C  C16270T              HM030529 FJ383769
                                               
                  M13c  G3666A  G5910A  T11944C  T16381C  G16390A                      JX289122 GU810056
                                               
                   T16362C                               
                                                 
                  M46  T146C!  C3588T                            KC505096
                                               
                    M46a  G1393A  C4394T  G6032A  A7828G  G8886A  A9115G  A10130G  C11008T  C11151T  A13434G  C16278T!  A16300G  A16343t        FJ442939 GU810038
                                               
                  M61  T1193C  C1342T  G8269A  C11810T  T12732C  T16381C                      JX289113
                                               
                    M61a  T980C  G3438A  A5582c  G8790A  C16270T                      HM030538 HM030546
                                               
              M14  A234G  T4216C  G6962A                              EF495222 DQ904234
                                               
              M15  C64T  A183G  T8167C  A11002G  A11629t  A12662G  T13659C  C14284T  T15412C  C16147a  C16193T  T16249C  T16362C              EF495219
                                               
              M17  G930c  C12973T  T16209C                             
                                               
                M17a  A862G  T10324C  G11016A  A11908G  A12711G  T12804C  T15530C  A15802G  G16129A!  T16325C                GU810076 GQ301869
                                               
                M17c  G1598A                                GQ301876
                                               
                  M17c1  G143A  T16304C                            KC993910
                                               
                    M17c1a  A13651G                            GQ352635
                                               
                      M17c1a1  C15853T  A16233G  G16274A                      KC993929
                                               
                        M17c1a1a  A2833G                        KC505090 EU597577
                                               
              M19'53  A11167G                                 
                                               
                M19  T152C!  C527T  T2392C  A3828G  G5046A  T5250C  T6620C  T6896C  A12397G  C12465T  A15935G  T16249C  T16362C            JF739540
                                               
                M53  A240G  A390t  C572T  T5493C  G5821A  C9302T  A11560G  A16051G  T16189C!  A16316G                  AY922302
                                               
                  M53b  G1462A  T6815C  A11023G  A16399G                        FJ383438 FJ383442
                                               
              M21  T11482C                                 
                                               
                M21a  G709A  A3796G  C10202T  T11287C  G11611A  A15924G  G16129A!  C16256T  T16271C  T16362C                AP012377 AY963576
                                               
                M21b  G3915A  T5108C  T7861C                           
                                               
                  M21b1  T9116C  G12940A                            KC505091
                                               
                    M21b1a  A7765G  (G16319A)                          AY963581 JF739541
                                               
                     A210G                              KC505092
                                                 
                    M21b2  G709A  (C965d)  G1598A  A1763G  T2080C  A3663G  C3819T  C6231T  C8509T  A15236G  G16145A  A16181G  T16304C          GQ301866 GU810016
                                               
              M22  T710C  T4639C  T6776C                             
                                               
                M22a  T6071C  T9316C  C16290T                            AY963583 GQ301878
                                               
                M22b  A13681G                                GQ301880 HM030499
                                               
              M23'75  A12279G                                 
                                               
                M23  T152C!  T195C!  T204C  G417A  A533G  G2706A  A8360G  G9438A  A9545G  C10142T  A10295G  T11569C  T11899C  G12618A  C15025T  T16263C  T16311C!        GQ389777 FJ543102
                                               
                M75  T146C!  C150T  G3316A  C3453T  G5147A  C7313T  A7765G  T14110C  T15109C  T16068C  T16189C!                HM030540 HM030524
                                               
              M24'41  T15601C                                 
                                               
                M24  T146C!  T195C!  (G951A)  G5773A  G13359A                         
                                               
                  M24a  T152C!  T7040C  T16311C!                          KC505094 JF739543
                                               
                  M24b  G2140A  T10101C  G12651A  T13812C  T16086C                      KC505093 KF849906
                                               
                M41  C375T  C870T  T6297C  C12398T  A12469G  T13656C  C16327T  T16330C                    DQ513522
                                               
                  M41a  T16189C!                              AY922280
                                               
                    M41a1  C113T  T195C!  T16545C                        FJ383717 FJ383716
                                               
                  M41b  A15442G                              DQ513521 FJ383722
                                               
                  M41c  G10325A  A13113G                            FJ383720 GU480001
                                               
              M25  C150T  G316A  C869T  T1406C  A3511G  T7954C  C8776T  A11734G  A13144t  A13350G  G13708A  G16129A!  T16189C!  T16223C  C16290a  T16368C          KJ154681 KJ154709
                                               
              M26  T152C!  A5656G  T9899C  C11428T  A11521G  A12190G  G13708A  C13932T  T14218C  T14311C  T15109C  C15263T  C16214a  C16256T  C16278T!            HM596710 HM596670
                                               
              M27  C5375T  C9201T  A12358G                             
                                               
                M27a  T195C!  A234G  C537T  C739T  T2404C  C8406T  A10042G  A11020G  C11554g  C15451T  G16048A  A16077t  T16172C  T16311C!  C16320T         
                                               
                  M27a1  G228A  G5585A  G7337A                         
                                               
                    M27a1a  C150T  T204C  A9389G  T16136C                       
                                               
                      M27a1a1  T980C  G5177A  T16189C!                      DQ137411 DQ137410
                                               
                      M27a1a2  G8839A                          KJ154546 KJ154498
                                               
                    M27a1b  T16320C!                            KJ154715 KJ154710
                                               
                  M27a2  A189G  G4924A  A9181G  A10807G  A13434G  C13934T  A15193G                   
                                               
                    M27a2a  T12414C                            KJ154533 KJ154522
                                               
                    M27a2b  G13145A                            KJ154494 KJ154601
                                               
                  M27a3  A4212G  G8857A  T13830C  C16264T                        KJ154488 KJ154632
                                               
                M27b  T152C!  T656C  G1719A  A2315G  C3204T  G3591A  G3693A  A4342G  T5892C  T10166C  T10493C  C14137T  A14370G  T16209C  A16299G  G16390A       
                                               
                  M27b1  C64T  T199C  T236C  G1598A  A4775G  T5788C  T14674C  G16145A  T16223C                  DQ137403 DQ137402
                                               
                  M27b2  T2416C  A3768G  T16086C                          KJ154728 KJ154720
                                               
                    M27b2a  A1053G                            KJ154707
                                               
                      M27b2a1  G15172A  C16104T                        KJ154729 KJ154665
                                               
                    M27b2b  T8603C                            KJ154676
                                               
                      M27b2b1  C4198T                          KJ154654 KJ154792
                                               
                    M27b2c  T1780C                            KJ154721 KJ154719
                                               
                M27c  T146C!  (C151T)  (C186T)  (T204C)  A1692G  A3397G  T8503C  A9033G  A9127G  A11959G  C12370T  A14870G  C16301T  T16304C            KJ154770 KJ154619
                                               
              M28  T152C!  T195C!  G1719A  A6281G  T6374C  T10245C  T15067C  C16148T  T16362C  T16468C                   
                                               
                M28a  G1598A  A10658G  T16086C  G16129A!                         
                                               
                  M28a1  G6962A                              DQ372879 DQ372883
                                               
                     T204C                             
                                                 
                    M28a2  G207A  C431a  A11084G  A16051G                      KJ154478
                                               
                      M28a2a  C198T  A9590G  A13803G                      EF061145 KJ154253
                                               
                    M28a3  T5063C  C7145T  C10691T  C16261T                      KJ154806 KJ154798
                                               
                    M28a4  C151T  T199C  A15363G  C16086T!                        KJ154163 KJ154167
                                               
                  M28a5  C1185T  C16429T                            KJ154451
                                               
                    M28a5a  T5249C  G9663A                          KJ154902 KJ154913
                                               
                    M28a5b  A234G  A3651G                          KJ154832 DQ137401
                                               
                  M28a6  T789C  A4310G  A6275G  C15481a                          KJ154634
                                               
                    M28a6a  C4167T  G6257A  A7424G  T13386C                      KJ154481 KJ154495
                                               
                  M28a7  C16320T                              DQ137400
                                               
                    M28a7a  T8756C  T13246C  A14122G                        KJ154668 KJ154667
                                               
                    M28a7b  A3565G  T8093C  G16471A                        KJ154860 KJ154859
                                               
                M28b  G94A  T204C  A12172G  A16318t                            KJ154292
                                               
                  M28b1  A2135G  A5951G  A12373G  A12507G  C13754T  C16291T                      KJ154666 DQ137399
                                               
              M29'Q  T13500C                                 
                                               
                M29  C151T  T152C!  A211G  A464G  G513A  C1048T  G1598A  C4230T  T7711C  C13065T  T16189C!                 
                                               
                  M29a  T310C  C4050T  C5263T  A9852G  G12127A  A12366G  C13452T  T16311C!                  DQ137408 DQ137407
                                               
                  M29b  C16294T                              EF495217 KJ154801
                                               
                    M29b1  C16104T                            KJ154923 EF061147
                                               
                Q  T4117C  A5843G  G8790A  G12940A  G16129A!  A16241G  T16311C!                     
                                               
                  Q1'2  G5460A                             
                                               
                    Q1  T89C  G92A  T146C!  C8964T  T14025C  T16144C  C16148T  A16265c  A16343G                AY289090
                                               
                         T16223C                         
                                                 
                        Q1a  C7681T                        AY289085
                                               
                          Q1a1  T208C                      EU597495
                                               
                            Q1a1a  G9266A  C16222T                  KJ154590 AY289082
                                               
                        Q1b  A92G!  G207A  C1375T  T7993C  T10256C  A11314G  G16241A!              KJ154866 DQ372882
                                               
                        Q1c  T1391C  T6221C  G13368A                    KJ154885