- mtDNA tree Build 17 (18 Feb 2016): subtree N
Citation: van Oven M, Kayser M. 2009. Updated comprehensive phylogenetic tree of global human mitochondrial DNA variation. Hum Mutat 30(2):E386-E394.
Nucleotide position numbers are consistent with both the rCRS and the RSRS reference sequences.
Mutations are given in forward evolutionary time direction in the format [ancestral base][position number][derived base], e.g. "G15043A".
In case of a transversion, the derived allele is shown in lowercase instead of uppercase, e.g. "C5178a".
Insertions are indicated by the position number preceding the insertion followed by a dot (.), the relative insert position, and the inserted base(s), e.g. "2156.1A".
Deletions are indicated by the letter "d" following the (range of) position number(s) involved, e.g. "A249d" or "8281-8289d".
Mutations that are reversions to an ancestral state (back mutations) are indicated with an exclamation mark (!), two exclamation marks for a double back mutation (!!), etc., e.g. "A15301G!".
Coding-region mutations (np 577-16023) are shown in black; control-region mutations (np 16024-576) in blue.
Mutations between brackets () are recurrent/unstable within the respective clade, or are yet uncertain based on current data.
Mutation motifs in italic are preliminary and are likely to be further refined as additional sequences become available.
The mutations 309.1C(C), 315.1C, AC indels at 515-522, A16182c, A16183c, 16193.1C(C) and C16519T/T16519C were not considered for phylogenetic reconstruction and are therefore excluded from the tree.
Accession numbers provided at the tips of branches are representative examples of mtDNA sequences available at GenBank or from individuals included in HapMap/1000Genomes.
It may be convenient to use the Find function (Ctrl+F) of your browser to search for a particular mutation or haplogroup.
                                                  Example accessions
 mt-MRCA (RSRS)                                              
L1'2'3'4'5'6  C146T  C182T  T4312C  T10664C  C10915T  A11914G  G13276A  G16230A                                   
  L2'3'4'5'6  C152T  A2758G  C2885T  G7146A  T8468C                                       
    L2'3'4'6  C195T  A247G  A825t  T8655C  A10688G  C10810T  G13105A  T13506C  G15301A  A16129G  T16187C  C16189T                         
      L3'4'6  G4104A  A7521G                                       
        L3'4  T182C!  T3594C  T7256C  T13650C  T16278C                                 
          L3  A769G  A1018G  C16311T                                 
            N  G8701A  C9540T  G10398A  C10873T  A15301G!                           
              R  T12705C  T16223C                               
                R0  G73A  A11719G                             
                  HV  T14766C                             
                    H  G2706A  T7028C                         
                      H2  G1438A                         
                        H2a  G4769A                       
                          H2a2  G750A                     
                            H2a2a  G8860A  G15326A                 
                              H2a2a1  G263A                  rCRS
              N1'5  G1719A                                 
                N1  T10238C  G12501A                             
                N5  T5063C  A7076G  A9545G  T11626C  (A13434G)  C16111T  T16311C!                      AY714031
                  N5a  T131C  T199C  G228A  A234G  A374G  A6974G  (T13830C)  G15119A  T16144C  C16185T  C16261T  G16319A            GU480015 GU480020
              N2  A189G  G709A  G5046A  C11674T  T12414C                           
              N3  T146C!  A210G  C571T  T1005C  G3357A  G6366A  A6806G  G7897A  A8653G  T8937C  G10586A  T14634C  T16086C  T16172C  C16187T!  T16189C!  T16217C          KC867130
                N3a  T5048C  C9815T  A11128G                            KC867127 JQ705752
                  N3a1  G14569A                              KC867129 KC867132
                N3b  T5553C  C9211T  T15670C                            KC867123 KC867131
              N7  A723G  G6570t  T11617C  A13542G  C14668T  C15945T  G16129A!  (A16318G)                     
                N7a  G75t  T152C!  T279C  A508G  T3396C  G5261A  A5390G  A6710G  A9254G  G9438A  A16051G  T16063C               
                  N7a1  G709A  A16166d  A16463G  A16466G                        KC887495 KC505118
                  N7a2  T10370C  C16173T  C16355T                          KC505116 KC887473
                N7b  G1503A  G1888A  G3391A  C5135T  A8483G  C12906T  C14485T                      KC505117 KC505119
              N8  A2760G  T3027C  T7885C  T7961C  A8188G  A10398G!  A13710G  C15211T  T16263C  G16274A  T16311C!  A16343G                JX289118 HM030548
              N9  G5417A                                 
              N10  G750A  A5581G  T16172C  T16362C                           
                N10a  G185A  A189G  C3543T  A3873G  A4562G  G7853A  G10373A  T12136C  A13434G  G13928c  C14953T  C15211T  T16189C!            HM030521 HM030542
                N10b  C150T  T152C!  T199C  G709A  T2010C  A2707c  T4977C  A6245G  C8130T  T8167C  C9459T  T10345C  C12092a  A14053G  A15226G  C16069T  C16278T!  C16291a  T16298C    HM030500
              N11  C11581a                                 
                N11a  T195C!  A813G  T6674C  A7975G  T8618C  A10289G  T10908C  T14311C  T14431C  T14502C  T15514C  T15900C  C16355T           
                  N11a1  A12634G  T16189C!                            HM030536 HM030513
                  N11a2  T8928C  A9180G  A14220G  C16176T  C16232T                        HM030528 KF540803
                N11b  C150T  C261T  G3736A  T4080C  C5234T  T6092C  T6620C  G7356A  A8512G  T8867C  A9503G  A9596G  T10321C  T11204C  C11728T  C12401T  A14357G  G16129A!  C16193T  T16209C  C16270T  C16291T    GU733740 GU733776
              N13  T146C!  T152C!  A178G  T195C!  G2831A  C5704T  T6896C  T10101C  A11020G  A13263G  A16066G  C16261T  C16290T                EF495214 JN226143
              N14  G1598A  G1888A  A4917G  T5291C  G8251A  G8269A  A11491G  G14384c  C15040T  G15884c                    DQ112753
              N21  C150T  A337d  A6752G  A8701G!  A10583G  T13437C  G14560A  C16193T                      GQ301885
                   T195C!                                GQ301867 GQ301887
                  N21a  C9512T  G13135A  C16291T                          AP012425 GQ301877
              N22  C150T  A942G  A7158G  A9254G  T11365C  C16168T  T16249C                        JF739542 GQ119034
                N22a  292.1AT  C9159T  C12025T  A14587G  T16017C                        AP012414 AY963578
              A  A235G  A663G  A1736G  T4248C  A4824G  C8794T  C16290T  G16319A                       
              O  G6755A  C9140T  G16213A                              AY289059
                O1  T152C!  C509T  G5563A  T6221C  T15300C  T15852C  C15885T  G16303A  T16362C                    DQ404447
                  O1a  G5460A  A15924G                            AY289056
              S  T8404C                                 
                S1  G14384c  T16075C                              AF346963
                  S1a  C150g  A189G  A215G  C271g  G8251A  T8506C  C15040T  T16172C  T16311C!                  JN226144 DQ404440
                S2  C2380T  G3438A  T6167C                            AY289051 AF346964
                  S3  T63C  C64T  G66A  C151T  T195C!  T710C  T5302C  T5492C  T8277C  8278.XC  T9938C  A10398G!  T10786C  C11151T  T15204C  G15317A  T15663C  C15664T  T16140C  C16187T!  T16189C!  C16287T  T16311C!  AY289066 AY289067
                  S4  G1007A  A4181G  T5090C  C6528T  G7498A  C9866T  T16172C  C16192T  G16319A                AY289062
                  S5  A234G  A249d  A508G  C1375T  C3169T  T3593C  C3996T  G8027A  A10188G  A11470G  C13770a  C14121T  T16243C  C16256T          EF495220
              X  T6221C  C6371T  A13966G  T14470C  T16189C!  C16278T!