- mtDNA tree Build 17 (18 Feb 2016): subtree R
Citation: van Oven M, Kayser M. 2009. Updated comprehensive phylogenetic tree of global human mitochondrial DNA variation. Hum Mutat 30(2):E386-E394.
Nucleotide position numbers are consistent with both the rCRS and the RSRS reference sequences.
Mutations are given in forward evolutionary time direction in the format [ancestral base][position number][derived base], e.g. "G15043A".
In case of a transversion, the derived allele is shown in lowercase instead of uppercase, e.g. "C5178a".
Insertions are indicated by the position number preceding the insertion followed by a dot (.), the relative insert position, and the inserted base(s), e.g. "2156.1A".
Deletions are indicated by the letter "d" following the (range of) position number(s) involved, e.g. "A249d" or "8281-8289d".
Mutations that are reversions to an ancestral state (back mutations) are indicated with an exclamation mark (!), two exclamation marks for a double back mutation (!!), etc., e.g. "A15301G!".
Coding-region mutations (np 577-16023) are shown in black; control-region mutations (np 16024-576) in blue.
Mutations between brackets () are recurrent/unstable within the respective clade, or are yet uncertain based on current data.
Mutation motifs in italic are preliminary and are likely to be further refined as additional sequences become available.
The mutations 309.1C(C), 315.1C, AC indels at 515-522, A16182c, A16183c, 16193.1C(C) and C16519T/T16519C were not considered for phylogenetic reconstruction and are therefore excluded from the tree.
Accession numbers provided at the tips of branches are representative examples of mtDNA sequences available at GenBank or from individuals included in HapMap/1000Genomes.
It may be convenient to use the Find function (Ctrl+F) of your browser to search for a particular mutation or haplogroup.
                                                  Example accessions
 mt-MRCA (RSRS)                                              
L1'2'3'4'5'6  C146T  C182T  T4312C  T10664C  C10915T  A11914G  G13276A  G16230A                                   
  L2'3'4'5'6  C152T  A2758G  C2885T  G7146A  T8468C                                       
    L2'3'4'6  C195T  A247G  A825t  T8655C  A10688G  C10810T  G13105A  T13506C  G15301A  A16129G  T16187C  C16189T                         
      L3'4'6  G4104A  A7521G                                       
        L3'4  T182C!  T3594C  T7256C  T13650C  T16278C                                 
          L3  A769G  A1018G  C16311T                                 
            N  G8701A  C9540T  G10398A  C10873T  A15301G!                           
              R  T12705C  T16223C                               
                R0  G73A  A11719G                             
                  HV  T14766C                             
                    H  G2706A  T7028C                         
                      H2  G1438A                         
                        H2a  G4769A                       
                          H2a2  G750A                     
                            H2a2a  G8860A  G15326A                 
                              H2a2a1  G263A                  rCRS
                R1  T1391C  T16311C!                             
                  R1a  C295a  A3360G  A4917G  C5586T  A5823G  C6557T  T6671C  T7547C  T8388C  A8887G  A10658G  A10825G  C13948T  C14632T  T15721C        KC985149 KC985147
                    R1a1  A4026G  A7424G                          KC985159 HQ602771
                      R1a1a  A5378G                          JQ705561 AY714045
                        R1a1a1  A13105G!  G13368A                      EU545437
                          R1a1a1a  G6261A                      EF222243 EF222244
                        R1a1a2  T5492C  C8765T  C11977T                    GU451313 JQ702484
                      R1a1b  A3796G  T9101C                        HM030522 HM852892
                      R1a1c  G6260A                          KC985148 KC985151
                  R1b  C150T  A241G  T1095C  C11151T  T12245C  A13167G  G13359A  C14239T  T15940C                  KC985165
                    R1b1  G513A  C6683T  C11122a                        JQ703633 HM996895
                R2'JT  T4216C                               
                  R2  T152C!  G4769A  T7657C  T8473C  G9932A  G10685A  A12654G  G14305A  C16071T                  KC911379 KC911319
                       T13500C                            KC911374
                         T195C!                          AY714007
                        R2a  G769A!  T12519C                      JX155266 JX155268
                      R2b  G8790A  G9738A  A14062G  G14323A                    JX152991
                        R2b1  T146C!  T15204C                      EF556167 HM852870
                      R2c  T146C!  573.XC  G8994A  T9861C  T12793C  A14185G  C16320T                JX155271 JX155269
                      R2d  T8143C  A13434G  C13914a                      KC911337 KC911627
                  JT  A11251G  C15452a  T16126C                         
                R5  T8594C  A10754G  G14544A  T16304C  A16524G                        AY713998
                  R5a  C16266T                             
                    R5a1  A93G  A200G  A2833G                        FJ004837
                      R5a1a  T8987C  T9708C  T10084C                      FJ004822 AY713983
                    R5a2  T152C!  A11293G  T13635C  G14040A  C15385T  T16356C                    AY713993
                      R5a2a  T16266C!  T16311C!                        AY713985 AY713996
                      R5a2b  597.1T  C14990T  A16309G  T16325C                    FJ004815 FJ004814
                        R5a2b1  A6629G                        AY713991 AY714000
                        R5a2b2  T16266C!                        AY714002 FJ004829
                        R5a2b3  C11409T                        FJ004833 FJ004812
                        R5a2b4  A13827G                        FJ004834 FJ004828
                R6  (T195C!)  T12285C  (C16266T)  T16362C                         
                     G16129A!                              AY714028 JF742197
                    R6a  G228A  T11075C  C14058T                       
                      R6a1  G6305A  G8584A  C8650T  A16318G  C16320T                    FJ004819 GU480018
                      R6a2  C12133T  T15067C                        JQ704804 GU480008
                  R6b  T246C  G4991A  A7364G  A9254G  C16179T  A16227G  C16245T  C16278T                  AY713994 JX289095
                R7  A13105G!  G16319A  T16362C                           
                  R7a'b  G1442A  T6248C  T7870C  A9051G  T9110C  A10289G  T13830C  C16260T  C16261T                 
                    R7a  G10143A  T10915C!  T13404C  G15346A                      AY714030 JX462727
                      R7a1  G12406A  T13674C                        FJ004835 FJ004805
                        R7a1a  G5585A  G15497A  A16146G                    FJ004823 EU597487
                        R7a1b  A3105G                       
                          R7a1b1  G4596A  T16075C                    FJ004831 FJ004813
                          R7a1b2  G16390A                      FJ004804 FJ004810
                    R7b  T146C!  C2282T  G8557A  C14064T  T16311C!                     
                      R7b1  A1804G  C12432T  T15942C                      FJ004817
                        R7b1a  T152C!  A6254G  G15326A                    AY714024
                          R7b1a1  T9325C  T11776C                    FJ004811 FJ004821
                      R7b2  C3817T  T7310C  T7711C  A11380G  C12246T  T12384C  G12940A                GU170816 GU170819
                R8  T195C!  A2755G  A3384G  T7759C  C9449T  T13215C                       
                  R8a  A5510G  G15326A                           
                    R8a1  G709A  C5911T  C13782T                       
                      R8a1a  T9716C                          FJ467953 JX462723
                        R8a1a1  C8646T                        FJ467965 FJ004808
                          R8a1a1a  A6131G                     
                            R8a1a1a1  A243G                    AY714012 GU810073
                              R8a1a1a1a  G3483A  A5298G  T11050C              FJ467978 KC911621
                            R8a1a1a2  T4695C  G7444A  C16185T                FJ467943 JF742196
                          R8a1a1b  G16153A                      FJ467949 FJ467951
                          R8a1a1c  G11914A!                      FJ467942 FJ467955
                          R8a1a1d  A9210G  C12462a  G16390A                  HM345949 FJ467947
                        R8a1a2  T4205C  T16324C                      FJ467952
                          R8a1a2a  A7364G  A11172G  C11497T  G12127A                FJ467971 FJ467974
                        R8a1a3  C16292T                        AY714011 FJ467984
                         T16093C                          FJ467972
                        R8a1b  C13212T  C14041T                      FJ467968 FJ467970
                    R8a2  G185A  A189G  C195T!!  T11864C                        FJ467946 FJ004836
                  R8b  C456T  A6485G  G12007A  G13194A  G16390A                       
                    R8b1  T154C                            FJ467941 FJ467948
                      R8b1a  T2392C                          FJ467940 AY714009
                    R8b2  C150T  456.1T  A4136G  T14502C  C15250T  T16172C                    FJ467989 FJ467987
                R9  C3970T  G13928c  T16304C                           
                  R11'B6  A12950G                             
                    R11  G185A  A189G  G709A  T8277C  8278.XC  T10031C  A10398G!  C11061T  A13681G  T16311C!              NA18763
                      R11a  A10978G  (C16365T)                        AP010998 DQ112788
                      R11b  A13269G                          JF824897
                        R11b1  G16390A                       
                          R11b1a  T13215C  T16092C                    JN857012 NA18555
                          R11b1b  A234G                      AY255163 HG00536
                    B6  C150T  8281-8289d  G9452A  G13928c                     
                  B4'5  8281-8289d                            KC417443 HM030512
                    B4  T16217C                           
                    B5  G709A  G8584A  T9950C  A10398G!  T16140C                     
                  R24  T146C!  A3565G  C4260T  C9759T  C11710T  C12483T  A16051G  C16185T  C16193d                  GU733726
                    R24a  T8772C  A13434G  C14902T  T16324C                      GQ119037 GQ119033
                R12'21  A10398G!  A11404G  C16295T                           
                  R12  C4011T  A4200G  T4695C  T4703C  G5417A  G8027A  A8906G  T9386C  A9644G  T9881C  A12172G  G13708A  G13759A  G14305A  C14989T  A15562G  G15884A    DQ112752
                  R21  T146C!  T152C!  T199C  A249G  G1709A  G1719A  C2397T  C4711T  T8279C  A9067G  T9077C  A9109G  A10610t  A12234G  C12510T  G13145A  A15613G  C16168T  C16296T  T16304C    AP012392 AP012370
                R14  A56t  C182T!!  T204C  A234G  573.XC  T4002C  T7022g  G8860A  T9128C  G10172A  A11321G  A11560G  A12612G  T13281C  A14002G  C14800T  T15394C  T15458C  C16187T!  T16288C  T16304g  T16362C    EF495216
                R22  T152C!  G329A  T1040C  A6770G  A10316G  T10609C  G13359A  T16249C  T16288C  T16304C                  GQ301886 GQ301863
                R23  T195C!  T634a  T6216C  C7007T  A7158G  A7388G  A7822G  T8614C  A10987G  G11914A!  A12151G  A12459G  C13885a  A14687G  T15412C  C16256T  C16290T  C16465T    GQ301864
                R30  G8584A                                AY714006
                  R30a  G3316A  G6764A  C11047a  T12714C  T15055C                        JX462702
                    R30a1  (T152C!)  G2056A  T4232C  T5442C  A9156G  A9242G                   
                      R30a1a  G10688A!                          AY714001 FJ770961
                      R30a1b  A4225G  T16209C                        AY714032
                        R30a1b1  C11735T  C16256T                      GU170818 JX462715
                      R30a1c  G9142A  C9869g  T13161C  A13773G  T16172C  C16278T!                  FJ004824 KC911324
                  R30b  A373G                             
                    R30b1  T152C!  C299d  T480C  G1598A  T4062C  A4225G  A5836G  T7268g  A7490G  A8805G  T9174C  C10631a  T11009C  G12406A  A13236G  C14194T  G14305A  C15307T  T16189C!  T16298C  A16299G    FJ004827 AY714047
                    R30b2  C6290T  C7280T  A7843G  A13539G  G15148A  C16292T                    FJ004807
                      R30b2a  T14000a                          EF556148 JX462737
                R31  G15884A  (T16362C)                             
                  R31a  T146C!  C338T  C1531T  C5348T  T6293C  G6480A  C7981T  G10373A  C10631T  A13557G  T13768a  C14553T  C15334T  T16172C  T16304C        AY714021 JQ705959
                    R31a1  T152C!  A237G  T2248C  A8842G  T14290C  A16463G                    FJ004825 FJ004826
                  R31b  G207A  G228A  A234G  A1309G  T1452C  T2763C  G3849A  G3882A  T5503C  T6827C  A7046G  T8400C  A8988G  G12007A  G12651A  T14488C  G15148A  A16051G  T16093C  T16189C!  C16218T  C16292T    AY714046 AY714048
                R32  T152C!  A3816G  G4820A  8281-8289d  C8464T  G8743A  A8784G  A8887G  T9116C  G12771A  A15712G  G16145A  C16185T  C16239T  T16311C!  T16325C      KC577355
                P  A15607G                               
                    P1  T212C  C6077T  T10118C  C16266T  T16357C                     
                      P1d  C12346T                         
                        P1d1  C16270T                        AY289087
                          P1d1a  C5969T                      KJ154317 EU597507
                        P1d2  A12711G  T15479C                      KJ154684
                          P1d2a  T7624C  T16209C                    KJ154767 KJ154172
                         T152C!                          KJ154805
                        P1e  reserved                      
                        P1f  T146C!  T6671C  A7569G  A12361G  G16438A                  KJ154904 KJ154181
                    P2'10  G3882A                           
                      P2  G1438A  A3203G  A4122G  C8859T  A14890G  T16176C!                  DQ112897 AY289088
                      P10  T710C  T1673C  C3738T  T4314C  C5915T  A6131G  G6446A  A6740G  A8158t  A8664G  T9077C  G11914A!  A12642G  G13810A  G13958c  C15811T  C15839T  A15924G  G16145A  T16224C  A16233G  T16311C!  G16456A  C16527T  KC993994 GQ119036
                    P8  T152C!  G3391A  G5237A  G7805A  T8167C  T8614C  A11065G  T11353C  A11404G  T12414C  G12756A  G15110A  T15511C  G15521c  A16241t  C16261T  T16362C    DQ404446
                  P3  T127C  C128T  573.XC  T3645C  C14338T  T15748C  A15937t                   
                    P3a  T125C  C5899d  G6734A  A13651G  G16145A  C16278T!                    AY289052 AY289065
                    P3b  T236C  T12121C  C13934T                        AY289091
                      P3b1  T152C!  A259G  G263A  A14053G  T15937C  C16327T  A16399G                EF061153 EF061154
                  P4  G1719A  G5460A  A10398G!                         
                    P4a  T152C!  T507C  A517G  G3915A  T4216C  G7852A  A9587G  G9755A  T10463C  A11167G  A11641G  A12358G  G13135A  T14512C  G15314A  G16319A    EF061158 EF061159
                      P4a1  C4814T  C13468T  A14696G                      EF495221 EF061156
                    P4b  G10914A  G11016A  C11288T  G16274A  C16291T                    AY289064
                      P4b1  C591a  G3010A  A5276G  A5460G!  A6881G  C10088T  C16337T  T16362C              DQ404444 AY289057
                  P5  T152C!  G1438A  G7419A  T7657C  T9509C  G12406A  C12831T  G13368A  T15412C  T15970C  C16192T  T16311C!            AY289063
                  P6  T6719C  T16311C!  T16362C                          AY289053 AY289055
                  P7  T152C!  A374G  G1598A  C2283T  G6249A  A7325G  G8387A  G10373A  T10810C!  A12026G  T12235C  A12361G  T14502C  A15613G  C16148T  C16234T      AY289054
                  P9  C3172a  T14788C                            KC993944
                    P9a  C13452a                            GQ119026 KC993934
                U  A11467G  A12308G  G12372A