- mtDNA tree Build 17 (18 Feb 2016): subtree R0
Citation: van Oven M, Kayser M. 2009. Updated comprehensive phylogenetic tree of global human mitochondrial DNA variation. Hum Mutat 30(2):E386-E394.
Nucleotide position numbers are consistent with both the rCRS and the RSRS reference sequences.
Mutations are given in forward evolutionary time direction in the format [ancestral base][position number][derived base], e.g. "G15043A".
In case of a transversion, the derived allele is shown in lowercase instead of uppercase, e.g. "C5178a".
Insertions are indicated by the position number preceding the insertion followed by a dot (.), the relative insert position, and the inserted base(s), e.g. "2156.1A".
Deletions are indicated by the letter "d" following the (range of) position number(s) involved, e.g. "A249d" or "8281-8289d".
Mutations that are reversions to an ancestral state (back mutations) are indicated with an exclamation mark (!), two exclamation marks for a double back mutation (!!), etc., e.g. "A15301G!".
Coding-region mutations (np 577-16023) are shown in black; control-region mutations (np 16024-576) in blue.
Mutations between brackets () are recurrent/unstable within the respective clade, or are yet uncertain based on current data.
Mutation motifs in italic are preliminary and are likely to be further refined as additional sequences become available.
The mutations 309.1C(C), 315.1C, AC indels at 515-522, A16182c, A16183c, 16193.1C(C) and C16519T/T16519C were not considered for phylogenetic reconstruction and are therefore excluded from the tree.
Accession numbers provided at the tips of branches are representative examples of mtDNA sequences available at GenBank or from individuals included in HapMap/1000Genomes.
It may be convenient to use the Find function (Ctrl+F) of your browser to search for a particular mutation or haplogroup.
                                              Example accessions
 mt-MRCA (RSRS)                                          
L1'2'3'4'5'6  C146T  C182T  T4312C  T10664C  C10915T  A11914G  G13276A  G16230A                               
  L2'3'4'5'6  C152T  A2758G  C2885T  G7146A  T8468C                                   
    L2'3'4'6  C195T  A247G  A825t  T8655C  A10688G  C10810T  G13105A  T13506C  G15301A  A16129G  T16187C  C16189T                     
      L3'4'6  G4104A  A7521G                                   
        L3'4  T182C!  T3594C  T7256C  T13650C  T16278C                             
          L3  A769G  A1018G  C16311T                             
            N  G8701A  C9540T  G10398A  C10873T  A15301G!                       
              R  T12705C  T16223C                           
                R0  G73A  A11719G                         
                  R0a'b  (T58C)  C64T  T2442C  T16362C                     
                    R0a  T3847C  C13188T  T16126C                    JX153281
                      R0a1  A827G                      JQ702678
                        R0a1a  T146C!  G8292A  C11761T  C16355T              HM185216 FJ460524
                          R0a1a1  G13708A                  HM185217 HM185263
                            R0a1a1a  T16172C                HM185210 HM185208
                          R0a1a2  A93G  A95c  A3972G  G8020A  T10652C  C12741T          HM185258 HM185260
                          R0a1a3  T2069C  T4703C  T9647C  A13479t              HM185213 GU592021
                          R0a1a4  G3438A  A5120G  T5333C              HM185245 HM185233
                           T152C!                    HM185256
                          R0a1b  C26T  T16093C  T16189C!              DQ904236 HM185240
                         60.1T                      EU597493
                        R0a2'3  T15674C                   
                          R0a2  A2355G                  HM185266 AY713999
                            R0a2a  G14544A                EF556170 HM185270
                              R0a2a1  C7249T              HM185257 JQ702181
                            R0a2b  G5237A  A15924G  A16305t            HM185261 EF556172
                            R0a2c  T16304C                HM185215 EF556176
                            R0a2d  G3438A  C10728T              JF717359 HM185241
                            R0a2e  C4106T  C7256T!  A8701G!  T10493g          DQ904242
                            R0a2f  G8251A                HM185225
                              R0a2f1  T131C  T7837C  C12542T  G13708A  A13827G       
                                R0a2f1a  T11365C            HM185227 HM185221
                                R0a2f1b  A16207G            HM185228 HM185248
                            R0a2g  T9128C                HM185271 HM185218
                            R0a2h  T16172C  C16184a              HM185238 DQ904240
                            R0a2i  T9337C  T11944C  T16092C  (C16278T)          HM185242 DQ904241
                               T195C!                HM185237
                              R0a2j  T152C!  A3397G            HM185246 HM185229
                            R0a2k  T12295C                JF717355
                              R0a2k1  G3531A  T3644C  G3918A  T5557C  A10398G!  C16114T  T16325C    HM185254 HM185253
                            R0a2l  A2179G  C7471d  C14392T            HM185250 HM185244
                            R0a2m  A4767G                JQ705916 JQ705196
                            R0a2n  G11914A!  C16266T              KC911373 JF717356
                          R0a3  G15466A                  HM185223 KC911556
                            R0a3a  C12474T                HM185265 HM185224
                        R0a4  C150T  T2351C  A9531G                JQ702940 JQ705305
                    R0b  A93G  T152C!  G1719A  G4924A  T5205C  T8772C  G9055A  T10101C  G10775A  A11764G  A15613G  A15628G  C16301T    JF717361
                  HV  T14766C                          KC911472
                    HV0  T72C  T16298C                      JQ705599 JX153274
                      HV0a  C15904T                      JQ704188 AY738945
                        HV0a1  C10196T  T16126C                  GU122990 JX153134
                          HV0a1a  A200G  T3200C  G16346c              EF649971 JQ701930
                        V  G4580A                    AY495311 JX153964
                          V1  A8869G                 
                            V1a  T4639C                JQ702026 EF177435
                              V1a1  C5263T              AY495325 JQ702498
                                V1a1a  T485C  A16183G          AY339438 JX153841
                                  V1a1a1  A227G          JX153552 GU123003
                                V1a1b  A12490G            EF661005 EF177419
                            V1b  C16290T                JQ702938 JQ704342
                          V2  A13105G!                  JQ705658 JQ703647
                            V2a  T12438C                AY713979
                              V2a1  T9088C  A14793G            AY495322
                                V2a1a  T5250C            AY495317 AY495323
                            V2b  C14770T                AY495313
                              V2b1  G15773A              AY495319 AY495310
                              V2b2  T5420C              JQ704063 JX153314
                            V2c  A9210G                JQ705254 JX153985
                          V3  A12810G                  JQ703666
                            V3a  A16240G                JQ705789 JX297186
                              V3a1  A11337G              JQ702667 KC257399
                            V3b  T4550C  G15346A              JQ704036 AY495330
                            V3c  A16216G                EU567326 JQ705638
                          V4  C15250T                  AY495312 FJ384440
                          V5  T14550C  A16203G                AY339451 AY339452
                          V6  A16162G                  FJ348207 EF506486
                          V7  A93G  G7444A                JQ705798 JQ702803
                            V7a  T11899C  G16153A              JQ703830 EU567454
                              V7a1  C3549T              AY339446 JQ702569
                            V7b  C8910T  C14121T  C16114T  C16298T!          JQ705945 JQ704660
                          V8  A13350G  G14016A                JQ702025 JQ705604
                          V9  T204C  G207A                EF177445
                            V9a  A8179G  C11581T  G13759A  C16298T!         
                              V9a1  C16192T  A16219G            FJ865560 DQ658411
                              V9a2  T9887C              JQ702145 JQ704826
                          V10  A9368G                 
                            V10a  C16261T  T16311C!              JQ704602 HQ729918
                            V10b  A9254G                KF142158
                              V10b1  G9932A              JQ703770 GQ304748
                              V10b2  T9098g              HM570048 JX153465
                          V11  G8251A  A11620G                JQ704405 JQ705396
                          V12  T7270C                  AY495321 JQ705506
                          V13  G12795A  T15784C                GU122979 JQ702456
                          V14  T8843C                  JQ702206 JQ703215
                          V15  C4221T                  HQ645963
                            V15a  C10308T                JQ703991 JQ702391
                          V16  C16301T                  JQ704468 KC257385
                          V17  C1537T  A8982G                JQ703973 GU362082
                          V18  A508G                  FJ348173
                            V18a  A14914c                JX153154 EF657725
                            V19  T16362C                JQ702721 JQ703749
                            V22  G709A  A7765G              JX297133 JX297137
                             C16298T!                  AY495118 AY495109
                            V20  G8584A  C16256T              JQ705168 JQ704703
                             C72T!                  JQ701938 JQ705610
                            V21  G15431A  G16390A              JQ702689 JQ704945
                          V23  G6734A                  JQ704988 NA11893
                          V24  C3573T                  HQ711364 JQ704340
                          V25  C14629T                  NA19725 AF381990
                          V26  T12681C                  JF502419 HQ615879
                          V27  C569T                  JX153521 JQ705885
                          V28  T10256C                  JX153920 GU827698
                         T195C!                      JQ703113 JQ704255
                        HV0b  C198T                    EF556192 NA11932
                        HV0c  T6413C                    JQ704143 EF471977
                        HV0d  G15110A                    JN794568 JQ702222
                        HV0e  T10609C  T15454C  T16311C!                JQ705967 JX153089
                        HV0f  C72T!  A8706G                  JQ705127 EF660968
                        HV0g  T4047C  G15172A  G16129A!                JQ704142 JX297182
                    HV1  A8014t  C16067T                      JF320654
                      HV1a'b'c  A15218G                      AY738943 EF660936
                        HV1a  T8277C                   
                          HV1a1  C150T  G15927A  C16355T              HM852761
                            HV1a1a  A4227G  G9554A              HM575427 JF260938
                            HV1a1b  G6150A  G7379A              FJ210914
                          HV1a2  G4596A                  KC257350 JF260943
                            HV1a2a  A14587G                JF260942 EU935461
                            HV1a2b  A93G                JF316743 JX153051
                          HV1a3  G3421A  C16327a                JF260935 JF260937
                            HV1a3a  C14443T                KC911597 JF260936
                        HV1b  T12696C                    AY738942
                          HV1b1  T2626C  C4739T  G7598A  G16274A            EF556182
                            HV1b1a  A11314G  G14861A              JF260951 JF260949
                            HV1b1b  A5656G                JF260948 JF260947
                             T152C!                  JF260944
                            HV1b2  A3547G  G6023A  T16189C!            DQ856316 EF396958
                            HV1b3  T195C!  T5250C             
                              HV1b3a  C151T  A183G  G7664A  G15172A  A15236G  T15519C      HM998901 HQ412622
                              HV1b3b  A10295G  A10750G  A14161G  T16311C!        KC911450 JQ704284
                        HV1c  A13933G                    EF556190 JQ705526
                      HV1d  T146C!  A249d  A2308G  T7372C  C11476T  A12279G  T13143C  C13650T!  G13708A  C16278T!  T16362C      JF260933 JF260932
                      HV2  T152C!  T16217C                    KC911408
                        HV2a  (T72C)  T195C!  T7193C  A9336G  T11935C  C12061T           
                          HV2a1  G5147A  C16214T  A16335G              EU567456 HM852806
                          HV2a2  A5153G  T7861C                AY713986 KC911452
                          HV2a3  C739T  T1005C                KC911372 HM852860
                      HV20  A13866G                      HM036578 EU935433
                    HV4  T7094C                        EF417833 EU545447
                      HV4a  C16221T                     
                        HV4a1  C13680T                    JN214428 EF660939
                             C16291T                  JN214427
                            HV4a1a  T9950C                JN214395 JX297154
                              HV4a1a1  T152C!  T7645C  T11365C          JN214392 JN214391
                              HV4a1a2  A73G!  A7843G            JN214397 JN214400
                              HV4a1a3  A12972G              HQ675034 GQ888730
                              HV4a1a4  T4452C              JN214410 JN214418
                        HV4a2  G7805A  G16129A!                 
                          HV4a2a  T16221C!  C16287T  T16311C!              GQ888731 HM228422
                          HV4a2b  A11671G                  EU935457 JN214429
                      HV4b  C1715T  C16069T                    EF222234 HM852851
                      HV4c  G2758A!  G3834A  C10356T                  JQ272477 AY738941
                    HV5  A13105G!                       
                      HV5a  C12133T                      EF419890 EU558385
                      HV5b  C150T  A15766G                    KC911476 HQ593806
                       T16311C!                        KC765916 AY713981
                      HV6  G6755A  T16172C                    HQ658738 EF222232
                        HV6a  C3507T  G8545A  G9266A  A16113c              EU545454 EU545439
                      HV7  G5471A  G14560A  C16278T!                  EU545443 JQ701908
                      HV8  C16354T                      EU545457 EF222246
                      HV9  G8994A                      JQ703367 JX153443
                           T152C!                    EF222253 JQ703720
                          HV9a  T131C                  EU545422 JQ705368
                            HV9a1  A5480G  C11257T              KC257361 JQ704229
                              HV9a1a  G930A              EF222247 JQ703659
                        HV9b  T16249C                    FJ147309 JQ704799
                        HV9c  T6248C  C16311T!!                  KC911421 NA20814
                      HV10  C13449T                      EF222245 HM008695
                      HV11  A6040G                      JQ702048
                        HV11a  A9000G  A10283G                  GU592045 EF660954
                      HV14  T480C  T15115C                    KC911391
                        HV14a  G4655A                    KC911456 NA18743
                      HV15  G5746A  C16234T                    JQ704184 NA12489
                      HV16  A12492t                      HQ658354 JQ704124
                      HV17  A3397G  C16111T                    EU545424
                        HV17a  C549T                    JQ702596 JQ705416
                      HV22  T146C!  C4997T  A16038G                  EF660945 EF660975
                      HV23  G9548A                      KC911525 FJ460528
                      HV24  C1601T                      KC257368 NA20506
                    HV12  G13889A                       
                      HV12a  A16220c  C16292T                    HM852849
                        HV12a1  T152C!  A3892G  T4254C  A14344G  T16243C  T16342C            HQ844516 JN053060
                      HV12b  C150T  A15682G                    AY713976
                        HV12b1  T16356C                    HM852785
                          HV12b1a  A337G  C594T  T13572C  G14569A              AY713987 KC533522
                    HV13  T16357C                       
                      HV13a  (T72C)  A8774G  C9027T  G10143A  A11101G  T12879C  T16311C!            HM852828 KC911298
                      HV13b  T3290C                      JX153457 JF700125
                    HV18  G9039A  T16189C!                      JX153087 KC911471
                    HV19  T4823C  C16260T  A16399G                    HQ436102 KC911439
                    HV21  C16169T                        KF729951 HQ287727
                    H  G2706A  T7028C                      JQ705953
                      H1  G3010A                      HQ384174 HM103358
                        H1a  A73G!  A16162G                  EU369376 JX153520
                          H1a1  T6365C  T16209C                AY495188 JQ702187
                            H1a1a  T4639C                JQ704413 JQ703901
                              H1a1a1  G10993A              JQ704265 AY495189
                            H1a1b  T7961C                JQ703424 AY495190
                            H1a1c  T16172C                JX153501 JX153539
                          H1a2  A8271t                  AY339422 EU130562
                          H1a3  A16051G                  EU747355 JQ704204
                            H1a3a  A14978G                JQ704050 HQ287892
                              H1a3a1  T3396C              JQ704612 JQ705169
                              H1a3a2  42.1G              JQ704838 HM589042
                              H1a3a3  C8468T!  C16259T            AY738972 NA20768
                              H1a3a4  C534T              JQ324542 EF177447
                            H1a3b  C16465T                HQ659848 JQ703135
                              H1a3b1  G9053A              JQ705533 JQ703683
                            H1a3c  C16266T                JQ702698 EU979418
                              H1a3c1  G16213A              JX153342 JX153942
                            H1a3d  A11950G                JX152881 JQ704536
                          H1a4  A9341t                  JQ704223 HQ287891
                          H1a5  G8839A  C15789T                JQ702535 JQ704525
                          H1a6  C151T  A11893G  T16189C!              JQ702474 JX153364
                          H1a7  A5747G                  GU797829
                          H1a8  A8537G                  JQ701944 JX153239
                            H1a8a  T7080C                JQ703758 JX153203
                          H1a9  G8334A  C16167T                KF052033 KC121273
                           T16189C!                    JQ406575
                          H1b  T16356C                  JN603189 JQ702703
                            H1b1  A3796G                KC257358 JQ704003
                                 T16362C              EU219920 GU724771
                                H1b1a  5899.XC  A8348G          GU122983 AY738975
                                H1b1b  G16129A!  C16355T          JQ701966 JQ703941
                                H1b1c  A10455G            JQ704159 JQ702527
                                H1b1d  A93G            JQ705126
                                H1b1h  A7960G            JQ703500 JQ702455
                              H1b1e  T9698C              JQ703838 JQ704913
                                H1b1e1  A11962G            JX152804 JQ702763
                              H1b1f  G2145A  C16114T            JQ703254 GU797136
                              H1b1g  C64T  T195C!  G1438A            JQ703357
                              H1b1i  T4823C              JX153222 JX153213
                            H1b2  G8251A  A16080G              JQ702529 JQ706010
                              H1b2a  A183G  T8286C  C16360T          JQ702566
                                H1b2a1  T7691C            JQ704894 JQ703268
                            H1b3  T16075C                JQ704139 JX153876
                            H1b4  A11029G                JQ324829 JQ324933
                            H1b5  T12130C                JX152798 JQ704486
                          H1f  T4452C  A9066G                JQ704298
                               T16093C                JQ703322
                              H1f1  T7309C              AY339413 KC785095
                                H1f1a  C459d            JQ705607 JQ704916
                          H1g  T14212C                 
                            H1g1  T8602C                JQ701945 GU461664
                            H1g2  T9230C                JQ703948
                          H1k  C16290T                 
                            H1k1  C5206T  A15766G              EU768844
                              H1k1a  T2887C              EU770202 EU779660
                          H1y  T15299C                  JQ704157 JQ703220
                          H1z  C327T  C11428T                JQ703527
                            H1z1  T10632C  T16311C!              JQ704562
                          H1aa  A4131G                 
                            H1aa1  G11914A!                JQ702057 JX153082
                          H1ab  G15047A                  JQ704715
                            H1ab1  C16234T                AY738982 JQ324765
                          H1ac  A11893G                  JQ704994
                          H1ad  T3504C                  JQ704571 JQ703473
                          H1cc  T72C  G6261A  C16291T              JQ705678 HQ658466
                        H1c  T477C                    JQ705712 JQ702532
                          H1c1  A9150G  T16263C                AY495157 JQ703418
                            H1c1a  G9380A                AY495160 AY495163
                              H1c1a1  A9007G              NA12399 JQ702436
                            H1c1b  A16316G                JQ702237 JQ702099
                            H1c1c  A1926G  C16295T              JX153294 JX153899
                               T16093C                JQ703153 JX153157
                              H1c1d  C10192T              JX153421 JX152893
                          H1c2  C12858T                  HQ681884 JQ703166
                            H1c2a  G8764A                JQ704438 AY495096
                          H1c3  A257G  T8473C                JQ703496 JQ702738
                            H1c3a  T146C!  C16176T  A16219G            JQ704119 JQ703142
                            H1c3b  T16189C!  T16362C              GU289555 GQ332765
                          H1c4  G13759A                  JQ705516
                            H1c4a  A7299G                JX152947
                              H1c4a1  C15315T              JX297157 JQ324836
                            H1c4b  C16355T                JQ704378 JQ703499
                              H1c4b1  C6074T              JQ701984 GU122996
                          H1c5  A8803G                  AY495102
                            H1c5a  T152C!  A249d              JQ703745 JQ702006
                          H1c6  G5979A                  JQ704080 GU812902
                          H1c7  C14350T                  JQ702850 JQ702873
                          H1c8  G1462A  T14182a                JQ704294 JQ702867
                             T152C!                  JQ701993 AY495141
                            H1c9  A13203G                JQ703810
                              H1c9a  A9377G              JQ703637 JQ703459
                          H1c10  G3531A  C8417a                JQ705468
                          H1c11  A6629G                  JQ705495 JQ704352
                          H1c12  C4484T                  HM462218 JQ704242
                          H1c13  A8645G                  JQ702501 AY495139
                          H1c14  G10365A  A12627G  A15758G              JQ703342
                          H1c15  12310.1A                  JQ703551 JQ704909
                          H1c16  G6267A                  HQ658607 JQ324739
                          H1c17  A15325c                  HQ875780 JQ705238
                          H1c18  A4562G  C12636T                JQ705757 JX153132
                          H1c19  G7379A                  JQ703126 JQ703998
                          H1c20  A8730G                  JQ703383 JQ702607
                          H1c21  A4767G                 
                          H1c22  A10679G                  JX153194 FJ348214
                        H1e  G5460A                    JQ702328 DQ523657
                          H1e1  A8512G                  JQ705024
                            H1e1a  C14902T                EF177428 JQ703438
                              H1e1a1  A93G  A5301G  C5387T  C14491T          JQ324873 JQ324659
                              H1e1a2  T13326C              JQ705496
                              H1e1a3  C16111a              HQ658480 EU914954
                              H1e1a4  G709A  C7196T  T11113C  A11371G  T16311C!        JQ324756 JQ324691
                              H1e1a5  A1900c  A2320G  T4823C  T6216C  C12915a  G15884A  A16066G    JQ705884 FJ348185
                              H1e1a6  C150T              JX297199 JQ703576
                              H1e1a7  T14581C              JX153958 JQ324885
                                 C16278T!              JQ704464
                                H1e1a8  T195C!  A4781G          JX153401 JQ705331
                            H1e1b  T453C                JQ702833
                              H1e1b1  G13590A              JQ705799 JQ705809
                                H1e1b1a  T8023C            JQ702649 NA20513
                                H1e1b1b  C1812T  A4673G          JQ704656 JQ702104
                            H1e1c  G3745A                JX152857 JQ703603
                          H1e2  A15817G                  HQ880578 JQ705717
                            H1e2a  G12070A                JQ704343 JQ704128
                            H1e2b  C983T                JQ702992 JQ703207
                            H1e2c  A73G!                JQ703115 AY738971
                            H1e2d  T3548C                JQ702491 NA20803
                             G16129A!                  EU555475
                            H1e3  A93G  960.XC  G1462A  C4883T            HQ663877 JQ324720
                          H1e4  G3316A                  JQ703196 JQ704392
                            H1e4a  C16114T                EU148452 EU262984
                          H1e5  C16256T                 
                            H1e5a  T9110C                EF660933 JQ704250
                            H1e5b  A10922G                JX153041 JX153088
                          H1e6  G9554A                  JQ705426
                          H1e7  A3511G                  JQ702313 AY495134
                          H1e8  G5746A                  EF556181
                            H1e8a  G7119A                JX153138 JX153381
                        H1h  G7013A                   
                          H1h1  G11914A!                  HQ659703 JQ703535
                          H1h2  A2851G  A14148G  C14420T              JQ704717
                           T152C!                    JQ703305
                          H1i  C6237a                  JQ703270
                            H1i1  G9300A                FJ940865 EU568371
                            H1i2  C12346T                JQ703251 JQ701978
                              H1i2a  A12026G              JQ705039 JQ702223
                          H1an  T15394C                 
                            H1an1  A13050G                JQ703403
                              H1an1a  T4454C              JQ324893 JQ324894
                            H1an2  C151T  T16325C              JQ702335
                          H1bb  T11864C                  AY495144 JQ703170
                        H1j  T4733C                    JQ705294 JQ701806
                          H1j1  G16129A!                  JQ324705 JQ324525
                            H1j1a  G3849A                JX297163 JQ324736
                              H1j1a1  C447g              JQ324599 JQ324650
                              H1j1a2  A11144t              JQ324870 JQ324539
                            H1j1b  T11087C                JQ324604 JQ324901
                            H1j1c  A9181G  G11963c              JQ324760 JQ324864
                          H1j2  A1821G  G13708A  C16291T              JQ703536
                            H1j2a  G316A                JQ324660
                          H1j3  T5249C                  JQ704358 EF491001
                          H1j4  A16312G                  JQ704398 JQ704199
                          H1j5  C9290a  T10256C                AY495119 JQ704090
                          H1j6  G709A  A3084G  T9653C              JQ703147
                          H1j7  A6353G  T14178C  G15497A              JQ703631
                          H1j8  T2222g  A16240G                EF177436 JQ705914
                          H1j9  T2626C  (T16189C!)                EU372630 DQ489525
                        H1m  G15323A                    JQ705493 JQ065050
                          H1m1  T146C!  C4171T  A9468G              JQ703995 JQ704459
                        H1n  G2098A                   
                             T146C!                  FJ348196 JQ701825
                            H1n1  C15742a                JQ704655 JX152925
                              H1n1a  T11339C              JQ704566 JQ703319
                              H1n1b  A15924G  T16468C            JQ705930 JQ702009
                            H1n2  T5483C  C13431T              FJ348199 JQ702161
                            H1n3  A7295G                HQ658482
                            H1n4  G11914A!                JQ703765 JQ702043
                               T195C!                HQ839859
                              H1n5  T471C              JQ703312
                          H1n6  C552a  A11551G  T14221C              JX152889 JQ704613
                          H1o  C150T  A14053G                JQ702360 JQ324594
                          H1ck  G7604A                  JX153389 JX153869
                        H1p  A13470G                    EF556184 NA07345
                        H1q  T4859C                    JQ704630 JQ703742
                          H1q1  A12366G                  JQ704373 JX153851
                            H1q1a  C16256T                JQ324843 HQ662225
                          H1q2  T15941C                  JX152803 JQ324580
                          H1q3  G8856A  G14258A  A16037G              NA20811 JX153975
                        H1r  C9356T                    AF346981 JQ705944
                          H1r1  T146C!  C16278T!                JX297164 GQ888727
                        H1s  G8572A                    GQ478575 EU080974
                          H1s1  A12172G                  JX153137
                        H1t  G9986A                    JX154028 JQ704194
                          H1t1  C14129T                  JQ324837
                            H1t1a  A14224G                JQ324688 GQ888724
                              H1t1a1  C16266T              JX297158 JQ324838
                          H1t2  A5978G                  GQ888725 EF177427
                        H1u  C9923T                    JQ702726 JQ705383
                          H1u1  A7975G                  AY495103 JQ702971
                          H1u2  G3483A  C16320T                JN604117 JX153139
                        H1v  C10314T                    FJ460532 JQ703465
                          H1v1  T4313C                 
                            H1v1a  T9148C                HM171271
                            H1v1b  G14560A                HM171273
                        H1w  T8966C                    HM171275 HM171277
                        H1x  A7765G  T10410a  A16037G  C16256T              HM171279 HM171278
                        H1ae  G15553A                    JQ705436
                          H1ae1  A8470G                  JQ702071 JQ704433
                          H1ae2  G11696A                  JQ704032 JQ705102
                            H1ae2a  T8843C                JQ702370 HQ400746
                          H1ae3  G8723A  G12771A               
                            H1ae3a  G5231A                JQ703756 JQ704509
                        H1af  T16357C                    JQ704303 JQ705435
                          H1af1  C15646T                 
                            H1af1a  T9078C                GQ888707 JQ703089
                            H1af1b  G16129A!                JQ704957 JX153763
                          H1af2  C4137T                  FJ656214
                        H1ag  G14869A                    KC257371