PhyloTree.org - mtDNA tree Build 17 (18 Feb 2016): subtree U
Citation: van Oven M, Kayser M. 2009. Updated comprehensive phylogenetic tree of global human mitochondrial DNA variation. Hum Mutat 30(2):E386-E394.
Nucleotide position numbers are consistent with both the rCRS and the RSRS reference sequences.
Mutations are given in forward evolutionary time direction in the format [ancestral base][position number][derived base], e.g. "G15043A".
In case of a transversion, the derived allele is shown in lowercase instead of uppercase, e.g. "C5178a".
Insertions are indicated by the position number preceding the insertion followed by a dot (.), the relative insert position, and the inserted base(s), e.g. "2156.1A".
Deletions are indicated by the letter "d" following the (range of) position number(s) involved, e.g. "A249d" or "8281-8289d".
Mutations that are reversions to an ancestral state (back mutations) are indicated with an exclamation mark (!), two exclamation marks for a double back mutation (!!), etc., e.g. "A15301G!".
Coding-region mutations (np 577-16023) are shown in black; control-region mutations (np 16024-576) in blue.
Mutations between brackets () are recurrent/unstable within the respective clade, or are yet uncertain based on current data.
Mutation motifs in italic are preliminary and are likely to be further refined as additional sequences become available.
The mutations 309.1C(C), 315.1C, AC indels at 515-522, A16182c, A16183c, 16193.1C(C) and C16519T/T16519C were not considered for phylogenetic reconstruction and are therefore excluded from the tree.
Accession numbers provided at the tips of branches are representative examples of mtDNA sequences available at GenBank or from individuals included in HapMap/1000Genomes.
It may be convenient to use the Find function (Ctrl+F) of your browser to search for a particular mutation or haplogroup.
                                                  Example accessions
 mt-MRCA (RSRS)                                              
                                                 
L1'2'3'4'5'6  C146T  C182T  T4312C  T10664C  C10915T  A11914G  G13276A  G16230A                                   
                                               
  L2'3'4'5'6  C152T  A2758G  C2885T  G7146A  T8468C                                       
                                               
    L2'3'4'6  C195T  A247G  A825t  T8655C  A10688G  C10810T  G13105A  T13506C  G15301A  A16129G  T16187C  C16189T                         
                                               
      L3'4'6  G4104A  A7521G                                       
                                               
        L3'4  T182C!  T3594C  T7256C  T13650C  T16278C                                 
                                               
          L3  A769G  A1018G  C16311T                                 
                                               
            N  G8701A  C9540T  G10398A  C10873T  A15301G!                           
                                               
              R  T12705C  T16223C                               
                                               
                R0  G73A  A11719G                             
                                               
                  HV  T14766C                              KC911472
                                               
                    H  G2706A  T7028C                          JQ705953
                                               
                      H2  G1438A                         
                                               
                        H2a  G4769A                        EU597492 GU592029
                                               
                          H2a2  G750A                      JQ704533 JQ703191
                                               
                            H2a2a  G8860A  G15326A                  GU122997 JQ701904
                                               
                              H2a2a1  G263A                  rCRS
                                               
                U  A11467G  A12308G  G12372A                           
                                               
                  U1  C285T  T12879C  A13104G  A14070G  G15148A  A15954c  T16249C                   
                                               
                    U1a  C2218T  G14364A  T16189C!                       
                                               
                      U1a1  G4991A  G6026A  T7581C                      HM852790
                                               
                        U1a1a  A385G  3158.1T  G3591A  A13422G                  GU218692
                                               
                          U1a1a1  573.XC  G9575A                    HQ615882
                                               
                            U1a1a1a  C2836T                    KC477757 KC911328
                                               
                          U1a1a2  C262T  T4561C                    JQ703793 JX289842
                                               
                             G16129A!                      AY882396
                                                 
                            U1a1a3  T195C!  5899.1C  G15326A  T16288C              JQ705601 KC911502
                                               
                        U1a1b  T152C!  A8730G  A16166d  T16311C!                  JQ704153 EF556157
                                               
                        U1a1c  G15217A                        JX153116
                                               
                          U1a1c1  T15115C                     
                                               
                            U1a1c1a  C8766T  C16465T                  FJ748753 AY714038
                                               
                            U1a1c1b  C6041T  T6293C  A7253G  G15106A              JQ704034 NA20826
                                               
                            U1a1c1c  A7403G                    KC911365
                                               
                              U1a1c1c1  T195C!  A663G  T11116C  T13656C  G16145A            DQ523621 DQ523634
                                               
                            U1a1c1d  T10253C                    KC911457
                                               
                              U1a1c1d1  T9716C  G16129A!                KC911527 KC911306
                                               
                        U1a1d  C16242T  T16362C                      EF692533 HM241417
                                               
                      U1a2  455.1T  T12136C  G16129A!                      EF556194 HM852789
                                               
                      U1a3  T146C!  G10203A  A13681G  T14063C                    KC540656 HM852844
                                               
                    U1b  T146C!  T2387C  C8395T  T10885C  A11566G  G15172A  (C16111T)  C16327T               
                                               
                      U1b1  G15110A                          JQ705704 HQ325737
                                               
                      U1b2  C16214a                          KC911628 GU123007
                                               
                      U1b3  T195C!  T16311C!                        AY882397 JQ705292
                                               
                  U5  C16192T  C16270T                            KC521458
                                               
                    U5a'b  T3197C  G9477A  T13617C                       
                                               
                      U5a  A14793G  C16256T                       
                                               
                        U5a1  A15218G  A16399G                      GU296570 FJ348174
                                               
                             T16192C!                     
                                                 
                            U5a1a  T1700C                   
                                               
                              U5a1a1  T5495C  A15924G                EU523128 DQ785296
                                               
                                   T152C!                GU296601 GU296636
                                                 
                                  U5a1a1a  A3816G              DQ904330 GU296558
                                               
                                  U5a1a1b  G15110A              JQ703937 GU296652
                                               
                                  U5a1a1h  C16294T              GQ368895 JX153217
                                               
                                U5a1a1c  A6905G  T13015C              JQ703590 JQ704022
                                               
                                   T16362C                JQ704920
                                                 
                                  U5a1a1d  G185A  T204C            GU459066 GQ160809
                                               
                                    U5a1a1d1  A189G            JQ701866 KC257387
                                               
                                U5a1a1e  T9682C                JQ705621 JQ704796
                                               
                                U5a1a1g  C4224T                JQ705243 HG00145
                                               
                                U5a1a1i  C3388a                JQ582984 JX153282
                                               
                              U5a1a2  573.XC  C12346T               
                                               
                                U5a1a2a  A5319G  A6629G  T6719C            GU296557 HQ588904
                                               
                                  U5a1a2a1  T6293C              JQ703926 JX153678
                                               
                                    U5a1a2a1a  A10972G            JQ702568 KC602499
                                               
                                U5a1a2b  A13105G!                JQ704701 GU296543
                                               
                                  U5a1a2b1  G8269A  T10326a  T14278C          JQ705279 JQ702496
                                               
                            U5a1g  C7792T                    GU296640 HM765468
                                               
                              U5a1g1  G11914A!  A16293G                JQ702913 JN412063
                                               
                              U5a1g2  C64T                  KC911409 KC911325
                                               
                          U5a1b  A9667G                      JX141361 JX153668
                                               
                            U5a1b1  C16291T                    JQ702775 JN982470
                                               
                              U5a1b1a  T4553C                  JQ703963 JQ691414
                                               
                                U5a1b1a1  C14574T                JQ705245 JQ706015
                                               
                                U5a1b1a2  G15883A                NA12814 JQ703074
                                               
                              U5a1b1b  T8119C                  GU296614
                                               
                                U5a1b1b1  T16092C                GU296619 GU296649
                                               
                              U5a1b1c  G9055A                  EU140330 GU296610
                                               
                                U5a1b1c1  T1187C                JQ705297 FJ493508
                                               
                                U5a1b1c2  G3705A  G16129A!              JQ704028 GU296628
                                               
                              U5a1b1d  A12358G                  JQ702400
                                               
                                   T16093C                JX152788
                                                 
                                  U5a1b1d1  C198T              JQ705693 JX153853
                                               
                              U5a1b1e  A12582G                  JX153770 JQ704679
                                               
                              U5a1b1f  G15596A  G16129A!                AY714003 JQ702552
                                               
                              U5a1b1g  T11353C                  JN809915 HG00104
                                               
                              U5a1b1h  A10754G                  JX153227 JX153196
                                               
                            U5a1b2  A9632G                    GU296562 GU296569
                                               
                               T16362C                    JQ704045
                                                 
                              U5a1b3  G16428A                  JQ703331 GU296592
                                               
                                U5a1b3a  A5153G                JQ705935
                                               
                                  U5a1b3a1  A249G              JQ705101 JX153622
                                               
                              U5a1b4  A12331G                  HM171295 KC257373
                                               
                          U5a1c  C16320T                     
                                               
                            U5a1c1  T195C!  C13802T                  GU296588 GU296617
                                               
                              U5a1c1a  A153G                  JX297176 JQ705573
                                               
                            U5a1c2  T961C                    GU296589
                                               
                              U5a1c2a  A183G  C10544T                JQ704555
                                               
                                U5a1c2a1  C16286T                JQ705908 JX153340
                                               
                          U5a1d  T3027C                     
                                               
                            U5a1d1  C5263T  C13002a                  GU296542 GU296612
                                               
                            U5a1d2  573.XC  T3552C                 
                                               
                              U5a1d2a  T195C!  T4823C  C5583T  G16145A  T16189C!            HM173090 JQ704700
                                               
                                U5a1d2a1  C6584T  C6836T              GU296655 GU296599
                                               
                              U5a1d2b  G4924c  T10858C  T14110C  G15217A  T16304C          GU123032 JQ705737
                                               
                          U5a1e  A3564G  T8610C                    GU296547 GU296625
                                               
                          U5a1f  G6023A                     
                                               
                            U5a1f1  G5585A  A7569G  T16311C!                JQ702160 DQ112764
                                               
                              U5a1f1a  T199C  G8251A                AY882398 JQ704962
                                               
                                U5a1f1a1  G16526A                JQ702735 JQ702225
                                               
                            U5a1f2  T5557C  G8994A  T11935C  C12491T  C16222T              GU296603 KF921965
                                               
                          U5a1h  C150T  G1303A  C3192T  G3591A  T4592C  C11296T  C11938T  G12618A  C16239T          JQ704026 JQ705910
                                               
                          U5a1i  C4796T  A14893G  T14971C                  KC257306
                                               
                            U5a1i1  C12103a  C14003T                  JQ705326 KC569552
                                               
                          U5a1j  A3198G  A4745t  G8994A                  KF647698 KF262460
                                               
                        U5a2  G16526A                       
                                               
                             C16294T                      JX153018 JQ702310
                                                 
                            U5a2a  C16114a                    JN707685
                                               
                              U5a2a1  A13827G  G13928c                GU296615 JQ703936
                                               
                                U5a2a1a  G12630A  T16271C              AY339524 JX153215
                                               
                                U5a2a1b  T13015C                GU296626 HM246245
                                               
                                  U5a2a1b1  T252C              JQ702355 HM765474
                                               
                                U5a2a1c  C9293T                GU296597 GU296650
                                               
                                U5a2a1d  T4232C  G4655A  A11893G            EU124886 JQ703988
                                               
                                   T152C!                JQ704074 JQ703335
                                                 
                                  U5a2a1e  G14198A              AY339527 JX171113
                                               
                              U5a2a2  G7853A  G12406A  T16192C!              JQ705530
                                               
                                U5a2a2a  G13145A  A14518G              JX153225 JX153731
                                               
                          U5a2b  G9548A                      GU296559 GU371930
                                               
                            U5a2b1  960.XC                    GU296624 JQ702746
                                               
                              U5a2b1a  T12441C                  JQ705696 GU296651
                                               
                              U5a2b1b  C16465T                  JQ704044 GU296607
                                               
                              U5a2b1c  A15903G                  GU296629 GU296600
                                               
                              U5a2b1d  G4655A  C8933T                JQ703087 GU296656
                                               
                            U5a2b2  G10685A  T11984C  G12308A!  A12654G  A13285G            KC246057
                                               
                              U5a2b2a  A13269G                  JQ702184
                                               
                                U5a2b2a1  8281-8289d  C16234T              GU296587 GU296646
                                               
                            U5a2b3  T455d  C14684T  C16168T                KC661077
                                               
                              U5a2b3a  C13351T                  JQ702847 JX153580
                                               
                                U5a2b3a1  T152C!  G3666A              JQ702230 JN899603
                                               
                            U5a2b4  G15301A!!                    JQ702320
                                               
                              U5a2b4a  G13759A                  KC146708 JX153863
                                               
                            U5a2b5  G207A  T3504C  C7471T                NA20760 EU597544
                                               
                          U5a2c  C10619T                      JQ703187 GU012633
                                               
                            U5a2c1  C9469T                    FJ460558 EU151864
                                               
                            U5a2c2  A10768G                    JQ704067 EF660950
                                               
                            U5a2c3  T11465C  T16192C!                  JX101637
                                               
                              U5a2c3a  A7960c  A10709c                JF487827 EU049814
                                               
                            U5a2c4  G3531A                    JQ705779 GU296611
                                               
                          U5a2d  A7843G                      JQ703280 JQ702144
                                               
                            U5a2d1  C3750T  C7978T  T8104C  C11107T  T16192C!              HM490393
                                               
                              U5a2d1a  T9148C  T14577g                JN604831 JX153171
                                               
                             T16362C                      JQ705111
                                                 
                            U5a2e  C151T  T152C!  A3768G  T15289C  T16311C!              JN819535 GU296648
                                               
                      U5b  C150T  A7768G  T14182C                     
                                               
                        U5b1  A5656G                        JQ704112
                                               
                          U5b1a  T7028C  T15097C                    KC521455 JN544933
                                               
                             T16189C!                      EF420876
                                                 
                            U5b1b  G12618A                    GU296644
                                               
                              U5b1b1  A7385G  T10927C                GU296566
                                               
                                   T16192C!                JN897374 AY882400
                                                 
                                  U5b1b1a  T16144C              AY882403 JQ702837
                                               
                                    U5b1b1a1  C4059T            DQ902696 AY882404
                                               
                                      U5b1b1a1a  C1341T          HM116534 GU296598
                                               
                                        U5b1b1a1a1  C16301T        KF466256 KF631316
                                               
                                      U5b1b1a1b  C8428a          JQ703600 JX153265
                                               
                                    U5b1b1a2  T10907C            EF420877 JX171119
                                               
                                    U5b1b1a3  T1850C  C16148T          JX153170 AY882406
                                               
                                  U5b1b1d  G15884A              AY882402 AY882401
                                               
                                  U5b1b1f  A1047G              GU296591 JQ705418
                                               
                                U5b1b1b  A8413G  C16320T              AY882407 DQ282508
                                               
                                   T152C!                AF381989
                                                 
                                  U5b1b1e  T2387C              JQ704517 AY882408
                                               
                                U5b1b1g  T1822C  T5788C  A10301G  T14470C          KC479033
                                               
                                  U5b1b1g1  A15533G  A16074G            KP688570
                                               
                                    U5b1b1g1a  C242T            KP835772 HM046248
                                               
                              U5b1b2  T217C  (573.XC)                AY339536 JQ705105
                                               
                                U5b1b2a  A3434G                HG00357 HG00274
                                               
                                U5b1b2b  C8230T                JX152982 JX153220
                                               
                            U5b1c  T15191C  T16311C!                  AY882409
                                               
                              U5b1c1  G16336A                  JQ705870
                                               
                                U5b1c1a  T55a                JQ408439
                                               
                                  U5b1c1a1  C14420T  T14470C            JQ705095 JX297153
                                               
                              U5b1c2  C516T  C16174T                JQ703983 DQ661681
                                               
                                U5b1c2a  T16140C  T16192C!  T16288C            EU597535 JQ703944
                                               
                                U5b1c2b  C6341T  G13194A              JQ704043 JQ705473
                                               
                               T16192C!                    GU296582 JQ702743
                                                 
                              U5b1e  T152C!  C16465T                JX677560
                                               
                                U5b1e1  A2757G  A10283G  T12616C            KC257380 FJ493517
                                               
                                  U5b1e1a  T4209C              FJ499497 GU296571
                                               
                              U5b1h  A384G                  JQ705183 JQ704053
                                               
                          U5b1d  C5437T                     
                                               
                            U5b1d1  T15721C                    JQ702807
                                               
                              U5b1d1a  T742C  G15355A  T16192C!              JQ702376 AY882412
                                               
                              U5b1d1b  T199C  C2225a  C3507T  T8277C  T10084C  T12136C          AY882411 JX156641
                                               
                              U5b1d1c  G7912A  A15631G  C16218T  C16320T            GU977214 HQ287878
                                               
                            U5b1d2  T7085C  C16239T                  HM043711 JF436855
                                               
                          U5b1f  C3507a                     
                                               
                            U5b1f1  A533G                    HQ675036
                                               
                              U5b1f1a  G16319A                  JX297131 JX286537
                                               
                          U5b1g  C151T  G228A  573.XC  C10654T  G13759A  T14577C              HQ384206 HQ675038
                                               
                          U5b1i  A3105G  C3498T  T6674C  G15777A  C16167T  T16311C  T16356C            JQ681270 DQ523645
                                               
                        U5b2  C1721T  A13637G                      JQ705429
                                               
                          U5b2a  A4732G  T16189C!                   
                                               
                            U5b2a1  T16270C!                   
                                               
                              U5b2a1a  T15511C  C16189T!!                JQ703964
                                               
                                   T16311C!                JQ704726
                                                 
                                  U5b2a1a1  A896G              GQ853200 GU296568
                                               
                                    U5b2a1a1a  G12406A            JQ701915 JQ702021
                                               
                                    U5b2a1a1b  A249d            EU784076 JQ703942
                                               
                                    U5b2a1a1d  A11329G            EU244000 HG00284
                                               
                                U5b2a1a2  T1834C  C5452T  T8705C  A15924G  T16192C!          GU296621 AY882413
                                               
                              U5b2a1b  T152C!  T5918C  G14323A  T16192C!  T16325C            EU182656 FJ887848
                                               
                            U5b2a2  C3212T  G16398A                  GU296541
                                               
                              U5b2a2a  T12136C                  JQ705158
                                               
                                U5b2a2a1  T9682C                AY882415 GU296552
                                               
                                U5b2a2a2  T5508C  G10589A              JQ702167 DQ112820
                                               
                              U5b2a2b  A2757G  T14956C                EF459670 JN969984
                                               
                                U5b2a2b1  C4843T                GU296567 HM130562
                                               
                              U5b2a2c  T12678C  T16192C!  C16261T  T16304C            JQ702431 JQ705688
                                               
                            U5b2a3  T10031C                    EU682506 EF420249
                                               
                              U5b2a3a  G6899A                  JX153147 NA20517
                                               
                               T16192C!                   
                                                 
                              U5b2a4  A3397G  G13368A  T14767C              JQ705337
                                               
                                U5b2a4a  T6293C                JQ705419 JQ705298
                                               
                              U5b2a5  A8706G  C10654T  A11725G  T16311C!            EU233797 JQ290366
                                               
                                U5b2a5a  T3394C                JX152979 JX153565
                                               
                              U5b2a6  A4129G                  JQ704771 JX154045
                                               
                          U5b2b  A11653G  A12634G  A13630G  T16192C!                JQ706019
                                               
                            U5b2b1  G15497A                   
                                               
                              U5b2b1a  A3861G  T16362C               
                                               
                                U5b2b1a1  C16292T                KC337071 JQ703741
                                               
                                U5b2b1a2  T12696C  A16240c              GU296627 JQ703780
                                               
                              U5b2b1b  C13420T  G16526A                GU296641 JQ702927
                                               
                            U5b2b2  C4616T  G8027A                  EF419891 GQ132188
                                               
                            U5b2b3  A517t  A2755G  T15905C  T16224C              JF812598
                                               
                              U5b2b3a  T279C  T3338C  G5261A              JQ702843
                                               
                                U5b2b3a1  A9494G                JQ702046
                                               
                                  U5b2b3a1a  C16114T              JQ703790 FJ916904
                                               
                              U5b2b3b  C16242T                  KC851802 JQ702136
                                               
                            U5b2b4  A9670G  T16189C!                  JQ702585 JQ702531
                                               
                              U5b2b4a  G185A                  JQ705877 JQ702209
                                               
                            U5b2b5  T13161C  C16296T                  JX153076 JQ704572
                                               
                          U5b2c  A723G  960.XC  A13017G                  KC847158
                                               
                            U5b2c1  C6920a  A13434G                  JX186998 JQ702406
                                               
                            U5b2c2  A3861G  A5836G  A10262G                JF265240
                                               
                              U5b2c2a  G14259A                  JQ705947 JQ702625
                                               
                              U5b2c2b  T16249C                  EU490797 JQ703980
                                               
                        U5b3  (G228A)  G7226A  T16304C                    JQ705968 GQ129144
                                               
                          U5b3a  A16235G                     
                                               
                            U5b3a1  C16169a                   
                                               
                              U5b3a1a  A373G  C11177T  C16304T!              AF346988 GQ129152
                                               
                              U5b3a1b  C15781T                  GQ129157 GQ129158
                                               
                            U5b3a2  A10978G                    GQ129163 GQ129164
                                               
                          U5b3b  G9196A                      JQ704971 GQ129168
                                               
                            U5b3b1  A189G                    GQ129167 GQ129165
                                               
                            U5b3b2  G16526A                    JX153697 JQ703971
                                               
                          U5b3c  A4775G  T5557C  A6461G                  GQ129170 GQ129172
                                               
                          U5b3d  T13830C  C16067T  T16311C!                  GQ129173 GQ129174
                                               
                          U5b3e  T3535a  A8701G!                    JQ702295 GQ129177
                                               
                          U5b3f  G16129A!                      GQ129179 GQ129180
                                               
                          U5b3g  G5147A                      GQ129143 JQ689453
                                               
                          U5b3h  A6527G  T16192C!                    JX153636 JN315868
                                               
                  U6  A3348G  T16172C                           
                                               
                    U6a'b'd  A16219G                           
                                               
                      U6a  G7805A  A14179G  C16278T!                      EF064317
                                               
                        U6a1  A14927G                        HQ651694
                                               
                          U6a1a  C3969T  T16189C!                   
                                               
                            U6a1a1  T4172a  C11938T  C16239T                JX120710 HQ651688
                                               
                            U6a1a2  G1472A  G13759A                  JQ704749 JQ704539
                                               
                          U6a1b  A16235G                     
                                               
                            U6a1b1  G11176A  T12376g  T12727C  A15244G             
                                               
                              U6a1b1a  T146C!  C16355T                HQ651685 EF064321
                                               
                              U6a1b1b  T2158C  T10336C  T14034C  G16145A            HQ651693 JX120712
                                               
                            U6a1b2  T195C!  G10364A  C14562T                JQ702816 HQ651696
                                               
                            U6a1b3  C11971T                    HQ651705 JX120709
                                               
                            U6a1b4  G8865A  A9377G  A9896G  A10784G  C12022T  A13834G  T15067C  T16086C        EF064320 JX153033
                                               
                           T16189C!                        HQ651707
                                                 
                             (G103A)                     
                                                 
                            U6a2  C15626T                    EF064322
                                               
                              U6a2a  C960d  A6359G  T11204C             
                                               
                                U6a2a1  T9128C  T9891C              JX120713 EF064323
                                               
                                U6a2a2  T146C!  G13359A              KC152576
                                               
                                  U6a2a2a  A337G  A16235G            AY882416 JX120776
                                               
                              U6a2b  T15383C  C16354T                JX120716
                                               
                                U6a2b1  G15314A  C16184T              KC152589 JX120714
                                               
                                 T195C!                  KC152590
                                                 
                                U6a2c  G1709A                KC152569 HQ651702
                                               
                            U6a8  G10172A                   
                                               
                              U6a8a  G143A  G750A  C8282T  C11539T              KC152541 KC152552
                                               
                              U6a8b  C4936T  A5894c  A9100G  T9128C  C9335a  C16295T          JQ629405 KC152578
                                               
                          U6a3  C15790T                      HQ651714
                                               
                            U6a3a  G4820A                    HQ651713
                                               
                              U6a3a1  G14364A                  HQ651686 JQ704800
                                               
                                U6a3a1a  T8598C                HQ585390 KC152538
                                               
                              U6a3a2  G185A  T16093C                KC152549
                                               
                                U6a3a2a  G709A  T3847C              JX120708 JQ704099
                                               
                               G185A                   
                                                 
                              U6a3b  T146C!  T152C!  A188G  G1211A  C11268T  C13431T  A15634G        HQ651704 HQ651699
                                               
                                U6a3b1  T16311C!                HQ651697 HQ651703
                                               
                              U6a3e  G3337A  A4021G  T8705C  C12097T  T13569C  G13928A  T16362C  A16399G      JX120720 EF064326
                                               
                              U6a3f  C150T                 
                                               
                                U6a3f1  T3826C                EF064324 KC152584
                                               
                                U6a3f2  T15941C                KC152585 JQ044807
                                               
                            U6a3c  T146C!  291.1A  C960d  T1809C  C5554a  G6182A  A11272G  A15380G          JX120769 JX120718
                                               
                            U6a3d  C16147T                   
                                               
                              U6a3d1  T13635C                 
                                               
                                U6a3d1a  A385G  A4674G  G10203A  T10927C  T15067C          HQ651711 KC152574
                                               
                        U6a4  C150T  C12246T  T13674C  T14215C  T15862C  C16134T                EF064327 EF064328
                                               
                        U6a5  G3591A  G7642A  G13590A  G15927A                  JQ703902 EF064329
                                               
                          U6a5a  A11590G                      EF064330
                                               
                            U6a5a1  C11191T                    HQ592783 KC152553
                                               
                          U6a5b  A3714G  C16184T  C16234T                  JX120722 JX120723
                                               
                          U6a5c  T6407C  A10398G!  T16189C!                  EF064332 JX153008
                                               
                        U6a6  G8557c                       
                                               
                          U6a6a  A3714G  A12172G  C16079T  T16189C!  G16274A              KC152565
                                               
                            U6a6a1  C9031T                    JX120726 KC152562
                                               
                          U6a6b  C8407a  (G10685A)  C13440T                 
                                               
                            U6a6b1  T7391C                    KC152559 JX120724
                                               
                            U6a6b2  C9779T  A10700G  A11734G                EF064334 EF064333
                                               
                        U6a7  G15043A                       
                                               
                          U6a7a  T152C!  T794a  T1193C  A1692t  G5471A  T8473C  T15530C  C15632T           
                                               
                            U6a7a1  A5120G                    AY275531 FJ979865
                                               
                              U6a7a1a  A2672G  T11929C                GU967378 JX120766
                                               
                              U6a7a1b  C150T                  EF064337 JX120757
                                               
                                 C152T!!                  EF064335
                                                 
                                U6a7a1c  A11038G                HQ843176 EF064338
                                               
                            U6a7a2  T14034C  T16278C!!                  JX120730
                                               
                              U6a7a2a  A11941G                  JX120762 JX120728
                                               
                          U6a7b  T195C!  C198T  960.1C                    KC152555
                                               
                            U6a7b1  G709A  A1842G  A7735G  A12950c  G16219A!              EF064339 JX120731
                                               
                          U6a7c  G7337A  T16189C!                    JQ702118
                                               
                            U6a7c1  G14179A!                    KC152547 JX120765
                                               
                         T16311C!                         
                                                 
                        U6b  G9438A                        JX120738 AY275530
                                               
                          U6b1  G9738A  G15431A                   
                                               
                            U6b1a  T2352C  A16163G                  HQ651678 JQ704896
                                               
                              U6b1a1  C7700T                  AY275528 EF064340
                                               
                            U6b1b  T1520C  G4113A  G5821A  C9571T  T16189C!              KC152548 KC152567
                                               
                          U6b2  T4062C  C12535T  A13637G  G15355A                JQ704008 AY275527
                                               
                          U6b3  C16278T!                      JX120734
                                               
                            U6b3a  A235G                    JX120735 FJ460538
                                               
                        U6d  T4336C  G12501A  A14518G                    JX120741
                                               
                          U6d1  T4454C  T14470C  C16261T                  HQ651684
                                               
                            U6d1a  G5147A                    GU366066 DQ523663
                                               
                            U6d1b  C12603T                    EF064342 EF064341
                                               
                          U6d2  G5460A  T12842C  T15892C                  KC152592 EF064343
                                               
                          U6d3  C16174T                      JX120743
                                               
                            U6d3a  A10397G  A11947G  A12530G                HQ651681 NA19652
                                               
                    U6c  C150T  C437T  C793T  G3688c  A4965G  T5081C  C11013T  T13879C  A15244G  C16169T  T16189C!           
                                               
                      U6c1  G15553A  G16129A!                        HQ161773 EF064344
                                               
                      U6c2  C194T                          KC152568 HM775494
                                               
                  U2'3'4'7'8'9  A1811G                             
                                               
                    U2  A16051G                            FN600416
                                               
                      U2a  A16206c                         
                                               
                        U2a1  (T195C!)  A16230G!  T16311C!                   
                                               
                          U2a1a  G8572A  T16154C                    JX488759 AY882379
                                               
                          U2a1b  T11383C                      AY713992 DQ112816
                                               
                        U2a2  C194T  G3316A  A4970G  T5201C  G7382A  G7853A  G7859A  C11151T  T11299C  T12477C  G12561A  C14883T  G15734A  T16271C    KF056257 KC533515
                                               
                      U2b  T146C!  G2706A  A5186t  C12106T  G13194A  C15049T                 
                                               
                        U2b1  G3915A  A4093G  (C16168T)                    HM156690 EU330890
                                               
                          U2b1a  G13708A                      AY714020 KF056258
                                               
                        U2b2  T152C!  A234G  G1888A  C9094T  A9614G  T12793C  T13656C  G15930A  T16209C  C16239T  T16352C  C16353T      AY714027 AY882380
                                               
                         T152C!                         
                                               
                        U2c'd  C16234T                       
                                               
                          U2c  C5790a  T14935C  A15061G                  AY714010
                                               
                            U2c1  T8023C  C8676T  C9767T                KC533505 JX984460
                                               
                              U2c1a  G15043A  C16179T  A16240c              AY714005 HM036565
                                               
                              U2c1b  A12172G                  AY882381 HM036556
                                               
                          U2d  T199C  G263A  T471C  T1700C  C4025T  A8938G  A11893G  A14926G  T16189C!  C16294T       
                                               
                            U2d1  A8982G  C16184T  T16342C                JQ706062 EU440736
                                               
                            U2d2  G5147A  G5460A  T6956C  A8296G  T13789C              JQ705999
                                               
                              U2d2a  15883A                  JQ706046 KC911405
                                               
                            U2d3  T1040C  G6023A  A7277G  A7894G  C16266T              JQ706045 JQ706025
                                               
                        U2e  A508G  A3720G  A5390G  T5426C  C6045T  T6152C  A10876G  T13020C  T13734C  A15907G  G16129c  T16189C!  T16362C    AY714026
                                               
                          U2e1'2'3  T217C                     
                                               
                            U2e1  C340T                    JQ703356 FJ147311
                                               
                              U2e1a  C11197T  T11732C                FJ828532
                                               
                                U2e1a1  C3116T                AY882382 JQ703957
                                               
                                  U2e1a1a  T3197C              JQ705936 JQ705117
                                               
                                  U2e1a1b  A108G              HQ424846 JQ703203
                                               
                                  U2e1a1c  A10127G              JQ704817 FJ348194
                                               
                              U2e1b  G988A  C16256T                AY714049 JQ705941
                                               
                                U2e1b1  C7109T  T15784C  C16362T!            JQ702663 JQ703917
                                               
                                U2e1b2  3229.1A  C15661T              JQ705946 EF661006
                                               
                              U2e1c  C7151T  C12346T                KF142160
                                               
                                U2e1c1  G11176A                JQ705933 JQ701857
                                               
                              U2e1d  G4132A                  JQ702520 JQ704268
                                               
                              U2e1e  C2526T  G12618A  G16145A              JQ702316 EF452294
                                               
                              U2e1f  T15519C  T16311C!                JQ705813
                                               
                                U2e1f1  T146C!  T489C  G8155A  T9101C  A12358G          AY195764 NA12347
                                               
                              U2e1g  T11233C                  JQ703491 KC464359
                                               
                              U2e1h  C152T!!  C16189T!!                FJ493504 KF849954
                                               
                            U2e2  T8473C  (T16092C)                  KC911567
                                               
                              U2e2a  C12557T                  JX462708 JQ705900
                                               
                                U2e2a1  G3849A  T4553C             
                                               
                                  U2e2a1a  T4736C              JQ703968 JX153832
                                               
                                    U2e2a1a1  A9664G            JX154009 JQ702432
                                               
                                    U2e2a1a2  C15891T            JQ705667 JX153656
                                               
                                  U2e2a1b  T7624C  A16525G            FJ984932 EF528162
                                               
                                  U2e2a1c  A5686t              JQ705386 JQ704627
                                               
                                  U2e2a1d  G5746A              JQ702004 JQ701890
                                               
                            U2e3  C394T  C16260T  T16356C                JX286498
                                               
                              U2e3a  C309d  C575T  C3170a  T15721C  A16181G            JQ704102 JQ702389
                                               
                    U3  C150T  A14139G  T15454C  A16343G                     
                                               
                      U3a'c  A2294G  T4703C  G9266A