PhyloTree.org - mtDNA subtree R0
Citation: van Oven M, Kayser M. 2009. Updated comprehensive phylogenetic tree of global human mitochondrial DNA variation. Hum Mutat 30(2):E386-E394. doi:10.1002/humu.20921
Nucleotide position numbers are relative to the RSRS and rCRS. Mutations are given in forward evolutionary time direction. In case of a transversion the derived allele is shown in lowercase.
Coding region mutations (np 577-16023) are shown in black; control region mutations (np 16024-576) in blue.
Back mutations to an ancestral state are indicated with an exclamation mark (!), two exclamation marks for a double back mutation (!!), etc.
Mutations between brackets () are recurrent/unstable within the respective clade, or are yet uncertain based on current data.
Mutation motifs in italic are preliminary and are likely to be further refined as additional sequences become available.
The mutations 309.1C(C), 315.1C, AC indels at 515-522, 16182C, 16183C, 16193.1C(C) and 16519 were not considered for phylogenetic reconstruction and are therefore excluded from the tree.
Accession numbers provided at the tips of branches are representative examples of mtDNA sequences available at GenBank or from individuals included in HapMap/1000Genomes.
The references are independent from the accession numbers and refer to publications that have described the corresponding branch and/or have proposed haplogroup nomenclature.
A list of the references cited is available here.
It may be convenient to use the Find function (Ctrl+F) of your browser to search for a particular mutation or haplogroup.
                              Example accessions References
R0  G73A  A11719G                          Torroni 2006, Behar 2008a, Kivisild 2006, Palanichamy 2004, Achilli 2004, Shen 2004, Brandstätter 2008, Álvarez-Iglesias 2009
                           
  R0a'b  (T58C)  C64T  T2442C  T16362C                      Achilli 2011
                           
    R0a  T3847C  C13188T  T16126C                      Torroni 2006, Behar 2008a, Abu-Amero 2007 ("(preHV)1"), Shen 2004, Achilli 2004, Kivisild 2006, Palanichamy 2004, Brandstätter 2008, Álvarez-Iglesias 2009, Černý 2011
                           
      R0a1  A827G                      JQ702678 Abu-Amero 2007 ("(preHV)1a"), Brandstätter 2008, Álvarez-Iglesias 2009, Černý 2011, Behar 2012b
                           
        R0a1a  T146C!  G8292A  C11761T  C16355T                HM185216 FJ460524 Abu-Amero 2007 ("(preHV)1a1"), Álvarez-Iglesias 2009, Černý 2011
                           
          R0a1a1  G13708A                  HM185217 HM185263 Černý 2011
                           
            R0a1a1a  T16172C                HM185210 HM185208 Černý 2011
                           
          R0a1a2  C58T!  A93G  A95c  A3972G  G8020A  T10652C  C12741T          HM185258 HM185260 Černý 2011
                           
          R0a1a3  T2069C  T4703C  T9647C  A13479t              HM185213 GU592021 Černý 2011
                           
          R0a1a4  G3438A  A5120G  T5333C              HM185245 HM185233 Černý 2011
                           
           T152C!                    HM185256 Černý 2011
                             
          R0a1b  C26T  T16093C  T16189C!              DQ904236 HM185240 Černý 2011
                           
         60.1T                      EU597493 Černý 2011
                             
        R0a2'3  T15674C                    Černý 2011
                           
          R0a2  A2355G                  HM185266 AY713999 Shen 2004, Abu-Amero 2007 ("(preHV)1b"), Behar 2008a ("R0a1"), Brandstätter 2008, Álvarez-Iglesias 2009, Černý 2011
                           
            R0a2a  G14544A                EF556170 HM185270 Behar 2008a ("R0a1a"), Álvarez-Iglesias 2009, Černý 2011
                           
              R0a2a1  C7249T              HM185257 JQ702181 Behar 2012b
                           
            R0a2b  G5237A  A15924G  A16305t            HM185261 EF556172 Behar 2008a ("R0a1b"), Álvarez-Iglesias 2009, Černý 2011
                           
            R0a2c  T16304C                HM185215 EF556176 Behar 2008a ("R0a1c"), Álvarez-Iglesias 2009, Černý 2011
                           
            R0a2d  G3438A  C10728T              JF717359 HM185241 Álvarez-Iglesias 2009, Černý 2011
                           
            R0a2e  C4106T  C7256T!  A8701G!  T10493g          DQ904242 Álvarez-Iglesias 2009, Černý 2011
                           
            R0a2f  G8251A                HM185225 Černý 2011
                           
              R0a2f1  T131C  T7837C  C12542T  G13708A  A13827G        Černý 2011
                           
                R0a2f1a  T11365C            HM185227 HM185221 Černý 2011
                           
                R0a2f1b  A16207G            HM185228 HM185248 Černý 2011
                           
            R0a2g  T9128C                HM185271 HM185218 Černý 2011
                           
            R0a2h  T16172C  C16184a              HM185238 DQ904240 Černý 2011
                           
            R0a2i  T9337C  T11944C  T16092C  (C16278T)          HM185242 DQ904241 Černý 2011
                           
               T195C!                HM185237  
                             
              R0a2j  T152C!  A3397G            HM185246 HM185229 Černý 2011
                           
            R0a2k  T12295C                JF717355  
                           
              R0a2k1  G3531A  T3644C  G3918A  T5557C  A10398G!  C16114T  T16325C    HM185254 HM185253 Černý 2011
                           
            R0a2l  A2179G  C7471d  C14392T            HM185250 HM185244 Černý 2011
                           
            R0a2m  A4767G                JQ705916 JQ705196 Behar 2012b
                           
          R0a3  G15466A                  HM185265 HM185223 Černý 2011
                           
        R0a4  C150T  T2351C  A9531G                JQ702940 JQ705305 Behar 2012b
                           
    R0b  A93G  T152C!  G1719A  G4924A  T5205C  T8772C  G9055A  T10101C  G10775A  A11764G  A15613G  A15628G  C16301T      JF717361 Achilli 2011
                           
  HV  T14766C                          HM776579 Kivisild 2006, Achilli 2004, Palanichamy 2004, Shen 2004
                           
    HV0  T72C  T16298C                      JQ705599 JQ705544 Torroni 2006, Behar 2008a, Achilli 2004, Torroni 2001, Palanichamy 2004, Shen 2004, Behar 2012b
                           
      HV0a  C15904T                      JQ704188 AY738945 Torroni 2006, Achilli 2004, Torroni 2001, Behar 2012b
                           
        HV0a1  C10196T  T16126C                  GU122990 JQ705567 Behar 2012b
                           
          HV0a1a  A200G  T3200C  G16346c              EF649971 JQ701930 Behar 2012b
                           
        V  G4580A                    AY495311 HQ711364 Torroni 2006, Achilli 2004, Palanichamy 2004, Torroni 2001
                           
          V1  A8869G                   
                           
            V1a  T4639C                JQ702026 EF177435 Palanichamy 2004, Behar 2012b
                           
              V1a1  C5263T              AY495325 JQ702498 Palanichamy 2004, Finnilä 2001, Behar 2012b
                           
                V1a1a  T485C  A16183G          AY339438 GU123003  
                           
                V1a1b  A12490G            EF661005 EF177419  
                           
            V1b  C16290T                JQ702938 JQ704342 Behar 2012b
                           
          V2  A13105G!                  JQ705658 JQ703647 Palanichamy 2004, Behar 2012b
                           
            V2a  T12438C                AY713979 Palanichamy 2004
                           
              V2a1  T9088C  A14793G            AY495322 Álvarez-Iglesias 2009
                           
                V2a1a  T5250C            AY495317 AY495323 Álvarez-Iglesias 2009
                           
            V2b  C14770T                AY495313 JQ704063 Álvarez-Iglesias 2009, Behar 2012b
                           
              V2b1  G15773A              AY495319 AY495310 Álvarez-Iglesias 2009
                           
            V2c  A9210G                JQ705254 JQ702414 Behar 2012b
                           
          V3  A12810G                  JQ703666 Álvarez-Iglesias 2009, Behar 2012b
                           
            V3a  A16240G                JQ705789 Behar 2012b
                           
              V3a1  A11337G              JQ702667 JQ703836 Behar 2012b
                           
            V3b  T4550C  G15346A              JQ704036 AY495330 Behar 2012b
                           
            V3c  A16216G                EU567326 JQ705638 Behar 2012b
                           
          V4  C15250T                  AY495312 FJ384440  
                           
          V5  T14550C  A16203G                AY339451 AY339452  
                           
          V6  A16162G                  FJ348207 EF506486  
                           
          V7  A93G  G7444A                JQ705798 JQ702803 Behar 2012b
                           
            V7a  T11899C  G16153A              JQ703830 EU567454 Behar 2012b
                           
              V7a1  C3549T              AY339446 JQ702569 Behar 2012b
                           
            V7b  C8910T  C14121T  C16114T  C16298T!          JQ705945 JQ704660 Behar 2012b
                           
          V8  A13350G  G14016A                JQ702025 JQ705604 Behar 2012b
                           
          V9  T204C  G207A                EF177445  
                           
            V9a  A8179G  C11581T  G13759A  C16298T!           
                           
              V9a1  C16192T  A16219G            FJ865560 DQ658411  
                           
              V9a2  T9887C              JQ702145 JQ704826 Behar 2012b
                           
          V10  A9368G                   
                           
            V10a  C16261T  T16311C!              JQ704602 HQ729918 Behar 2012b
                           
            V10b  A9254G                HM570048 JQ703770 Behar 2012b
                           
          V11  G8251A  A11620G                JQ704405 JQ705396 Behar 2012b
                           
          V12  T7270C                  AY495321 JQ705506 Behar 2012b
                           
          V13  G12795A  T15784C                GU122979 JQ702456 Behar 2012b
                           
          V14  T8843C                  JQ702206 JQ703215 Behar 2012b
                           
          V15  C4221T                  HQ645963  
                           
            V15a  C10308T                JQ703991 JQ702391 Behar 2012b
                           
          V16  C16301T                  JQ704468 HQ384213 Behar 2012b
                           
          V17  C1537T  A8982G                JQ703973 GU362082 Behar 2012b
                           
          V18  A508G                  FJ348173 JQ701919 Behar 2012b
                           
             C150T                   
                               
            V19  T16362C                JQ702721 JQ703749 Behar 2012b
                           
            V22  reserved               Cardoso (personal communication)
                           
             C16298T!                  AY495118 AY495109  
                             
            V20  G8584A  C16256T              JQ705168 JQ704703 Behar 2012b
                           
             C72T!                  JQ701938 JQ705610 Behar 2012b
                             
            V21  G15431A  G16390A              JQ702689 JQ704945 Behar 2012b
                           
         T195C!                      JQ703113 JQ704255 Behar 2012b
                             
        HV0b  C198T                    EF556192 EF660977 Behar 2008a, Álvarez-Iglesias 2009
                           
        HV0c  T6413C                    JQ704143 EF471977 Álvarez-Iglesias 2009, Behar 2012b
                           
        HV0d  G15110A                    JN794568 JQ702222 Behar 2012b
                           
        HV0e  T10609C  T15454C  T16311C!                JQ705967 JQ705963 Behar 2012b
                           
        HV0f  C72T!  A8706G                  JQ705127 EF660968 Behar 2012b
                           
    HV1  A8014t  C16067T                      JF320654 Musilová 2011
                           
      HV1a'b'c  A15218G                      AY738943 EF660936 Achilli 2004 ("HV1"), Behar 2008a ("HV1"), Shen 2004 ("HV1"), Álvarez-Iglesias 2009 ("HV1"), Musilová 2011 ("HV1")
                           
        HV1a  T8277C                    Álvarez-Iglesias 2009, Musilová 2011
                           
          HV1a1  C150T  G15927A  C16355T              HM852761 Behar 2008a ("HV1a"), Álvarez-Iglesias 2009, Musilová 2011
                           
            HV1a1a  A4227G  G9554A              HM575427 JF260938 Behar 2008a, Musilová 2011
                           
            HV1a1b  G6150A  G7379A              FJ210914 Musilová 2011
                           
          HV1a2  G4596A                  JF260943 JF316743 Musilová 2011
                           
            HV1a2a  A14587G                JF260942 EU935461 Musilová 2011
                           
          HV1a3  G3421A  C16327a                JF260935 JF260937 Musilová 2011
                           
        HV1b  T12696C                    AY738942 Álvarez-Iglesias 2009, Musilová 2011
                           
          HV1b1  T2626C  C4739T  G7598A  G16274A            EF556182 Behar 2008a, Álvarez-Iglesias 2009, Musilová 2011
                           
            HV1b1a  A11314G  G14861A              JF260951 JF260949 Musilová 2011
                           
            HV1b1b  A5656G                JF260948 JF260947 Musilová 2011
                           
             T152C!                  JF260944 Musilová 2011
                             
            HV1b2  A3547G  G6023A  T16189C!            DQ856316 EF396958 Musilová 2011
                           
            HV1b3  T195C!  T5250C              HM998901 JQ704284 Behar 2012b
                           
        HV1c  A13933G                    EF556190 JQ705526 Behar 2008a, Álvarez-Iglesias 2009, Musilová 2011, Behar 2012b
                           
      HV1d  T146C!  A249d  A2308G  T7372C  C11476T  A12279G  T13143C  C13650T!  G13708A  C16278T!  T16362C        JF260933 JF260932 Musilová 2011
                           
       A73G!                        EU935433 HQ436102  
                             
      HV2  T152C!  T195C!  T7193C  A9336G  T11935C  C12061T  T16217C              AY713986 HM852860 Shen 2004 ("HV3"), Palanichamy 2004, Álvarez-Iglesias 2009
                           
        HV2a  T246C  573.XC  G5147A  C16214T  A16335G              EU567456 JQ704463 Behar 2012b
                           
    HV4  T7094C                        EF417833 EU545447 Malyarchuk 2008a, Álvarez-Iglesias 2009, García 2011, Gómez-Carballa 2012b
                           
      HV4a  C16221T                      García 2011, Gómez-Carballa 2012b
                           
        HV4a1  C13680T                    JN214428 EF660939 García 2011, Behar 2012b, Gómez-Carballa 2012b
                           
             C16291T                  JN214427 García 2011, Seoane 2011, Gómez-Carballa 2012b
                             
            HV4a1a  T9950C                JN214395 JN214408 Gómez-Carballa 2012b
                           
              HV4a1a1  T152C!  T7645C  T11365C          JN214392 JN214391 Gómez-Carballa 2012b
                           
              HV4a1a2  A73G!  A7843G            JN214397 JN214400 Gómez-Carballa 2012b
                           
              HV4a1a3  A12972G              HQ675034 GQ888730 Gómez-Carballa 2012b
                           
              HV4a1a4  T4452C              JN214410 JN214418 Gómez-Carballa 2012b
                           
        HV4a2  G7805A  G16129A!                  García 2011, Gómez-Carballa 2012b
                           
          HV4a2a  T16221C!  C16287T  T16311C!              GQ888731 HM228422 Gómez-Carballa 2012b ("")
                           
          HV4a2b  A11671G                  EU935457 JN214429 Gómez-Carballa 2012b ("")
                           
      HV4b  C1715T  C16069T                    EF222234 HM852851  
                           
      HV4c  G2758A!  G3834A  C10356T                    JQ272477 AY738941  
                           
    HV5  C12133T  A13105G!                      EF419890 EU558385 FamilyTreeDNA, Álvarez-Iglesias 2009
                           
       T16311C!                        EU545435 AY713981 Palanichamy 2004, Malyarchuk 2008a ("HV3")
                           
      HV6  G6755A  T16172C                    HQ658738 EF222232 Malyarchuk 2008a ("HV3b"), Álvarez-Iglesias 2009
                           
        HV6a  C3507T  G8545A  G9266A  A16113c              EU545454 EU545439 Malyarchuk 2008a ("HV3b1"), Álvarez-Iglesias 2009
                           
      HV7  G5471A  G14560A  C16278T!                    EU545443 JQ701908 Malyarchuk 2008a ("HV3c"), Álvarez-Iglesias 2009, Behar 2012b
                           
      HV8  C16354T                      EU545457 EF222246 Malyarchuk 2008a ("HV3d"), Álvarez-Iglesias 2009
                           
      HV9  G8994A                      JQ703367 EF222233 Malyarchuk 2008a ("HV3a"), Álvarez-Iglesias 2009, Behar 2012b
                           
           T152C!                    EF222253 EU545420  
                             
          HV9a  T131C                  EU545422 JQ705368 Behar 2012b
                           
            HV9a1  A5480G  C11257T              FJ430150 JQ704229 Behar 2012b
                           
      HV10  C13449T                      EF222245 HM008695  
                           
      HV11  A6040G                      JQ702048 Behar 2012b
                           
        HV11a  A9000G  A10283G                  GU592045 EF660954  
                           
      HV14  T480C  G4655A  T15115C                    NA18743 AY713988  
                           
      HV15  G5746A  C16234T                    JQ704184 JQ702778 Behar 2012b
                           
      HV16  A12492t                      HQ658354 JQ704124 Behar 2012b
                           
      HV17  A3397G  C16111T                    EU545424 JQ702596 Behar 2012b
                           
    HV12  G13889A                         
                           
      HV12a  A16220c  C16292T                    HQ844516 HM852849  
                           
      HV12b  C150T  A15682G                    AY713976 AY713987  
                           
    HV13  T16357C                        JF700125 HM852828 Shen 2004
                           
    H  G2706A  T7028C                      JQ705953 Loogväli 2004, Achilli 2004, Roostalu 2007, Behar 2012b
                           
      H1  G3010A                      HQ384174 HM103358 Loogväli 2004, Achilli 2004, Shen 2004, Roostalu 2007
                           
        H1a  A73G!  A16162G                  EU597524 JQ701944 Loogväli 2004, Roostalu 2007, Behar 2012b
                           
          H1a1  T6365C  T16209C                AY495188 JQ702187 Roostalu 2007, Behar 2012b
                           
            H1a1a  T4639C                JQ704413 JQ703901 Behar 2012b
                           
              H1a1a1  G10993A              JQ704265 AY495189 Behar 2012b
                           
            H1a1b  T7961C                JQ703424 AY495190 Behar 2012b
                           
          H1a2  A8271t                  AY339422 EU130562 Roostalu 2007
                           
          H1a3  A16051G                  EU747355 JQ704204 Behar 2012b
                           
            H1a3a  A14978G                JQ704050 EF177447 Behar 2012b
                           
              H1a3a1  T3396C              JQ704612 JQ705169 Behar 2012b
                           
              H1a3a2  42.1G              JQ704838 HM589042 Behar 2012b
                           
              H1a3a3  C8468T!  C16259T            AY738972 Achilli 2004 ("H1a")
                           
            H1a3b  C16465T                HQ659848 JQ703683 Behar 2012b
                           
            H1a3c  C16266T                JQ702698 JQ703419 Behar 2012b
                           
          H1a4  A9341t                  JQ704223 HQ287891 Behar 2012b
                           
          H1a5  G8839A  C15789T                JQ702535 JQ704525 Behar 2012b
                           
          H1a6  C151T  A11893G  T16189C!              JQ702474 JQ705205 Behar 2012b
                           
          H1a7  A5747G                  GU797829  
                           
           T16189C!                    JQ406575 Loogväli 2004, Roostalu 2007
                             
          H1b  T16356C                  JN603189 HQ184065 Loogväli 2004
                           
            H1b1  A3796G                JQ704784 JQ704003 Roostalu 2007 ("H1b"), Behar 2012b
                           
                 T16362C              EU219920 GU724771  
                             
                H1b1a  5899.XC  A8348G          GU122983 AY738975 Achilli 2004 ("H1b")
                           
                H1b1b  G16129A!  C16355T          JQ701966 JQ703941 Behar 2012b
                           
                H1b1c  A10455G            JQ704159 JQ702527 Behar 2012b
                           
                H1b1d  A93G            JQ705126 Behar 2012b
                           
                H1b1h  A7960G            JQ703500 JQ702455 Behar 2012b
                           
              H1b1e  T9698C              JQ703838 JQ704913 Behar 2012b
                           
              H1b1f  G2145A  C16114T            JQ703254 GU797136 Behar 2012b
                           
              H1b1g  C64T  T195C!  G1438A            JQ703357 Behar 2012b
                           
            H1b2  G8251A  A16080G              JQ702529 JQ706010 Behar 2012b
                           
              H1b2a  A183G  T8286C  C16360T          JQ702566 Behar 2012b
                           
                H1b2a1  T7691C            JQ704894 JQ703268 Behar 2012b
                           
            H1b3  T16075C                JQ704139 JQ704744 Behar 2012b
                           
            H1b4  A11029G                JQ324829 JQ324933  
                           
          H1f  T4452C  A9066G                JQ704298 Behar 2012b
                           
               T16093C                JQ703322 Behar 2012b
                             
              H1f1  T7309C              AY339413 JQ704038 Loogväli 2004 ("H1f"), Roostalu 2007 ("H1f"), Behar 2012b
                           
                H1f1a  C459d            JQ705607 JQ704916 Behar 2012b
                           
          H1g  T14212C                   
                           
            H1g1  T8602C                JQ701945 GU461664 Brandstätter 2008 ("H1-8602"), Álvarez-Iglesias 2009 ("H1g"), Behar 2012b
                           
            H1g2  T9230C                JQ703948 Behar 2012b
                           
          H1k  C16290T                   
                           
            H1k1  C5206T  A15766G              EU768844  
                           
              H1k1a  T2887C              EU770202 EU779660  
                           
          H1y  T15299C                  JQ704157 JQ703220 Behar 2012b
                           
          H1z  C327T  C11428T                JQ703527 Behar 2012b
                           
            H1z1  T10632C  T16311C!              JQ704562 Behar 2012b
                           
          H1aa  A4131G                  JQ702057 Behar 2012b
                           
          H1ab  G15047A                  JQ704715 Behar 2012b
                           
            H1ab1  C16234T                AY738982 JQ324765  
                           
          H1ac  A11893G                  JQ704994 Behar 2012b
                           
          H1ad  T3504C                  JQ704571 JQ703473 Behar 2012b
                           
        H1c  T477C                    JQ705712 JQ702532 Roostalu 2007, Behar 2012b
                           
          H1c1  A9150G  T16263C                FJ798928 JQ703418 Roostalu 2007, Behar 2012b
                           
            H1c1a  G9380A                AY495160 AY495163  
                           
            H1c1b  A16316G                JQ702237 JQ702099 Behar 2012b
                           
          H1c2  C12858T                  HQ681884 JQ703166 Roostalu 2007, Behar 2012b
                           
            H1c2a  G8764A                JQ704438 AY495096 Álvarez-Iglesias 2009 ("H1c2"), Behar 2012b
                           
          H1c3  A257G  T8473C                JQ703496 JQ702738 Behar 2012b
                           
            H1c3a  T146C!  C16176T  A16219G            JQ704119 JQ703142 Behar 2012b
                           
            H1c3b  T16189C!  T16362C              GU289555 GQ332765  
                           
          H1c4  G13759A                  JQ705516 Behar 2012b
                           
            H1c4a  A7299G  C15315T              JQ324779 JQ324836  
                           
            H1c4b  C16355T                JQ704378 JQ703499 Behar 2012b
                           
              H1c4b1  C6074T              JQ701984 GU122996 Behar 2012b
                           
          H1c5  A8803G                  AY495102  
                           
            H1c5a  T152C!  A249d              JQ703745 JQ702006 Behar 2012b
                           
          H1c6  G5979A                  JQ704080 GU812902 Behar 2012b
                           
          H1c7  C14350T                  JQ702850 JQ702873 Behar 2012b
                           
          H1c8  G1462A  T14182a                JQ704294 JQ702867 Behar 2012b
                           
             T152C!                  JQ701993 AY495141 Behar 2012b
                             
            H1c9  A13203G                JQ703810 Behar 2012b
                           
              H1c9a  A9377G              JQ703637 JQ703459 Behar 2012b
                           
          H1c10  G3531A  C8417a                JQ705468 Behar 2012b
                           
          H1c11  A6629G                  JQ705495 JQ704352 Behar 2012b
                           
          H1c12  C4484T                  HM462218 JQ704242 Behar 2012b
                           
          H1c13  A8645G                  JQ702501 AY495139 Behar 2012b
                           
          H1c14  G10365A  A12627G  A15758G              JQ703342 Behar 2012b
                           
          H1c15  12310.1A                  JQ703551 JQ704909 Behar 2012b
                           
          H1c16  G6267A                  HQ658607 JQ324739  
                           
          H1c17  A15325c                  HQ875780 JQ705238 Behar 2012b
                           
          H1c18  A4562G  C12636T                JQ705757 Behar 2012b
                           
          H1c19  G7379A                  JQ703126 JQ703998 Behar 2012b
                           
          H1c20  A8730G                  JQ703383 JQ702607 Behar 2012b
                           
          H1c21  A4767G                   
                           
          H1c22  A10679G                  FJ348214  
                           
        H1e  G5460A                    EF556181 DQ523657 Behar 2008a
                           
          H1e1  A8512G                  JQ705256 JQ702349 Behar 2012b
                           
            H1e1a  C14902T                EF177428 JQ705330 Behar 2012b
                           
              H1e1a1  A93G  A5301G  C5387T  C14491T          JQ324873 JQ324659 Behar 2012a
                           
              H1e1a2  T13326C              JQ705496 Behar 2012b
                           
              H1e1a3  C16111a              HQ658480 EU914954  
                           
              H1e1a4  G709A  C7196T  T11113C  A11371G  T16311C!        JQ324756 JQ324691  
                           
            H1e1b  T453C                JQ702833 Behar 2012b
                           
              H1e1b1  G13590A              JQ705799 JQ704656 Behar 2012b
                           
          H1e2  A15817G                  HQ880578 JQ703698 Behar 2012b
                           
            H1e2a  G12070A                JQ704343 JQ704128 Behar 2012b
                           
            H1e2b  C983T                JQ702992 JQ703207 Behar 2012b
                           
             G16129A!                  EU555475  
                             
            H1e3  A93G  960.XC  G1462A  C4883T            HQ663877 JQ324720  
                           
          H1e4  G3316A                  JQ703196 JQ704392 Behar 2012b
                           
            H1e4a  C16114T                EU148452 EU262984  
                           
          H1e5  T9110C  C16256T                EF660933 JQ704250 Behar 2012b
                           
          H1e6  G9554A                  JQ705426 Behar 2012b
                           
        H1h  G7013A                     
                           
          H1h1  G11914A!                  HQ659703 JQ703535 Behar 2012b
                           
          H1h2  A2851G  A14148G  C14420T              JQ704717 Behar 2012b
                           
           T152C!                    JQ703305 Behar 2012b
                             
          H1i  C6237a                  JQ703270 Behar 2012b
                           
            H1i1  G9300A                FJ940865 EU568371  
                           
            H1i2  C12346T                JQ703251 JQ701978 Behar 2012b
                           
              H1i2a  A12026G              JQ705039 JQ702223 Behar 2012b
                           
          H1an  T15394C                   
                           
            H1an1  A13050G                JQ703403 Behar 2012b
                           
              H1an1a  T4454C              JQ324893 JQ324894  
                           
            H1an2  C151T  T16325C              JQ702335 Behar 2012b
                           
          H1bb  T11864C                  AY495144 JQ703170 Behar 2012b
                           
        H1j  T4733C                    JQ705294 JQ701806 Pereira 2004 (""), Behar 2012b
                           
          H1j1  G16129A!                  JQ324705 JQ324525 Gómez-Carballa 2011 (""), Behar 2012a
                           
            H1j1a  G3849A                JQ324607 JQ324736 Pereira 2004 (""), Gómez-Carballa 2011 ("H1j1"), Behar 2012a
                           
              H1j1a1  C447g              JQ324599 JQ324650 Behar 2012a
                           
              H1j1a2  A11144t              JQ324870 JQ324539 Behar 2012a
                           
            H1j1b  T11087C                JQ324604 JQ324901 Behar 2012a
                           
            H1j1c  A9181G  G11963c              JQ324760 JQ324864 Behar 2012a
                           
          H1j2  A1821G  G13708A  C16291T              JQ703536 Behar 2012b
                           
            H1j2a  G316A                JQ324660  
                           
          H1j3  T5249C                  JQ704358 EF491001 Behar 2012b
                           
          H1j4  A16312G                  JQ704398 JQ704199 Behar 2012b
                           
          H1j5  C9290a  T10256C                AY495119 JQ704090 Behar 2012b
                           
          H1j6  G709A  A3084G  T9653C              JQ703147 Behar 2012b
                           
          H1j7  A6353G  T14178C  G15497A              JQ703631 Behar 2012b
                           
          H1j8  T2222g  A16240G                EF177436 JQ705914 Behar 2012b
                           
          H1j9  T2626C  (T16189C!)                EU372630 DQ489525  
                             
        H1m  G15323A                    JQ705493 JQ065050 Behar 2012b
                           
          H1m1  T146C!  C4171T  A9468G              JQ703995 JQ704459 Behar 2012b
                           
        H1n  G2098A                     
                           
             T146C!                  FJ348196 JQ701825 Behar 2012b
                             
            H1n1  C15742a                JQ704655 Behar 2012b
                           
              H1n1a  T11339C              JQ704566 JQ703319 Behar 2012b
                           
              H1n1b  A15924G  T16468C            JQ705930 JQ702009 Behar 2012b
                           
            H1n2  T5483C  C13431T              FJ348199 JQ702161 Behar 2012b
                           
            H1n3  A7295G                HQ658482  
                           
            H1n4  G11914A!                JQ703765 JQ702043 Behar 2012b
                           
               T195C!                HQ839859  
                             
              H1n5  T471C              JQ703312 Behar 2012b
                           
          H1n6  C552a  A11551G  T14221C              JQ704613 Behar 2012b
                           
        H1o  C150T  A14053G  C16355T                JQ702360 JQ324594 Behar 2008a, Behar 2012b
                           
        H1p  A13470G                    EF556184 Behar 2008a
                           
        H1q  T4859C                    JQ704630 JQ703742 Behar 2012b
                           
          H1q1  A12366G                  JQ324843 JQ704373 Behar 2012b
                           
          H1q2  T15941C                  JQ324535  
                           
        H1r  C9356T                    JQ705944 GQ888727 García 2011, Behar 2012b
                           
        H1s  G8572A                    GQ478575 EU080974  
                           
        H1t  G9986A                    JQ704194 García 2011, Behar 2012b
                           
          H1t1  C14129T                  JQ324837  
                           
            H1t1a  A14224G                JQ324688 GQ888724 García 2011 ("H1t1"), Behar 2012a
                           
              H1t1a1  C16266T              JQ324800 JQ324838 Behar 2012a
                           
          H1t2  A5978G                  GQ888725 EF177427 García 2011
                           
        H1u  C9923T                    JQ702726 JQ705383 Behar 2012b
                           
          H1u1  A7975G                  AY495103 JQ702971 Behar 2012b
                           
        H1v  C10314T                    FJ460532 JQ703465 Ottoni 2010, Behar 2012b
                           
          H1v1  T4313C                  Ottoni 2010
                           
            H1v1a  T9148C                HM171271 Ottoni 2010
                           
            H1v1b  G14560A                HM171273 Ottoni 2010
                           
        H1w  T8966C                    HM171275 HM171277 Ottoni 2010
                           
        H1x  A7765G  T10410a  A16037G  C16256T              HM171279 HM171278 Ottoni 2010
                           
        H1ae  G15553A                    JQ705436 Behar 2012b
                           
          H1ae1  A8470G                  JQ702071 JQ704433 Behar 2012b
                           
          H1ae2  G11696A                  HQ400746 JQ704032 Behar 2012b
                           
          H1ae3  G8723A  G12771A                 
                           
            H1ae3a  G5231A                JQ703756 JQ704509 Behar 2012b
                           
        H1af  T16357C                    JQ704303 JQ705435 Behar 2012b
                           
          H1af1  C15646T                  JQ703129 Behar 2012b
                           
            H1af1a  T9078C                GQ888707 JQ703089 Behar 2012b
                           
          H1af2  C4137T                  FJ656214  
                           
        H1ag  G14869A                     
                           
          H1ag1  A6272G                  JQ703316 JQ704657 Behar 2012b
                           
            H1ag1a  G12940A  C16218T              JQ703938 GQ175058 Behar 2012b
                           
            H1ag1b  G6734A                JQ704170 JQ702557 Behar 2012b
                           
        H1ah  G8950A  A12507G                  JQ703687 Behar 2012b
                           
          H1ah1  (A200G)  A3411G  C7412T  C16248T            JQ324708 JQ702002 Behar 2012b
                           
        H1ai  C15088T                     
                           
          H1ai1  G6722A                  JQ701969 EU675941 Behar 2012b
                           
        H1aj  A14133G                    JQ703262 Behar 2012b
                           
          H1aj1  T8618C  C16192T                JQ703788 Behar 2012b
                           
        H1ak  G3666A                    JQ702623 AY738979 Behar 2012b
                           
          H1ak1  T5393C                  JQ324892  
                           
          H1ak2  A4435G                  JQ324884 JQ324782  
                           
        H1am  C4763a                    JQ703706 Behar 2012b
                           
          H1am1  C5309g                  HM488738  
                           
        H1ao  A93G  T146C!  T11809C  C16278T!                JQ704226 JQ704336 Behar 2012b
                           
          H1ao1  G11914A!                  JQ704235 GQ334714 Behar 2012b
                           
        H1ap  C8410T                     
                           
          H1ap1  T152C!  G5780A  T16189C!              JQ704669 JQ705078 Behar 2012b
                           
        H1aq  T13386C                    EU597511 JQ324562  
                           
          H1aq1  C15304a  C16218T                JQ703371 JQ702907 Behar 2012b
                           
        H1ar  A183G  T16468C                  JQ324931  
                           
          H1ar1  A11890G  A16302G                JQ704291 JQ704671 Behar 2012b
                           
        H1as  T4688C                    JQ702701 Behar 2012b
                           
          H1as1  C150T  T6216C                JQ703561 Behar 2012b
                           
            H1as1a  C16261T                JQ704158 EF177421 Behar 2012b
                           
          H1as2  T980C                  JQ704370 JQ702495 Behar 2012b
                           
        H1at  A15758G                    JQ324928  
                           
          H1at1  G7337A                  JQ703224 Behar 2012b
                           
            H1at1a  T12136C                JQ704066 FJ858266 Behar 2012b
                           
        H1au  C16148T                    GU981676  
                           
          H1au1  C11515a                   
                           
            H1au1a  G1664A                JQ703256 JQ703506 Behar 2012b
                           
            H1au1b  G1719A                GU207871 JQ704010 Behar 2012b
                           
        H1av  G7762A                    JQ705362 JQ704538 Behar 2012b
                           
          H1av1  C150T                  JQ324719 JQ324841 Behar 2012a
                           
            H1av1a  A4674G                JQ324552 JQ324605 Behar 2012a
                           
        H1aw  T460C  A8701G!  G16129A!                JQ324713 GQ150344  
                           
        H1ax  G5054c  C7471T  C8429T                HM625711 JQ704285 Behar 2012b
                           
        H1ay  T9708C                    JQ703923 JQ704587 Behar 2012b
                           
        H1az  A8308G                    JQ702269 JQ704564 Behar 2012b
                           
        H1ba  C16270T                    JQ702799 HM765465 Behar 2012b
                           
        H1bc  T152C!  G10325A                  JQ704162 JQ702634 Behar 2012b
                           
        H1bd  G9966A                    JQ704553 Behar 2012b
                           
        H1be  A10750G  C13035T                  JQ703681 JQ704424 Behar 2012b
                           
           C16239T                    JQ704230 JQ705157 Behar 2012b
                             
          H1bf  T13768C                  JQ704186 Behar 2012b
                           
            H1bf1  C16242T                JQ324584 HM103354  
                           
          H1bg  G5054A  C7849T                JQ703148 JQ704588 Behar 2012b
                           
          H1bh  G11377A                  JQ703668 JQ704647 Behar 2012b
                           
        H1bi  G3745A                    JQ704212 JQ704435 Behar 2012b
                           
        H1bj  A10295G                    JQ704756 Behar 2012b
                           
        H1bk  A11084G                    JQ703132 JQ705754 Behar 2012b
                           
        H1bm  T4216C                    JQ705579 JQ704794 Behar 2012b
                           
        H1bn  A8245G                    JQ703317 JQ705138 Behar 2012b
                           
        H1bo  T267C  T485C  G6446t  A11002G  A15844G              EF556177 JQ702570 Behar 2012b
                           
        H1bp  T10003C                    AY738977  
                           
        H1bq  A14467G                    JQ703346 JQ324662 Behar 2012b
                           
        H1br  T10454C                    JQ704089 JQ704606 Behar 2012b
                           
        H1bs  A16220c                    JQ324633 JQ703571 Behar 2012b
                           
        H1bt  C16527T                     
                           
          H1bt1  T10348C  G12007A                JQ703244 JQ704419 Behar 2012b
                           
        H1bu  A1811G  A5558G                  JQ703635 Behar 2012b
                           
        H1bv  T12681C                     
                           
          H1bv1  C8164T  T16362C                JQ324778 JQ324723  
                           
        H1bw  C8478T                    JQ704366 JQ702483 Behar 2012b
                           
        H1bx  T789C  C8740T                  JQ324627 JQ324844  
                           
        H1by  G9921A                    JQ324820  
                           
        H1bz  C1531T  G4924A  A16240G                JQ898578  
                             
      H2  G1438A                      Achilli 2004 (""), Roostalu 2007
                           
        H2a  G4769A                    EU597492 GU592029 Loogväli 2004 ("H2"), Achilli 2004 ("H2"), Roostalu 2007
                           
          H2a1  G951A  C16354T                FJ238053 JQ704025 Loogväli 2004, Roostalu 2007, Behar 2012b
                           
            H2a1a  C6173T  T13095C              FJ668389 HQ667351  
                           
              H2a1a1  C979T  C3567T  G12127A  C13272T        JQ703397 JQ704198 Behar 2012b
                           
              H2a1a2  T6620C  T9862a  A11077G  T14494C        JQ701848 JQ703509 Behar 2012b
                           
            H2a1b  A5978G  A13395G              JQ703223 JQ703204 Behar 2012b
                           
            H2a1c  G3834A                JQ703582 EU597521 Behar 2012b
                           
            H2a1d  A4769G!  G6260A  A8679G            FJ161702 FJ800808  
                           
            H2a1e  C575T                JQ703145 JQ324896 Behar 2012b
                           
              H2a1e1  A751G              JQ704189 Behar 2012b
                           
                H2a1e1a  T16124C            FJ842614 JQ703366 Behar 2012b
                           
                  H2a1e1a1  C16148T  A16166G        JQ703214 HQ698266 Behar 2012b
                           
                H2a1e1b  A4715G  5899.XC          JQ704847 Behar 2012b
                           
            H2a1f  C16193T                HQ336422 JQ705806 Behar 2012b
                           
            H2a1g  G8065A                JQ705411 Behar 2012b
                           
          H2a2  G750A                  JQ704533 JQ703191 Loogväli 2004 ("H2b"), Roostalu 2007, Behar 2012b
                           
            H2a2a  G8860A  G15326A              GU122997 JQ701904 Behar 2012b
                           
              H2a2a1  G263A              NC_012920 HQ670226 Behar 2008b ("H2a2a")
                           
                H2a2a1a  G15314A            EU795361 EU157923  
                           
                H2a2a1b  A9299G            JQ702287 JQ704346 Behar 2012b
                           
                H2a2a1c  T6632C  A16051G           
                           
                H2a2a1d  T16172C            JQ704842 JQ705139 Behar 2012b
                           
              H2a2a2  T152C!  A6716G            JQ704269 EU716647 Behar 2012b
                           
               (A16235G)              JQ703290 JQ704337 Behar 2012b
                             
              H2a2b  C16291T              HQ914650 EU719115 Álvarez-Iglesias 2009 ("H2a2b1")
                           
                H2a2b1  A16293G            JQ705563 JQ705365 Behar 2012b
                           
                  H2a2b1a  C3388a          HM991709 JQ702368 Behar 2012b
                           
                    H2a2b1a1  C16400T        EF418606 JQ704361 Behar 2012b
                           
                H2a2b2  T8634C            JQ704140 EU444119 Behar 2012b
                           
                H2a2b3  T4080C            AY339426 JQ702309 Behar 2012b
                           
                H2a2b4  G5460A            JQ705734 JQ702900 Behar 2012b
                           
                H2a2b5  G14305A            HQ675041 JQ704565 Behar 2012b
                           
          H2a3  T10810C!  G16274A                AM263180 Achilli 2004 ("H2c"), Roostalu 2007
                           
            H2a3a  G1462A                 
                           
              H2a3a1  A2749G              JQ704220 Behar 2012b
                           
            H2a3b  A14693G                HQ659870 JQ703192 Behar 2012b
                           
          H2a4  C11140T                  AM263179 AM263181 Roostalu 2007
                           
          H2a5  G13708A                  JQ704214 JQ704563 Behar 2012b
                           
            H2a5a  A1842G                 
                           
              H2a5a1  C16291T              JQ324555 JQ324582 Catelli 2011 ("H2a5a"), Behar 2012a
                           
                H2a5a1a  T4592C            FJ527772 FJ527777 Pereira 2004 (""), Álvarez-Iglesias 2009 ("H2a5"), Catelli 2011 ("H2a5a1"), Behar 2012
                           
                H2a5a1b  T11233C            JF284817 AY738963 Catelli 2011 ("H2a5a2"), Behar 2012a
                           
            H2a5b  T8843C                JQ701826 JQ703081 Behar 2012b
                           
              H2a5b1  A249d              JQ704687 JQ702205 Behar 2012b
                           
              H2a5b2  A11086G  A16183G            HQ153430  
                           
           T152C!  T16311C!                   
                             
          H2b  T8598C                  EU597574 HQ659667 Roostalu 2007
                           
          H2c  G13708A  C13934T                JQ704503 JQ701885 Behar 2012b
                           
            H2c1  C152T!!  C194T  G205A  A3334G            JQ704496 JQ704499 Behar 2012b
                           
      H3  T6776C                      AY738987 HQ659688 Loogväli 2004, Achilli 2004, Roostalu 2007
                           
           T152C!                    JQ702087 JQ703549 Behar 2012b
                             
          H3a  C16239g                  JQ704834 Behar 2012b
                           
            H3a1  T13404C                JQ704253 AY738986 Achilli 2004 ("H3a"), Roostalu 2007 ("H3a"), Behar 2012b
                           
              H3a1a  C14125T              JQ705329 JQ704348 Behar 2012b
                           
          H3g  A10754c                  AY495132 AY495142  
                           
            H3g1  C3992T  T4418C              JQ705181 JQ704782 Behar 2012b
                           
              H3g1a  A15377G              JQ705694 Behar 2012b
                           
              H3g1b  G8950A              JQ702329 JQ705545 Behar 2012b
                           
            H3g2  A735G                JQ704542 JQ704455 Behar 2012b
                           
            H3g3  G9196A                JQ705080 JQ704338 Behar 2012b
                           
            H3g4  A13611G                JQ702762 JQ704722 Behar 2012b
                           
          H3i  C5893T                  JQ703118 JN202491 Behar 2012b
                           
            H3i1  C5213T                GQ165466 AY495131  
                           
          H3j  T6351C                  HQ696491 JQ703265 Behar 2012b
                           
          H3k  A14687G                  JQ704704 JQ324804 Behar 2012b
                           
            H3k1  A11590G                 
                           
              H3k1a  A12217G              AY495130 JQ705110 Behar 2012b
                           
        H3b  A2581G                    JQ705823 JQ703416 Roostalu 2007, Behar 2012b
                           
             G16129A!                  AY495148 JQ705735 Behar 2012b
                             
            H3b1  G5147A  C16256T               
                           
              H3b1a  C1290T              JQ704748 JQ704958 Behar 2012b
                           
              H3b1b  A153G              JQ704932 JQ704456 Behar 2012b
                           
                H3b1b1  G13813A  C16111T          JQ703382 HQ661845 Behar 2012b
                           
                  H3b1b1a  C3832a          JQ704105 Behar 2012b
                           
            H3b2  T6638C                AY495155 JQ702921 Behar 2012b
                           
            H3b3  G4924A                JQ703291 Behar 2012b
                           
            H3b4  G417A                JQ704197 JQ705727 Behar 2012b
                           
            H3b5  C5911T                HQ384186 AY738988  
                             
        H3c  T12957C                    JQ324618 JQ703744 Roostalu 2007, Behar 2012b
                           
          H3c1  A1536G                  AY738990 JQ703410 Behar 2012b
                           
          H3c2  T195C!  C16176T                JQ705425 Behar 2012b
                           
            H3c2a  T14200C                JQ324828 JQ324785 Behar 2012a
                           
              H3c2a1  T6425C              JQ324731 JQ324776 Behar 2012a
                           
            H3c2b  G14305A                JQ704172 Behar 2012b
                           
              H3c2b1  G1211A              JQ705340 Behar 2012b
                           
            H3c2c  C5896T                JQ324848 JQ324704  
                           
          H3c3  G260A  A15769G  C16278T!              JQ702603 Behar 2012b
                           
           A73G!                    Álvarez-Iglesias 2009 ("H3d")
                             
          H3d  A761G                  AY495180 AY738983  
                           
        H3e  A1618G  A15592G                  JQ324858 FJ348206  
                           
           T16311C!                    JQ702652 Behar 2012b
                             
          H3h  T12811C                  JQ324559 HM636799 Achilli 2011
                           
            H3h1  T8705C                JQ086344 JQ703677 Behar 2012b
                           
            H3h2  C5960T                JQ704611 JQ704595 Behar 2012b
                           
            H3h3  C13967T                HM003111  
                           
              H3h3a  T15470C              JQ704436 JQ704979 Behar 2012b
                           
            H3h4  T146C!  T217C  T11944C  C13713T            JQ704484 FJ349555 Behar 2012b
                           
            H3h5  G10589A                JQ705041 Behar 2012b
                           
          H3m  A14501G                  JQ702092 JQ704363 Behar 2012b
                           
          H3n  C15781T  C16104T  C16176T              JQ704633 JQ703381 Behar 2012b
                           
        H3p  C16222T                    JQ704490 JQ704133 Behar 2012b
                           
        H3q  C3970T                    JQ704318 JQ703230 Behar 2012b
                           
          H3q1  G12236A                  GU592027  
                           
        H3r  T961C                    JN112339 JQ704887 Behar 2012b
                           
          H3r1  G1888A                  JQ705853 EF660938 Behar 2012b
                           
        H3s  C194T  A6953G  A13105G!                JQ704120 JQ324916 Behar 2012b
                           
        H3t  T7148C                    JQ705887 JQ702220 Behar 2012b
                           
        H3u  G9966A                    DQ523647  
                           
          H3u1  5899.XC  T14319C  A15380G  C16148T            AB626610 JQ705759 Behar 2012b
                           
        H3v  T408a                    JQ704903 Behar 2012b
                           
          H3v1  T3345C  C8841T  T9117C  G10685A            JQ703289 JQ703185 Behar 2012b
                           
             T16093C                  GU997629 JQ703387 Behar 2012b
                             
            H3v2  A73G!  T8939C  C12401T  A14148G          JQ704545 Behar 2012b
                           
        H3w  C3613T  T5999C  C16248T                JQ703544 FJ460550 Behar 2012b
                           
        H3x  T16368C                    JQ324817 JQ324537  
                           
          H3x1  A3615G  T8937C  G11914A!  A16293G            DQ523662 DQ523643  
                           
        H3y  T2352C  G4512A  A5480G                JQ703094 JQ705116 Behar 2012b
                           
        H3z  T293C                    JQ705915 JQ704178 Behar 2012b
                           
          H3z1  C12346T  T15530C                JQ703690 JQ324932 Behar 2012b
                           
        H3aa  T10535C                    JQ704638 JQ705422 Behar 2012b
                           
        H3ab  T4386C  T10724C                  JQ324666 JN409387  
                           
        H3ac  A6266G                    HQ658608 JQ702127 Behar 2012b
                           
        H3ad  G5054c                    JQ703272 JQ702774 Behar 2012b
                           
        H3ae  T12441C                    JQ705905 JQ703598 Behar 2012b
                           
        H3af  A8470G  G16129A!                  AY495156 JQ324794  
                           
        H3ag  T6293C                    JQ705124 Behar 2012b
                           
        H3ah  A10247G                    JN107813 JQ324638  
                           
        H3ai  C9693T                    JQ705437 JQ324769 Behar 2012b
                           
        H3aj  A8718G                    JQ701983 JQ704135 Behar 2012b
                           
        H3ak  G143A  T9325C  T16362C                AY195746 JQ704482 Behar 2012b
                           
        H3am  C182T!!                    JQ324634 JQ324847  
                           
        H3an  G251A                    JQ703304 Behar 2012b
                           
        H3ao  C16256T                    JQ324567 JQ704232 Behar 2012b
                           
          H3ao1  A16170G                  JQ704183 JQ705341 Behar 2012b
                           
        H3ap  T10915C!                    JQ703140 JQ704528 Behar 2012b
                           
        H3aq  G1018A!                    JN674560 JQ704383 Behar 2012b
                           
        H3ar  G10310A                    JQ702687 Behar 2012b
                           
        H3as  T9316C                    JQ704192 JQ702769 Behar 2012b
                           
        H3at  C15224T                    JQ324640  
                           
          H3at1  2156.1A  G9525A                JQ324851 JQ324906  
                           
        H3au  G12372A                    JQ704477 JQ324572 Behar 2012b
                           
           T16189C!                    JQ324574  
                             
          H3av  T152C!  C7849T  T8383C              JQ324687 JQ324566  
                           
      H4  C3992T  T5004C  G9123A                    EU935460 JQ701843 Roostalu 2007, Behar 2012b
                           
        H4a  A4024G  A14582G                  JQ702936 Behar 2012b
                           
          H4a1  C14365T                  AY495123 EF177440 Loogväli 2004 ("H4"), Roostalu 2007 ("H4a")
                           
            H4a1a  G8269A                HQ860291 EU051827 Loogväli 2004 ("H4a"), Roostalu 2007 ("H4a1")
                           
              H4a1a1  A10044G              AY495095 JQ703368