| PhyloTree.org - mtDNA subtree U | ||||||||||||||||||
| Citation: van Oven M, Kayser M. 2009. Updated comprehensive phylogenetic tree of global human mitochondrial DNA variation. Hum Mutat 30(2):E386-E394. doi:10.1002/humu.20921 | ||||||||||||||||||
| Nucleotide position numbers are relative to the RSRS and rCRS. Mutations are given in forward evolutionary time direction. In case of a transversion the derived allele is shown in lowercase. | ||||||||||||||||||
| Coding region mutations (np 577-16023) are shown in black; control region mutations (np 16024-576) in blue. | ||||||||||||||||||
| Back mutations to an ancestral state are indicated with an exclamation mark (!), two exclamation marks for a double back mutation (!!), etc. | ||||||||||||||||||
| Mutations between brackets () are recurrent/unstable within the respective clade, or are yet uncertain based on current data. | ||||||||||||||||||
| Mutation motifs in italic are preliminary and are likely to be further refined as additional sequences become available. | ||||||||||||||||||
| The mutations 309.1C(C), 315.1C, AC indels at 515-522, 16182C, 16183C, 16193.1C(C) and 16519 were not considered for phylogenetic reconstruction and are therefore excluded from the tree. | ||||||||||||||||||
| Accession numbers provided at the tips of branches are representative examples of mtDNA sequences available at GenBank or from individuals included in HapMap/1000Genomes. | ||||||||||||||||||
| The references are independent from the accession numbers and refer to publications that have described the corresponding branch and/or have proposed haplogroup nomenclature. | ||||||||||||||||||
| A list of the references cited is available here. | ||||||||||||||||||
| It may be convenient to use the Find function (Ctrl+F) of your browser to search for a particular mutation or haplogroup. | ||||||||||||||||||
| Example accessions | References | |||||||||||||||||
| U | A11467G A12308G G12372A | Achilli 2005, Palanichamy 2004 | ||||||||||||||||
| U1 | C285T T12879C A13104G A14070G G15148A A15954c T16249C | Achilli 2005, Behar 2008a | ||||||||||||||||
| U1a'c | C2218T G14364A T16189C! | HM852844 | Behar 2008a ("U1ab") | |||||||||||||||
| U1a | G4991A G6026A T7581C | HM852790 | Achilli 2005, Palanichamy 2004, Behar 2008a | |||||||||||||||
| U1a1 | A385G 3158.1T G3591A A13422G | AY882396 | Behar 2008a, Behar 2012b | |||||||||||||||
| U1a1a | G9575A | HQ615882 | HM156682 | |||||||||||||||
| U1a1b | C262T T4561C | JQ703793 | JX289842 | |||||||||||||||
| U1a2 | T152C! A8730G A16166d T16311C! | JQ704153 | EF556157 | Behar 2008a, Behar 2012b | ||||||||||||||
| U1a3 | T15115C G15217A | JQ704034 | DQ523621 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| U1a4 | C16242T T16362C | EF692533 | HM241417 | |||||||||||||||
| U1c | T152C! 455.1T G5147A G8790A G11440A T12136C T16093C G16129A! C16222T | EF556194 | Behar 2008a ("U1b") | |||||||||||||||
| U1b | T146C! T2387C C8395T T10885C A11566G G15172A C16111T C16327T | GU123007 | AY882397 | Achilli 2005 | ||||||||||||||
| U1b1 | G15110A | JQ705704 | HQ325737 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| U5 | T3197C G9477A T13617C C16192T C16270T | Achilli 2005, Palanichamy 2004, Malyarchuk 2010a | ||||||||||||||||
| U5a | A14793G C16256T | Achilli 2005, Palanichamy 2004 | ||||||||||||||||
| U5a1 | A15218G A16399G | GU296570 | JQ705326 | Achilli 2005, Palanichamy 2004, Behar 2012b | ||||||||||||||
| T16192C! | ||||||||||||||||||
| U5a1a | T1700C | |||||||||||||||||
| U5a1a1 | T5495C A15924G | EU523128 | DQ785296 | |||||||||||||||
| T152C! | GU296601 | GU296636 | ||||||||||||||||
| U5a1a1a | A3816G | DQ904330 | GU296558 | |||||||||||||||
| U5a1a1b | G15110A | JQ703937 | GU296652 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| U5a1a1c | A6905G T13015C | JQ703590 | JQ704022 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| T16362C | JQ704920 | Behar 2012b | ||||||||||||||||
| U5a1a1d | G185A T204C | GU459066 | GQ160809 | |||||||||||||||
| U5a1a1e | T9682C | JQ705621 | JQ704796 | |||||||||||||||
| U5a1a2 | 573.XC C12346T | |||||||||||||||||
| U5a1a2a | A5319G A6629G T6719C | GU296557 | JQ704990 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| U5a1a2a1 | T6293C | JQ703926 | JQ702568 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| U5a1a2b | A13105G! | JQ704701 | GU296543 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| U5a1a2b1 | G8269A T10326a T14278C | JQ705279 | JQ702496 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| U5a1g | C7792T | GU296640 | JN412063 | |||||||||||||||
| U5a1b | A9667G | JX141361 | EU597499 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| U5a1b1 | C16291T | JQ702714 | JQ701970 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| U5a1b1a | T4553C | JQ703963 | JQ691414 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| U5a1b1a1 | C14574T | JQ705245 | JQ706015 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| U5a1b1b | T8119C | GU296619 | GU296614 | |||||||||||||||
| U5a1b1c | G9055A | EU140330 | GU296610 | |||||||||||||||
| U5a1b1c1 | T1187C | JQ705297 | FJ493508 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| U5a1b1c2 | G3705A G16129A! | JQ704028 | GU296628 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| U5a1b1d | A12358G | JQ705693 | JQ702400 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| U5a1b1e | A12582G | JQ705211 | JQ704679 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| U5a1b1f | G15596A G16129A! | AY714003 | JQ702552 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| U5a1b2 | A9632G | GU296562 | GU296569 | |||||||||||||||
| T16362C | JQ704045 | Behar 2012b | ||||||||||||||||
| U5a1b3 | G16428A | JQ703331 | AY339529 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| U5a1b4 | A12331G | JN897375 | HM171295 | |||||||||||||||
| U5a1c | C16320T | |||||||||||||||||
| U5a1c1 | T195C! C13802T | GU296588 | JQ705573 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| U5a1c2 | T961C | GU296589 | ||||||||||||||||
| U5a1c2a | A183G C10544T | JQ705908 | JQ704555 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| U5a1d | T3027C | |||||||||||||||||
| U5a1d1 | C5263T C13002a | GU296542 | GU296612 | |||||||||||||||
| U5a1d2 | 573.XC T3552C | |||||||||||||||||
| U5a1d2a | T195C! T4823C C5583T G16145A T16189C! | HM173090 | JQ704700 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| U5a1d2a1 | C6584T C6836T | GU296655 | GU296599 | |||||||||||||||
| U5a1d2b | G4924c T10858C T14110C G15217A T16304C | GU123032 | JQ705737 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| U5a1e | A3564G T8610C | GU296547 | GU296625 | |||||||||||||||
| U5a1f | G6023A | GU296603 | ||||||||||||||||
| U5a1f1 | G5585A A7569G T16311C! | JQ702160 | DQ112764 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| U5a1f1a | T199C G8251A | AY882398 | JQ704962 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| U5a1f1a1 | G16526A | JQ702735 | JQ702225 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| U5a1h | C150T G1303A C3192T G3591A T4592C C11296T C11938T G12618A C16239T | JQ704026 | JQ705910 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| U5a2 | G16526A | |||||||||||||||||
| U5a2a | C16114a C16294T | JN707685 | ||||||||||||||||
| U5a2a1 | A13827G G13928c | GU296615 | JQ703936 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| U5a2a1a | G12630A T16271C | AY339524 | GU391321 | |||||||||||||||
| U5a2a1b | T13015C | GU296626 | HM246245 | |||||||||||||||
| U5a2a1b1 | T252C | JQ702355 | HM765474 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| U5a2a1c | C9293T | GU296597 | GU296650 | |||||||||||||||
| U5a2a1d | T4232C G4655A A11893G | EU124886 | JQ703988 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| T152C! | JQ704074 | JQ703335 | ||||||||||||||||
| U5a2a1e | G14198A | AY339527 | JX171113 | |||||||||||||||
| U5a2b | G9548A | GU296559 | GU371930 | |||||||||||||||
| U5a2b1 | 960.XC | GU296624 | GU296629 | |||||||||||||||
| U5a2b1a | T12441C | JQ705696 | GU296651 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| U5a2b1b | C16465T | JQ704044 | GU296607 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| U5a2b2 | G10685A T11984C G12308A! A12654G A13269G A13285G | JQ702184 | GU296587 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| U5a2b3 | T455d C13351T C14684T C16168T | JQ702847 | JQ702230 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| U5a2b4 | G15301A!! | JQ704895 | JQ702320 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| U5a2c | C10619T | JQ703187 | GU012633 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| U5a2c1 | C9469T | FJ460558 | EU151864 | |||||||||||||||
| U5a2c2 | A10768G | JQ704067 | EF660950 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| U5a2c3 | T11465C T16192C! | JX101637 | Behar 2012b | |||||||||||||||
| U5a2c3a | A7960c A10709c | JF487827 | EU049814 | |||||||||||||||
| U5a2c4 | G3531A | JQ705779 | GU296611 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| U5a2d | A7843G | JQ703280 | JQ702144 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| U5a2d1 | C3750T C7978T T8104C C11107T T16192C! | HM490393 | JN604831 | |||||||||||||||
| T16362C | JQ705111 | Behar 2012b | ||||||||||||||||
| U5a2e | C151T T152C! A3768G T15289C T16311C! | JN819535 | GU296648 | |||||||||||||||
| U5b | C150T A7768G T14182C | Achilli 2005, Palanichamy 2004 | ||||||||||||||||
| U5b1 | A5656G | JQ704112 | Achilli 2005, Behar 2012b | |||||||||||||||
| T16189C! | EF420876 | Achilli 2005 | ||||||||||||||||
| U5b1a | T7028C T15097C | JQ704875 | GU296590 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| U5b1b | G12618A | GU296644 | ||||||||||||||||
| U5b1b1 | A7385G T10927C | GU296566 | Achilli 2005 ("U5b1b") | |||||||||||||||
| T16192C! | JN897374 | AY882400 | ||||||||||||||||
| U5b1b1a | T16144C | AY882403 | DQ902697 | Achilli 2005 | ||||||||||||||
| U5b1b1a1 | C4059T | DQ902696 | AY882404 | |||||||||||||||
| U5b1b1a1a | C1341T | HM116534 | GU296598 | |||||||||||||||
| U5b1b1a2 | T10907C | EF420877 | JX171119 | |||||||||||||||
| U5b1b1d | G15884A | AY882402 | AY882401 | |||||||||||||||
| U5b1b1f | A1047G | GU296591 | JQ705418 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| U5b1b1b | A8413G C16320T | AY882407 | DQ282508 | |||||||||||||||
| T152C! | AF381989 | |||||||||||||||||
| U5b1b1e | T2387C | JQ704517 | AY882408 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| U5b1b2 | T217C | AY339536 | EU367993 | Tambets 2004 ("U5b1a"), Ingman 2007 ("U5b1a") | ||||||||||||||
| U5b1c | T15191C T16311C! | AY882409 | Achilli 2005 | |||||||||||||||
| U5b1c1 | G16336A | JQ705870 | Behar 2012b | |||||||||||||||
| U5b1c1a | T55a | JQ705095 | JQ408439 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| U5b1c2 | C516T C16174T | JQ703983 | DQ661681 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| U5b1c2a | T16140C T16192C! T16288C | EU597535 | JQ703944 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| U5b1c2b | C6341T G13194A | JQ704043 | JQ705473 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| T16192C! | JQ704598 | GU296582 | Behar 2012b | |||||||||||||||
| U5b1e | T152C! A2757G A10283G T12616C | GU296630 | JQ705742 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| U5b1e1 | C16465T | GU122991 | GU295665 | |||||||||||||||
| U5b1e1a | T4209C | FJ499497 | GU296571 | |||||||||||||||
| U5b1h | A384G | JQ705183 | JQ704053 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| U5b1d | C5437T | |||||||||||||||||
| U5b1d1 | T15721C | JQ702807 | Achilli 2005, Behar 2012b | |||||||||||||||
| U5b1d1a | T742C G15355A T16192C! | JQ702376 | AY882412 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| U5b1d1b | T199C C2225a C3507T T8277C T10084C T12136C | AY882411 | JX156641 | |||||||||||||||
| U5b1d1c | G7912A A15631G C16218T C16320T | GU977214 | HQ287878 | |||||||||||||||
| U5b1d2 | T7085C C16239T | HM043711 | JF436855 | |||||||||||||||
| U5b1f | A533G C3507a | HQ675036 | JX286537 | Seoane 2011 | ||||||||||||||
| U5b1g | C151T G228A 573.XC C10654T G13759A T14577C | HQ384206 | HQ675038 | Gómez-Carballa 2011 ("U5b1e") | ||||||||||||||
| U5b1i | A3105G C3498T T6674C G15777A C16167T T16311C T16356C | JQ681270 | DQ523645 | |||||||||||||||
| U5b2 | C1721T A13637G | JQ705429 | Achilli 2005, Behar 2012b | |||||||||||||||
| U5b2a | A4732G T16189C! | |||||||||||||||||
| U5b2a1 | T16270C! | |||||||||||||||||
| U5b2a1a | T15511C C16189T!! | JQ703964 | Behar 2012b | |||||||||||||||
| T16311C! | JQ704726 | Behar 2012b | ||||||||||||||||
| U5b2a1a1 | A896G | EU244000 | GQ853200 | |||||||||||||||
| U5b2a1a1a | G12406A | JQ701915 | JQ702021 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| U5b2a1a1b | A249d | EU784076 | JQ703942 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| U5b2a1a2 | T1834C C5452T T8705C A15924G T16192C! | GU296621 | AY882413 | |||||||||||||||
| U5b2a1b | T152C! T5918C G14323A T16192C! T16325C | EU182656 | FJ887848 | |||||||||||||||
| U5b2a2 | C3212T G16398A | GU296541 | ||||||||||||||||
| U5b2a2a | T12136C | JQ705158 | Behar 2012b | |||||||||||||||
| U5b2a2a1 | T9682C | AY882415 | GU296552 | |||||||||||||||
| U5b2a2a2 | T5508C G10589A | JQ702167 | DQ112820 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| U5b2a2b | A2757G T14956C | EF459670 | JN969984 | |||||||||||||||
| U5b2a2b1 | C4843T | GU296567 | HM130562 | |||||||||||||||
| U5b2a2c | T12678C T16192C! C16261T T16304C | JQ702431 | JQ705688 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| U5b2a3 | T10031C | EU682506 | EF420249 | |||||||||||||||
| T16192C! | ||||||||||||||||||
| U5b2a4 | A3397G G13368A T14767C | JQ705337 | Behar 2012b | |||||||||||||||
| U5b2a4a | T6293C | JQ705419 | JQ705298 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| U5b2a5 | A8706G C10654T A11725G T16311C! | EU233797 | JQ290366 | |||||||||||||||
| U5b2a6 | A4129G | JQ704771 | JQ703796 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| U5b2b | A11653G A12634G A13630G T16192C! | JQ706019 | JQ704572 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| U5b2b1 | G15497A | |||||||||||||||||
| U5b2b1a | A3861G T16362C | |||||||||||||||||
| U5b2b1a1 | C16292T | JQ703905 | EU594543 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| U5b2b1a2 | T12696C A16240c | GU296627 | JQ703780 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| U5b2b1b | C13420T G16526A | GU296641 | JQ702927 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| U5b2b2 | C4616T G8027A | EF419891 | GQ132188 | |||||||||||||||
| U5b2b3 | A517t A2755G T15905C T16224C | JQ702136 | JQ705577 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| U5b2b3a | T279C T3338C G5261A | JQ702843 | Behar 2012b | |||||||||||||||
| U5b2b3a1 | A9494G | JQ702046 | Behar 2012b | |||||||||||||||
| U5b2b3a1a | C16114T | JQ703790 | FJ916904 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| U5b2b4 | A9670G T16189C! | JQ702585 | JQ705877 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| U5b2c | A723G 960.XC A13017G | |||||||||||||||||
| U5b2c1 | C6920a A13434G | JX186998 | JQ702406 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| U5b2c2 | A3861G A5836G A10262G | JF265240 | ||||||||||||||||
| U5b2c2a | G14259A | JQ705947 | JQ702625 | |||||||||||||||
| U5b2c2b | T16249C | EU490797 | JQ703980 | |||||||||||||||
| U5b3 | (G228A) G7226A T16304C | JQ705968 | GQ129144 | Pala 2009, Behar 2012b | ||||||||||||||
| U5b3a | A16235G | Pala 2009 | ||||||||||||||||
| U5b3a1 | C16169a | Pala 2009 | ||||||||||||||||
| U5b3a1a | A373G C11177T C16304T! | AF346988 | GQ129152 | Pala 2009, Fraumene 2006 ("U5b3") | ||||||||||||||
| U5b3a1b | C15781T | GQ129157 | GQ129158 | Pala 2009 | ||||||||||||||
| U5b3a2 | A10978G | GQ129163 | GQ129164 | Pala 2009 | ||||||||||||||
| U5b3b | G9196A | GQ129167 | EU130681 | Pala 2009 | ||||||||||||||
| U5b3c | A4775G T5557C A6461G | GQ129170 | GQ129172 | Pala 2009 | ||||||||||||||
| U5b3d | T13830C C16067T T16311C! | GQ129173 | GQ129174 | Pala 2009 | ||||||||||||||
| U5b3e | T3535a A8701G! | JQ702295 | GQ129177 | Pala 2009, Behar 2012b | ||||||||||||||
| U5b3f | G16129A! | GQ129179 | GQ129180 | Pala 2009 | ||||||||||||||
| U5b3g | G5147A | GQ129143 | JQ689453 | |||||||||||||||
| U6 | A3348G T16172C | Maca-Meyer 2003, Olivieri 2006, Pereira 2010b | ||||||||||||||||
| U6a'b'd | A16219G | Maca-Meyer 2003, Olivieri 2006, Pereira 2010b | ||||||||||||||||
| U6a | G7805A A14179G C16278T! | EF064317 | Maca-Meyer 2003, Olivieri 2006, Pereira 2010b | |||||||||||||||
| U6a1 | A14927G | HQ651694 | Olivieri 2006, Pereira 2010b | |||||||||||||||
| U6a1a | C3969T T16189C! | |||||||||||||||||
| U6a1a1 | T4172a (C11938T) C16239T | AY275534 | HQ651688 | Pereira 2010b | ||||||||||||||
| U6a1a2 | G1472A G13759A | JQ704749 | JQ704539 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| U6a1b | A16235G | HQ651705 | EF064320 | Pereira 2010b, Behar 2012b | ||||||||||||||
| U6a1b1 | G11176A T12376g T12727C A15244G | HM775953 | HQ651693 | Pereira 2010b | ||||||||||||||
| U6a1b2 | T195C! G10364A C14562T | JQ702816 | HQ651696 | |||||||||||||||
| T16189C! | HQ651707 | Maca-Meyer 2003 ("U6a1"), Olivieri 2006, Pereira 2010b | ||||||||||||||||
| U6a2 | G103A C15626T | EF064322 | Olivieri 2006, Pereira 2010b | |||||||||||||||
| U6a2a | T9128C | HQ651712 | ||||||||||||||||
| U6a2a1 | C960d A6359G T11204C | EF064323 | AY882416 | Pereira 2010b | ||||||||||||||
| U6a3 | C15790T | HQ651714 | HQ651711 | Olivieri 2006, Pereira 2010b | ||||||||||||||
| U6a3a | G4820A | HQ651713 | JQ704099 | Pereira 2010b ("") | ||||||||||||||
| U6a3a1 | G14364A | HQ651686 | HQ585390 | |||||||||||||||
| G185A | EF064326 | JQ045007 | Pereira 2010b ("") | |||||||||||||||
| U6a3b | T146C! A188G | JQ044946 | ||||||||||||||||
| U6a3b1 | T152C! G1211A C11268T C13431T A15634G | EF064325 | HQ651704 | Pereira 2010b ("") | ||||||||||||||
| U6a4 | C150T C12246T T13674C T14215C T15862C C16134T | EF064327 | EF064328 | Olivieri 2006, Pereira 2010b | ||||||||||||||
| U6a5 | G3591A G7642A G13590A G15927A | EF064329 | EF064332 | Olivieri 2006, Pereira 2010b | ||||||||||||||
| U6a5a | A11590G | HQ592783 | EF064330 | Olivieri 2006, Pereira 2010b | ||||||||||||||
| U6a6 | C8407a G8557c C9779T A10700G A11734G C13440T | EF064333 | EF064334 | Olivieri 2006, Pereira 2010b | ||||||||||||||
| U6a7 | G15043A | Maca-Meyer 2003, Olivieri 2006, Pereira 2010b, Behar 2012b | ||||||||||||||||
| U6a7a | T794a T1193C A1692t A5120G G5471A T8473C T15530C C15632T | AY275531 | HQ843176 | Olivieri 2006, Pereira 2010b | ||||||||||||||
| U6a7b | T195C! C198T G709A A1842G A7735G A12950c G16219A! | EF064339 | AY275533 | Olivieri 2006 | ||||||||||||||
| U6a7c | G7337A T16189C! | HQ651683 | JQ702118 | |||||||||||||||
| T16311C! | Olivieri 2006, Pereira 2010b | |||||||||||||||||
| U6b | G9438A | AY275530 | FJ460538 | Maca-Meyer 2003, Olivieri 2006, Pereira 2010b, Behar 2012b | ||||||||||||||
| U6b1 | T2352C G9738A G15431A A16163G | HQ651678 | JQ704896 | Maca-Meyer 2003, Olivieri 2006, Pereira 2010b, Behar 2012b | ||||||||||||||
| U6b1a | C7700T | HQ651679 | EF064340 | Pereira 2010b | ||||||||||||||
| U6b2 | T4062C C12535T A13637G G15355A | JQ704008 | AY275527 | |||||||||||||||
| U6d | T4336C G12501A A14518G | EF064343 | HQ651681 | Olivieri 2006, Pereira 2010b | ||||||||||||||
| U6d1 | T4454C T14470C C16261T | HQ651684 | Pereira 2010b | |||||||||||||||
| U6d1a | G5147A | GU366066 | DQ523663 | |||||||||||||||
| U6d1b | C12603T | EF064342 | EF064341 | |||||||||||||||
| U6c | C150T C437T C793T G3688c A4965G T5081C C11013T T13879C A15244G C16169T T16189C! | AY275536 | Maca-Meyer 2003, Olivieri 2006, Pereira 2010b | |||||||||||||||
| U6c1 | G15553A G16129A! | HQ161773 | EF064344 | |||||||||||||||
| U2'3'4'7'8'9 | A1811G | Palanichamy 2004, Achilli 2005, Metspalu 2006 | ||||||||||||||||
| U2 | A16051G | FN600416 | Palanichamy 2004, Achilli 2005, Metspalu 2006 | |||||||||||||||
| U2a | (T195C!) A16206c A16230G! T16311C! | AY713992 | Palanichamy 2004, Achilli 2005, Metspalu 2006 | |||||||||||||||
| U2a1 | G8572A T16154C | JX488759 | AY882379 | |||||||||||||||
| U2b | T146C! G2706A A5186t C12106T G13194A C15049T | Palanichamy 2004, Achilli 2005 | ||||||||||||||||
| U2b1 | G3915A A4093G | HM156690 | AY714020 | |||||||||||||||
| U2b2 | T152C! A234G G1888A C9094T A9614G T12793C T13656C G15930A T16209C C16239T T16352C C16353T | AY714027 | AY882380 | |||||||||||||||
| T152C! | Achilli 2005 | |||||||||||||||||
| U2c'd | C16234T | |||||||||||||||||
| U2c | C5790a T14935C A15061G | AY714010 | Palanichamy 2004, Achilli 2005 | |||||||||||||||
| U2c1 | T8023C C8676T C9767T | AY714005 | AY882381 | |||||||||||||||
| U2d | T199C G263A T471C T1700C C4025T A8938G A11893G A14926G T16189C! C16294T | Palanichamy 2004, Malyarchuk 2008d | ||||||||||||||||
| U2d1 | A8982G C16184T T16342C | JQ706062 | EU440736 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| U2d2 | G5147A G5460A T6956C A8296G T13789C | JQ706046 | JQ706067 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| U2d3 | T1040C G6023A A7277G A7894G C16266T | JQ706045 | JQ706025 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| U2e | A508G A3720G A5390G T5426C C6045T T6152C A10876G T13020C T13734C A15907G G16129c T16189C! T16362C | AY714026 | Palanichamy 2004, Achilli 2005 | |||||||||||||||
| U2e1'2'3 | T217C | |||||||||||||||||
| U2e1 | C340T | JQ703356 | JQ703491 | Palanichamy 2004, Behar 2012b | ||||||||||||||
| U2e1a | C11197T T11732C | FJ828532 | ||||||||||||||||
| U2e1a1 | C3116T | AY882382 | FJ348194 | |||||||||||||||
| U2e1a1a | T3197C | JQ705936 | JQ705117 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| U2e1a1b | A108G | HQ424846 | JQ703203 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| U2e1b | G988A C16256T | AY714049 | JQ705946 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| U2e1b1 | C7109T T15784C C16362T! | JQ702663 | JQ703917 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| U2e1c | C7151T G11176A C12346T | JQ705933 | JQ701857 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| U2e1d | G4132A | JQ702520 | JQ704268 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| U2e1e | C2526T G12618A G16145A | JQ702316 | EF452294 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| U2e1f | T15519C T16311C! | AY195764 | JQ705813 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| U2e2 | T8473C C12557T (T16092C) | JQ705900 | Behar 2012b | |||||||||||||||
| U2e2a | G3849A T4553C | |||||||||||||||||
| U2e2a1 | T4736C | JQ703968 | JQ702432 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| U2e2a2 | T7624C A16525G | FJ984932 | EF528162 | |||||||||||||||
| U2e2a3 | A5686t | JQ705386 | JQ704627 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| U2e2a4 | G5746A | JQ702004 | JQ701890 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| U2e3 | C394T C16260T T16356C | JX286498 | ||||||||||||||||
| U2e3a | C309d C575T C3170a T15721C A16181G | JQ704102 | JQ702389 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| U3 | C150T A14139G T15454C A16343G | Behar 2008a, Achilli 2005 | ||||||||||||||||
| U3a'c | A2294G T4703C G9266A | |||||||||||||||||
| U3a | C6518T A10506G C13934T G16390A | JQ704440 | Achilli 2005, Behar 2012b | |||||||||||||||
| U3a1 | G3010A | JQ705387 | HM625682 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| U3a1a | G7521A! | GU122986 | JN203207 | |||||||||||||||
| U3a1b | A723c | JQ702681 | JQ702677 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| U3a1c | T16356C | JQ703769 | JQ705739 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| U3a2 | A200G T11050C | AY882383 | FJ348224 | |||||||||||||||
| U3c | T12843C A15613G C16193T T16249C G16526A | HM852803 | HM852797 | |||||||||||||||
| U3b | A4188G C4640a T9656C T13743C | JN663830 | AY714023 | Achilli 2005 | ||||||||||||||
| U3b1 | C3546a | EF177433 | JQ703911 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| U3b1a | A8812G T16086C | EF556158 | AY882385 | Behar 2008a ("U3b1") | ||||||||||||||
| U3b1b | A6359G A12720G | FJ711758 | JQ705043 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| U3b2 | T15944d | JQ704130 | JQ704981 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| U3b2a | A2707G T9770C | EU935438 | JN969086 | |||||||||||||||
| U3b3 | C16168T | HQ384204 | AY882384 | |||||||||||||||
| U4'9 | T195C! G499A T5999C | Achilli 2005 | ||||||||||||||||
| U4 | T4646C A6047G C11332T C14620T T15693C T16356C | Malyarchuk 2008a, Achilli 2005 | ||||||||||||||||
| U4a | C8818T | Malyarchuk 2008a, Achilli 2006 | ||||||||||||||||
| U4a1 | T152C! A12937G C16134T | JQ703947 | EU597575 | Malyarchuk 2008a, Behar 2012b | ||||||||||||||
| U4a1a | T961C | HQ659692 | JQ703887 | Malyarchuk 2008a, Behar 2012b | ||||||||||||||
| U4a1a1 | 965.XC | EU545417 | EU545451 | |||||||||||||||
| U4a1b | A745G C3204T | JQ702270 | EU545429 | Malyarchuk 2008a, Behar 2012b | ||||||||||||||
| U4a1b1 | C296T | EU545459 | GU252762 | Malyarchuk 2008a | ||||||||||||||
| U4a1c | G8155A A13158G T14110C C16234T | EU545428 | EU545427 | Malyarchuk 2008a | ||||||||||||||
| U4a1d | C198T | FJ493506 | GU123031 | |||||||||||||||
| U4a2 | T310C | EU545430 | JQ701841 | Malyarchuk 2008a, Behar 2012b | ||||||||||||||
| U4a2a | C16356T! | EF222249 | EU545461 | Malyarchuk 2008a | ||||||||||||||
| U4a2a1 | T8496C | EF222236 | EF222250 | Malyarchuk 2008a | ||||||||||||||
| U4a2b | C16223T! | GU123033 | EF222241 | Malyarchuk 2008a | ||||||||||||||
| U4a2c | T8567C | EU545464 | Malyarchuk 2008a | |||||||||||||||
| U4a2c1 | G6047A! C10654T C16242a T16288C T16362C | EF222252 | EF222242 | Malyarchuk 2008a | ||||||||||||||
| U4a2d | C16295T | EU545421 | JQ705152 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| U4a2e | A2246G G6383A | EU545442 | JQ702862 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| U4a2f | T1189C A1978G A12397G G15172A | JQ705828 | JQ704811 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| U4a2g | C6164T | JQ480650 | EU545434 | |||||||||||||||
| U4a2h | G5261A | EF222235 | JQ702549 | |||||||||||||||
| U4a3 | G247A! A2792G C6665T A6929G G8065A T16362C | EU545423 | EF060364 | Malyarchuk 2008a | ||||||||||||||
| U4b | T7705C | EU545444 | JQ702211 | Malyarchuk 2008a, Malyarchuk 2010b, Behar 2012b | ||||||||||||||
| U4b1 | T11339C | Malyarchuk 2008a, Achilli 2006, Malyarchuk 2010b | ||||||||||||||||
| U4b1a | A3672G | Malyarchuk 2008a | ||||||||||||||||
| U4b1a1 | T2083C T12297C | HM044301 | ||||||||||||||||
| U4b1a1a | C15789T | JQ705255 | JQ703912 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| U4b1a1a1 | A8642G T16362C | AY882388 | FJ460530 | |||||||||||||||
| U4b1a2 | C11143T G11176A T12609C G13708A | HM041972 | JQ701876 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| U4b1a2a | C15632T | EU545415 | JQ704098 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| U4b1a3 | T146C! A5752d T9989C C11674T | EU545419 | ||||||||||||||||
| U4b1a3a | A7265G | EU571946 | FJ858802 | |||||||||||||||
| U4b1a4 | G7853A C11965T T12957C | FJ147313 | FJ147316 | |||||||||||||||
| T146C! T152C! | FJ147315 | |||||||||||||||||
| U4b1b | A13528G | JQ704676 | Malyarchuk 2010b, Behar 2012b | |||||||||||||||
| U4b1b1 | C13565T | JQ705342 | JQ704155 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| U4b1b1a | C16111T T16140C | HM535647 | GU797476 | |||||||||||||||
| U4b2 | T16136C | EU140898 | ||||||||||||||||
| U4b2a | G15883A | JQ702783 | JQ701937 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| U4b2a1 | C16278T! | GQ891957 | GU365881 | |||||||||||||||
| U4b3 | A215G | FJ147322 | GU727823 | |||||||||||||||
| U4c | T10907C | Malyarchuk 2008a | ||||||||||||||||
| U4c1 | A4811G A6146G T9070g C14866T (C16179T) | EF657423 | EF657519 | Malyarchuk 2008a | ||||||||||||||
| U4c1a | T11009C | EU545465 | FJ348178 | |||||||||||||||
| U4c2 | T8705C C10676T | HQ418462 | ||||||||||||||||
| U4c2a | C16261T | EU545460 | JQ702690 | |||||||||||||||
| U4d | T629C 2405.1C | Malyarchuk 2008a, Malyarchuk 2010b | ||||||||||||||||
| U4d1 | C2772T | HQ167735 | Malyarchuk 2008a, Malyarchuk 2010b | |||||||||||||||
| U4d1a | A5984G C6938T | GU123021 | Malyarchuk 2010b | |||||||||||||||
| U4d1a1 | T8260C | JQ704741 | JQ702267 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| U4d1b | A13398G | EU545438 | GU122982 | Malyarchuk 2010b | ||||||||||||||
| U4d2 | T5567C C10692T C11326T G11518A A13105G! T16189C! | FJ230891 | EU545426 | Malyarchuk 2010b | ||||||||||||||
| U4d3 | 573.XC T14577C | GU727822 | ||||||||||||||||
| U9 | G3531A G3834A C6386T T14094C | Achilli 2005, Fornarino 2009 | ||||||||||||||||
| U9a | C195T!! A16051G C16278T! | AY882389 | Achilli 2005, Fornarino 2009 | |||||||||||||||
| U9a1 | T3290C G15077A C16193T T16357C | GU170820 | FJ770944 | Rani 2010 | ||||||||||||||
| U9b | A12615G | GU990521 | ||||||||||||||||
| U9b1 | 573.XC A9299G A11350G T13111C | AY882390 | EU597540 | Achilli 2005 | ||||||||||||||
| U7 | T152C! T980C C3741T C5360T C8137T C8684T C10142T T13500C G14569A (A16309G) A16318t | AY714004 | Palanichamy 2004, Achilli 2005, Metspalu 2006, Brisighelli 2009 ("U7a") | |||||||||||||||
| U7a | C151T | EF556179 | ||||||||||||||||
| U7a1 | A270G C5486T T13281C C16167T | AY714014 | AY714013 | Brisighelli 2009 | ||||||||||||||
| U7a2 | T4502C | FJ858878 | EU597503 | |||||||||||||||
| U7a3 | G12618A | GU327373 | JQ705966 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| U7a4 | T146C! T16126C | HM852823 | HM852777 | |||||||||||||||
| U7a5 | 573.XC G9300A A13966G C14245T G14869c C16291T T16304C | JQ703913 | JQ703978 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| U7b | T10084C | JQ705198 | GQ176284 | Brisighelli 2009 ("U7a2"), Behar 2012b | ||||||||||||||
| U7b1 | A13395G T16271C | EU445683 | EU445684 | Brisighelli 2009 ("U7a2a") | ||||||||||||||
| U8 | T9698C | Achilli 2005, González 2006 | ||||||||||||||||
| U8a | T282C T6392C C6455T A7055G C9365T G13145A | JQ702759 | González 2006, Behar 2012b | |||||||||||||||
| U8a1 | C3738T | JQ611709 | ||||||||||||||||
| U8a1a | A5240G C10733T (A16146G) T16342C | DQ200802 | González 2006 ("U8a1") | |||||||||||||||
| U8a1a1 | C12135a | JQ705347 | AY882392 | Achilli 2005 ("U8a"), González 2006 (""), Behar 2012b | ||||||||||||||
| U8a1a1a | A4129G | HM765458 | GU299344 | González 2006 ("") | ||||||||||||||
| U8a1a1b | A9338G G9777A | HQ022823 | HM008694 | |||||||||||||||
| U8a1a2 | T11465C | JQ702761 | HM113490 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| U8a1a3 | G1503A G7340A | JX297480 | HQ336423 | |||||||||||||||
| U8a2 | T195C! A827G T1700C | DQ200801 | HQ384210 | |||||||||||||||
| U8b | A3480G G9055A C14167T | |||||||||||||||||
| U8b1 | T195C! T16189C! C16234T | |||||||||||||||||
| U8b1a | C6546T A6599G G12771A | DQ200805 | ||||||||||||||||
| U8b1a1 | G9948A G11914A! G16129A! | HM590366 | AY882393 | Achilli 2005 ("U8b") | ||||||||||||||
| U8b1b | G1811A! C5165T T16324C | JQ705831 | Behar 2012b | |||||||||||||||
| U8b1b1 | A14053G T16094C | GQ360037 | HM050402 | |||||||||||||||
| K | A10550G T11299C T14798C T16224C T16311C! | Achilli 2005, Behar 2006 | ||||||||||||||||
| K1 | T1189C A10398G! | Achilli 2005, Behar 2006 | ||||||||||||||||
| K1a | C497T | JQ706038 | HM043706 | Achilli 2005, Behar 2006, Behar 2012b | ||||||||||||||
| K1a1 | (C114T) G11914A! (T16093C) | González 2006, Behar 2006 | ||||||||||||||||
| K1a1a | T3552C | JQ705483 | JQ702802 | Behar 2006, Behar 2012b | ||||||||||||||
| K1a1a1 | G9801A | FJ348183 | GU722598 | |||||||||||||||
| K1a1a2 | A15799G | JQ704696 | Behar 2012b | |||||||||||||||
| K1a1a2a | A6060G 8276.1C | GU980957 | ||||||||||||||||
| K1a1a2a1 | G4959A | AY495257 | JQ705393 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| K1a1b | A15924G | JN048471 | Behar 2006 | |||||||||||||||
| K1a1b1 | A11470G | DQ200804 | Behar 2006, Behar 2012b | |||||||||||||||
| K1a1b1a | A10978G T12954C C16234T | DQ301795 | HM101136 | Behar 2006, Grzybowski 2007 | ||||||||||||||
| K1a1b1b | T593C T2483C | JQ702898 | Behar 2006 (""), Behar 2012b | |||||||||||||||
| K1a1b1b1 | T789C A11620G | JQ704983 | AY339554 | |||||||||||||||
| K1a1b1c | G5585A C16222T | GU592026 | HE576978 | |||||||||||||||
| K1a1b1d | A14388G T16092C C16223T! | JQ702782 | JQ704096 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| K1a1b1e | G9932A | JQ704056 | JQ704207 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| K1a1b1f | T4823C C6528T A8842c | JQ703737 | JX048065 | |||||||||||||||
| K1a1b1g | C5583T G12007A | FJ348218 | JQ668027 | |||||||||||||||
| K1a1b2 | T13326C | |||||||||||||||||
| K1a1b2a | T152C! A7729G T9800C | AY714044 | ||||||||||||||||
| K1a1b2a1 | T3777C A15758G | HQ586011 | ||||||||||||||||
| K1a1b2a1a | T7278C | HQ413154 | JQ701858 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| K1a1b2b | A189G C10202T | FJ865502 | JQ702624 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| K1a1c | G709A T1694C T16362C C16400T | JQ705454 | JQ705697 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| K1a2 | T11025C | HM065508 | JQ703309 | Behar 2006, Behar 2012b | ||||||||||||||
| K1a2a | G5773A | JQ703581 | JQ703026 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| K1a2a1 | C4748T G13368A T16189C! | JQ702748 | JQ701856 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| K1a2b | T8005C | HM041971 | JQ704017 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| K1a2c | T4216C G7775A | JQ702306 | JQ703037 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| K1a3 | A13117G | AY495264 | JQ703347 | Behar 2006, Behar 2012b | ||||||||||||||
| K1a3a | A7559G | JQ705485 | EU344156 | Behar 2006, Behar 2012b | ||||||||||||||
| T16093C | HM598686 | JQ703528 | Behar 2012b | |||||||||||||||
| K1a3a1 | A8440G | JQ703648 | JQ703096 | Behar 2006, Behar 2012b | ||||||||||||||
| K1a3a1a | G9548A C10697T T14530C | DQ301814 | Behar 2006 | |||||||||||||||
| K1a3a1b | C8522T | AY495258 | GU799583 | |||||||||||||||
| K1a3a2 | T5580C | JQ705957 | JQ702693 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| K1a3a4 | G6257A T14094C | HQ610202 | JQ703775 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| K1a3a3 | G13590A | JQ701962 | HQ839861 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| K1a4 | T11485C | AY495261 | EU219921 | Behar 2006 | ||||||||||||||
| K1a4a | G6260A | EU603401 | JQ702521 | Behar 2006, Behar 2012b | ||||||||||||||
| K1a4a1 | C11840T T13740C | AY495262 | JN001930 | Behar 2006, Behar 2012b | ||||||||||||||
| K1a4a1a | A4295G G15884A | JQ702175 | Behar 2006 (""), Behar 2012b | |||||||||||||||
| T195C! | JQ702213 | JQ703444 | Behar 2012b | |||||||||||||||
| K1a4a1a1 | C3867T | JQ702811 | JQ702773 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| K1a4a1a3 | G5177A | GU122978 | JN122621 | |||||||||||||||
| K1a4a1a2 | C16245T | JQ703168 | Behar 2012b | |||||||||||||||
| K1a4a1a2a | A9377G | JN559854 | HM031133 | |||||||||||||||
| K1a4a1a2b | T146C! T13401C | JQ702896 | JQ701810 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| K1a4a1b | A8098G | JQ703407 | Behar 2012b | |||||||||||||||
| K1a4a1b1 | G8856c | GU191795 | EU677385 | |||||||||||||||
| K1a4a1b2 | G1811A! C16261T | JQ703171 | JQ704948 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| K1a4a1c | T199C A13413G | JQ705215 | EU692798 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| K1a4a1d | T3394C | JQ705404 | JQ705558 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| K1a4a1e | T152C! C16311T!! | JQ702341 | JQ704526 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| K1a4a1f | T152C! C325T A10029G | JQ705816 | Behar 2012b | |||||||||||||||
| K1a4a1f1 | T217C T5774C | JQ702302 | JQ702760 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| K1a4a1g | A8149G C16287T | JQ704759 | JX048671 | |||||||||||||||
| K1a4b | C280g A9448G | EU675299 | ||||||||||||||||
| K1a4b1 | T6975C A7388G C8410T A13105G! | EU600366 | DQ112930 | Behar 2006 ("K1a4b") | ||||||||||||||
| K1a4c | T152C! A12612G A13827G | DQ301809 | Behar 2006 | |||||||||||||||
| K1a4c1 | C5264T A13710G A16246t | JQ703523 | HQ538515 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| K1a4d | A723c C11071T G15355A (T16093C) | EU926621 | JF710373 | |||||||||||||||
| K1a4e | A942G | JQ704761 | EF657295 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| K1a4f | A7118G T16093C | GU722601 | ||||||||||||||||
| K1a4f1 | A12017G | JQ704764 | EF177416 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| K1a5 | C4640T T9647C T16362C | DQ301793 | EU600367 | Behar 2006 | ||||||||||||||
| K1a6 | C8703T G8790A T10454C C16527T | EU600369 | Behar 2006 | |||||||||||||||
| K1a7 | C431a | DQ301807 | JQ706029 | Behar 2006, Behar 2012b | ||||||||||||||
| K1a8 | C295a | JQ702902 | Behar 2012b | |||||||||||||||
| K1a8a | C7927g C16234T | DQ301817 | Behar 2006 ("K1a8") | |||||||||||||||
| K1a8a1 | T15850g | DQ301816 | DQ301818 | Behar 2006 ("") | ||||||||||||||
| K1a8b | A11818G A16497G | FJ460551 | JQ706043 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| T195C! | FJ348175 | GU471244 | Behar 2006 | |||||||||||||||
| K1a9 | A16524G | GU295448 | JQ704228 | Behar 2006, Behar 2012b | ||||||||||||||
| K1a10 | G16048A | JQ702740 | Hurst 2007, Behar 2012b | |||||||||||||||
| K1a10a | C16291T | JX535003 | HM054058 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| K1a13 | T146C! G1709A A9545G | JQ702796 | Behar 2012b | |||||||||||||||
| K1a13a | T8870C | GU944475 | JN202723 | |||||||||||||||
| K1a14 | G8020A T9977C C15626T | GU471243 | HQ675035 | Seoane 2011 | ||||||||||||||
| K1a15 | G8155A | JQ703379 | JQ702674 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| K1a16 | T6367C | JQ703365 | JQ702271 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| K1a26 | G4113A T16093C | AY882395 | GU811147 | |||||||||||||||
| C150T | HM625695 | JN202911 | ||||||||||||||||
| K1a11 | A16t T199C 8281-8289d T9938C G16129A! | JX193906 | JQ705747 | Hurst 2007, Behar 2012b | ||||||||||||||
| K1a11a | T152C! T10966C | JN657206 | JQ703607 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| K1a11a1 | C8702T | JQ705336 | JX679248 | |||||||||||||||
| K1a11b | A14605t | EU523125 | EU603402 | |||||||||||||||
| K1a24 | C15625a | JQ703891 | Behar 2012b | |||||||||||||||
| K1a24a | T195C! T5964C A15791G G16145A | JQ702717 | JF489152 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| K1a12 | G5460A | JQ703323 | Behar 2012b | |||||||||||||||
| K1a12a | A11923G | EU600362 | JQ703711 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| K1a12a1 | A6284G | JQ706035 | Behar 2012b | |||||||||||||||
| K1a12a1a | C11497T | JQ706066 | JQ706065 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| K1a17 | G247A! T4561C T15670C | JQ706034 | Behar 2012b | |||||||||||||||
| K1a17a | G1719A C16260T | JQ706064 | EU600361 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| K1a18 | T6680C A6881G | JQ706048 | EU600365 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| K1a19 | T12338C | JQ308836 | JQ706040 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| K1a20 | T63C C64T T8277C T11878C T12134C A12397G C15031T T16093C C16187T! | JQ706063 | JQ706039 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| K1a21 | A153G T408a T6407C T9428C T11017C T16093C | HQ637410 | JQ706059 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| K1a23 | T5093C | JQ703522 | JQ706042 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| K1a25 | T152C! A4158G T14308C | HM625696 | JQ706051 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| K1a27 | A7202G C16176T | JN415475 | JQ705460 | |||||||||||||||
| K1b | G5913A | Behar 2006 | ||||||||||||||||
| K1b1 | G9962A A10289G C15946T | Behar 2006 | ||||||||||||||||
| K1b1a | T152C! A11923G G15257A G16319A A16463G | |||||||||||||||||
| K1b1a1 | C13967T | GU797785 | Behar 2006 ("K1b1a") | |||||||||||||||
| T199C | ||||||||||||||||||
| K1b1a1a | T4646C | JQ702168 | JQ702919 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| K1b1a1b | T14308C (T16189C) | JQ702752 | EF657385 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| K1b1a1c | G3834A A4775G | EU239477 | GU361772 | |||||||||||||||
| K1b1a2 | T195C! T8260C C9371T C15381T T16093C A16318t | EU714300 | EF177415 | |||||||||||||||
| K1b1b | C6053T C8164T T16093C | AY495260 | DQ301800 | Behar 2006 | ||||||||||||||
| K1b1c | G94A G3337A G11914A! | EU600370 | GU455378 | Behar 2006 | ||||||||||||||
| K1b2 | T146C! T195C! T12738g | Behar 2006 | ||||||||||||||||
| K1b2a | G12771A | JQ705467 | EU621708 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| K1b2a1 | G13759A | HQ000094 | FJ348210 | |||||||||||||||
| K1b2a1a | C12019T | JQ705289 | Behar 2012b | |||||||||||||||
| K1b2a1a1 | A16524G | JQ705519 | JQ702926 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| K1b2a2 | G7521A! | JQ705044 | EU372659 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| K1b2a2a | A14687G | EU849091 | JQ702636 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| K1b2b | G5237A C6845T A10154G G15301A!! | EF428259 | HM775970 | |||||||||||||||
| K1c | T146C! T152C! C498d | Behar 2006 | ||||||||||||||||
| K1c1 | A9093G G11377A | GU936958 | GU722602 | Achilli 2005 ("K1c"), Behar 2006 | ||||||||||||||
| K1c1a | C7082T | HM851442 | AY882394 | |||||||||||||||
| K1c1b | T15900C | AY495250 | AY495243 | Behar 2006 | ||||||||||||||
| K1c1c | T9903C | JQ703860 | EU262720 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| K1c1d | G1442A A3720G T13602C | JQ703292 | JF819714 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| K1c1e | T16368C | GU123011 | JQ702901 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| K1c1f | C10698T | JQ703815 | HQ398201 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| K1c2 | A9006G A14002G G14040A C16320T | JN620369 | JQ702129 | Behar 2006, Behar 2012b | ||||||||||||||
| K1c2a | T15944d | GU323604 | DQ830736 | |||||||||||||||
| T16362C | Endicott 2009 | |||||||||||||||||
| K1d | T195C! 573.XC T4856C A5592G A8901G | JQ704724 | JQ702883 | Endicott 2009, Behar 2012b | ||||||||||||||
| K1e | T152C! T1819C G8251A C10478T C14142g | JX293716 | Behar 2012b | |||||||||||||||
| K1e1 | C151T T6413C T16189a G16274A | EU073969 | JQ705063 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| K1f | C3513T C8137T | EU810403 | Ermini 2008 ("K1ö") | |||||||||||||||
| K2 | T146C! T9716C | Behar 2006 | ||||||||||||||||
| K2a | T152C! G709A T4561C | AY495241 | EU884127 | Behar 2006 | ||||||||||||||
| K2a1 | A7930G A15325G A15652G | JQ665461 | Behar 2006 | |||||||||||||||
| K2a1a | C11881T C16311T!! | DQ301815 | Behar 2006 | |||||||||||||||
| K2a2 | G8697A | AY495246 | Behar 2006 | |||||||||||||||
| K2a2a | C11348T | HQ154135 | ||||||||||||||||
| K2a2a1 | A512c A9254G G11914A! | EU327986 | JQ703629 | Behar 2006 ("K2a2a"), Behar 2012b | ||||||||||||||
| K2a3 | C13293T | JQ704707 | HM103361 | Behar 2006, Behar 2012b | ||||||||||||||
| K2a3a | G12795A | JQ703540 | Behar 2012b | |||||||||||||||
| K2a3a1 | G13708A | AY495249 | HM625707 | |||||||||||||||
| K2a4 | C11549T | AY495242 | JQ705156 | Behar 2006, Behar 2012b | ||||||||||||||
| K2a5 | C324T | EU597528 | JQ703018 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| K2a5a | G15803A | JQ704076 | Behar 2012b | |||||||||||||||
| K2a5a1 | A11491G A16235G | EU718789 | JQ704843 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| K2a6 | G14305A | AY495239 | HQ213857 | |||||||||||||||
| K2a7 | C12346T | JQ702380 | EU284177 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| K2a8 | G207A T16189C! | DQ282493 | DQ282503 | |||||||||||||||
| K2a9 | T5081C T5130C | DQ112812 | JQ702282 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| K2a10 | A11923G | JQ703553 | JQ702134 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| K2b | C2217T G5231A C11869a A14037G | JQ704070 | Behar 2012b | |||||||||||||||
| K2b1 | G13135A | EU294321 | JF497777 | Behar 2006 ("K2b") | ||||||||||||||
| K2b1a | C16270T | JQ705092 | JQ703767 | Behar 2006 (""), Behar 2012b | ||||||||||||||
| K2b1a1 | C16222T | JN409346 | EU770310 | Behar 2006 ("") | ||||||||||||||
| K2b2 | G5054A G11016A G12501A G16129A! | JQ704064 | JQ704900 | Behar 2012b | ||||||||||||||
| K2c | A4976G G7912A G9053A A10262G A11015G C11041a A11172G C16192T A16210G | DQ301796 | Behar 2006 | |||||||||||||||
| K3 | C150T T195C! A235G C560T T7657C A8188G A9852t T14212C T16093C C16148T G16153A | NA18539 | HM852886 | |||||||||||||||